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花生SNP分子标记的开发及应用

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
英文缩略表第8-14页
第一章 绪论第14-34页
    1.1 花生简介第14-16页
        1.1.1 花生的分类和起源第14页
        1.1.2 花生的国内外发展现状第14-15页
        1.1.3 花生的营养价值及主要用途第15-16页
    1.2 遗传标记类型第16-23页
        1.2.1 形态学标记第16-17页
        1.2.2 细胞学标记第17页
        1.2.3 生化标记第17-18页
        1.2.4 DNA分子标记第18-23页
            1.2.4.1 RFLP标记第19页
            1.2.4.2 RAPD标记第19-20页
            1.2.4.3 SSR标记第20页
            1.2.4.4 AFLP标记第20-21页
            1.2.4.5 SNP标记第21页
            1.2.4.6 SRAP标记第21-22页
            1.2.4.7 MITE标记第22-23页
    1.3 SNP标记的开发第23-24页
        1.3.1 SNP标记的开发流程第23页
        1.3.2 SNP开发软件第23-24页
    1.4 SNP标记的分型方法第24-28页
        1.4.1 直接测序法第24页
        1.4.2 基于DNA构象的分型方法第24-26页
            1.4.2.1 变性梯度凝胶电泳法(DGGE)第25页
            1.4.2.2 单链构象多态性法(SSCP)第25页
            1.4.2.3 温度梯度凝胶电泳法(TGGE)第25页
            1.4.2.4 变性高效液相色谱法(DHPLC)第25-26页
        1.4.3 基于PCR技术及酶切技术的分型方法第26-27页
            1.4.3.1 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)第26页
            1.4.3.2 等位基因特异性PCR(AS-PCR)第26页
            1.4.3.3 高分辨熔解曲线(HRM)第26-27页
        1.4.4 基于杂交的分型方法第27-28页
            1.4.4.1 TaqMan探针法第27页
            1.4.4.2 基因芯片法(Gene chip)第27-28页
        1.4.5 质谱检测法第28页
    1.5 SNP标记的应用第28-29页
        1.5.1 构建遗传连锁图谱第28页
        1.5.2 连锁不平衡和关联分析第28-29页
        1.5.3 种群进化和群体遗传多样性分析第29页
    1.6 遗传连锁图谱的构建第29-32页
        1.6.1 遗传连锁图谱构建的过程第29-31页
            1.6.1.1 构建作图群体第30页
            1.6.1.2 分子标记的选择第30-31页
            1.6.1.3 连锁分析及图谱的构建第31页
        1.6.2 花生遗传图谱构建的研究进展第31-32页
    1.7 本研究的目的意义第32-34页
第二章 材料和方法第34-41页
    2.1 实验材料第34-35页
        2.1.1 亲本及混合池DNA第34页
        2.1.2 实验所用分子标记第34页
        2.1.3 实验所用药品和器材第34-35页
    2.2 实验方法第35-40页
        2.2.1 花生基因组DNA的提取第35页
        2.2.2 DNA浓度的检测第35-36页
        2.2.3 SNP的开发及分型第36-37页
            2.2.3.1 PCR扩增反应及SAP反应第36-37页
            2.2.3.2 延伸反应第37页
            2.2.3.3 质谱检测及分型第37页
        2.2.4 其他标记PCR反应体系与反应程序第37-38页
        2.2.5 聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳第38-40页
            2.2.5.1 聚丙烯酰胺凝胶试剂的配制第38-39页
            2.2.5.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳第39页
            2.2.5.3 变性聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳第39-40页
            2.2.5.4 染色方法第40页
            2.2.5.5 拍照与保存第40页
    2.3 图谱构建及偏分离分析第40-41页
        2.3.1 带型统计第40页
        2.3.2 图谱构建第40页
        2.3.3 偏分离分析第40-41页
第三章 结果与分析第41-49页
    3.1 SNP分子标记的开发及分型第41-42页
        3.1.1 SNP的开发结果第41-42页
        3.1.2 SNP的分型结果第42页
    3.2 其他标记的多态性筛选第42-45页
        3.2.1 多态性标记的筛选第42-44页
        3.2.2 作图群体的多态性检测第44-45页
    3.3 遗传连锁图谱的构建及偏分离分析第45-49页
        3.3.1 构建遗传连锁图谱第45-47页
        3.3.2 偏分离分析第47-49页
第四章 讨论第49-52页
    4.1 花生SNP标记的鉴别第49页
    4.2 关于初筛与复筛的引物数量差第49-50页
    4.3 关于各类引物的优劣第50页
    4.4 关于花生分子遗传连锁图谱第50-51页
    4.5 关于分子标记偏分离第51-52页
第五章 结论第52-53页
参考文献第53-58页
致谢第58-59页
个人简介第59页

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