接种褐环乳牛肝菌对油松和樟子松根际土壤微生物多样性的影响
| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4-5页 |
| 1 引言 | 第9-16页 |
| 1.1 土壤微生物多样性研究进展 | 第9-12页 |
| 1.1.1 传统平板培养法 | 第10页 |
| 1.1.2 生物化学方法 | 第10页 |
| 1.1.3 传统分子生物学方法 | 第10-11页 |
| 1.1.4 现代分子生物学方法 | 第11-12页 |
| 1.2 菌根的概述 | 第12-14页 |
| 1.2.1 菌根营养学 | 第12页 |
| 1.2.2 菌根生态学 | 第12-13页 |
| 1.2.3 分子生物学在菌根学中的应用 | 第13页 |
| 1.2.4 外生菌根简介 | 第13页 |
| 1.2.5 菌根技术对油松和樟子松的影响 | 第13-14页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第14-15页 |
| 1.4 技术路线 | 第15-16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-22页 |
| 2.1 采样地点概述 | 第16页 |
| 2.2 样品收集 | 第16-17页 |
| 2.2.1 样品的采集 | 第16页 |
| 2.2.2 样品的处理 | 第16-17页 |
| 2.3 实验方法 | 第17-22页 |
| 2.3.1 土壤微生物各类指标的测定方法 | 第17页 |
| 2.3.2 土壤样本总DNA的提取方法 | 第17页 |
| 2.3.3 BiologECO板系统 | 第17页 |
| 2.3.4 MiSeq测序实验流程 | 第17-18页 |
| 2.3.5 生物信息分析流程 | 第18-22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-52页 |
| 3.1 土壤理化指标 | 第22页 |
| 3.2 土壤微生物群落代谢功能 | 第22-24页 |
| 3.2.1 Biolog群落代谢功能 | 第22-23页 |
| 3.2.2 土壤微生物功能多样性 | 第23-24页 |
| 3.2.3 土壤微生物C源利用情况 | 第24页 |
| 3.3 土壤细菌群落结构 | 第24-30页 |
| 3.3.1 测序样本的质量检测 | 第24-25页 |
| 3.3.2 土壤细菌OTU数目和测序统计 | 第25页 |
| 3.3.3 土壤细菌主要群落结构组成 | 第25-28页 |
| 3.3.4 土壤细菌多样本相似度树状图 | 第28-29页 |
| 3.3.5 土壤细菌CCA分析 | 第29-30页 |
| 3.4 土壤真菌群落结构 | 第30-39页 |
| 3.4.1 土壤真菌OTU数目和测序统计 | 第30页 |
| 3.4.2 土壤真菌OTU丰度排秩分析 | 第30-31页 |
| 3.4.3 土壤真菌OTU分布的Venn图 | 第31-32页 |
| 3.4.4 土壤真菌主要群落结构组成 | 第32-35页 |
| 3.4.5 土壤真菌多样性 | 第35-37页 |
| 3.4.6 土壤真菌LefSe分析 | 第37-38页 |
| 3.4.7 土壤真菌CCA分析 | 第38-39页 |
| 3.5 油松和樟子松外生菌根(ECM)真菌 | 第39-52页 |
| 3.5.1 ECM真菌OTU数目和测序统计 | 第40-41页 |
| 3.5.2 ECM真菌OTU分布的Venn图 | 第41页 |
| 3.5.3 ECM真菌门和属水平群落组成 | 第41-43页 |
| 3.5.4 ECM真菌物种分类树 | 第43-44页 |
| 3.5.5 ECM真菌的LefSe分析 | 第44-45页 |
| 3.5.6 ECM真菌样品聚类树 | 第45-46页 |
| 3.5.7 ECM真菌多样性 | 第46-48页 |
| 3.5.8 ECM真菌组间群落结构差异显著性检验 | 第48-51页 |
| 3.5.9 ECM真菌CCA分析 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-56页 |
| 4.1 土壤细菌群落代谢功能 | 第52页 |
| 4.2 土壤细菌群落结构 | 第52-53页 |
| 4.3 土壤真菌群落多样性 | 第53-54页 |
| 4.4 ECM真菌群落多样性 | 第54-56页 |
| 5 结论 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 个人简介 | 第64页 |
