摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
英文缩略表 | 第8-14页 |
第一章 绪论 | 第14-34页 |
1.1 花生简介 | 第14-16页 |
1.1.1 花生的分类和起源 | 第14页 |
1.1.2 花生的国内外发展现状 | 第14-15页 |
1.1.3 花生的营养价值及主要用途 | 第15-16页 |
1.2 遗传标记类型 | 第16-23页 |
1.2.1 形态学标记 | 第16-17页 |
1.2.2 细胞学标记 | 第17页 |
1.2.3 生化标记 | 第17-18页 |
1.2.4 DNA分子标记 | 第18-23页 |
1.2.4.1 RFLP标记 | 第19页 |
1.2.4.2 RAPD标记 | 第19-20页 |
1.2.4.3 SSR标记 | 第20页 |
1.2.4.4 AFLP标记 | 第20-21页 |
1.2.4.5 SNP标记 | 第21页 |
1.2.4.6 SRAP标记 | 第21-22页 |
1.2.4.7 MITE标记 | 第22-23页 |
1.3 SNP标记的开发 | 第23-24页 |
1.3.1 SNP标记的开发流程 | 第23页 |
1.3.2 SNP开发软件 | 第23-24页 |
1.4 SNP标记的分型方法 | 第24-28页 |
1.4.1 直接测序法 | 第24页 |
1.4.2 基于DNA构象的分型方法 | 第24-26页 |
1.4.2.1 变性梯度凝胶电泳法(DGGE) | 第25页 |
1.4.2.2 单链构象多态性法(SSCP) | 第25页 |
1.4.2.3 温度梯度凝胶电泳法(TGGE) | 第25页 |
1.4.2.4 变性高效液相色谱法(DHPLC) | 第25-26页 |
1.4.3 基于PCR技术及酶切技术的分型方法 | 第26-27页 |
1.4.3.1 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP) | 第26页 |
1.4.3.2 等位基因特异性PCR(AS-PCR) | 第26页 |
1.4.3.3 高分辨熔解曲线(HRM) | 第26-27页 |
1.4.4 基于杂交的分型方法 | 第27-28页 |
1.4.4.1 TaqMan探针法 | 第27页 |
1.4.4.2 基因芯片法(Gene chip) | 第27-28页 |
1.4.5 质谱检测法 | 第28页 |
1.5 SNP标记的应用 | 第28-29页 |
1.5.1 构建遗传连锁图谱 | 第28页 |
1.5.2 连锁不平衡和关联分析 | 第28-29页 |
1.5.3 种群进化和群体遗传多样性分析 | 第29页 |
1.6 遗传连锁图谱的构建 | 第29-32页 |
1.6.1 遗传连锁图谱构建的过程 | 第29-31页 |
1.6.1.1 构建作图群体 | 第30页 |
1.6.1.2 分子标记的选择 | 第30-31页 |
1.6.1.3 连锁分析及图谱的构建 | 第31页 |
1.6.2 花生遗传图谱构建的研究进展 | 第31-32页 |
1.7 本研究的目的意义 | 第32-34页 |
第二章 材料和方法 | 第34-41页 |
2.1 实验材料 | 第34-35页 |
2.1.1 亲本及混合池DNA | 第34页 |
2.1.2 实验所用分子标记 | 第34页 |
2.1.3 实验所用药品和器材 | 第34-35页 |
2.2 实验方法 | 第35-40页 |
2.2.1 花生基因组DNA的提取 | 第35页 |
2.2.2 DNA浓度的检测 | 第35-36页 |
2.2.3 SNP的开发及分型 | 第36-37页 |
2.2.3.1 PCR扩增反应及SAP反应 | 第36-37页 |
2.2.3.2 延伸反应 | 第37页 |
2.2.3.3 质谱检测及分型 | 第37页 |
2.2.4 其他标记PCR反应体系与反应程序 | 第37-38页 |
2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳 | 第38-40页 |
2.2.5.1 聚丙烯酰胺凝胶试剂的配制 | 第38-39页 |
2.2.5.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳 | 第39页 |
2.2.5.3 变性聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳 | 第39-40页 |
2.2.5.4 染色方法 | 第40页 |
2.2.5.5 拍照与保存 | 第40页 |
2.3 图谱构建及偏分离分析 | 第40-41页 |
2.3.1 带型统计 | 第40页 |
2.3.2 图谱构建 | 第40页 |
2.3.3 偏分离分析 | 第40-41页 |
第三章 结果与分析 | 第41-49页 |
3.1 SNP分子标记的开发及分型 | 第41-42页 |
3.1.1 SNP的开发结果 | 第41-42页 |
3.1.2 SNP的分型结果 | 第42页 |
3.2 其他标记的多态性筛选 | 第42-45页 |
3.2.1 多态性标记的筛选 | 第42-44页 |
3.2.2 作图群体的多态性检测 | 第44-45页 |
3.3 遗传连锁图谱的构建及偏分离分析 | 第45-49页 |
3.3.1 构建遗传连锁图谱 | 第45-47页 |
3.3.2 偏分离分析 | 第47-49页 |
第四章 讨论 | 第49-52页 |
4.1 花生SNP标记的鉴别 | 第49页 |
4.2 关于初筛与复筛的引物数量差 | 第49-50页 |
4.3 关于各类引物的优劣 | 第50页 |
4.4 关于花生分子遗传连锁图谱 | 第50-51页 |
4.5 关于分子标记偏分离 | 第51-52页 |
第五章 结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
个人简介 | 第59页 |