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不同固沙群落土壤结皮层酶活性及微生物nifH、amoA、nosZ基因多样性研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
目录第8-11页
第1章 绪论第11-26页
    1.1 生物结皮研究概况第11-13页
        1.1.1 生物结皮的形成及其演替研究进展第11-12页
        1.1.2 生物结皮中土壤微生物研究进展第12-13页
    1.2 土壤氮循环功能群和功能基因多样性研究进展第13-17页
        1.2.1 固氮作用中的微生物功能群和功能基因第14-15页
        1.2.2 硝化作用中的微生物功能群和功能基因第15-16页
        1.2.3 反硝化作用中的微生物功能群和功能基因第16-17页
    1.3 基于聚合酶链式反应的现代土壤微生物多样性研究方法第17-25页
        1.3.1 随机扩增的多态性DNA分析(RAPD)第18-19页
        1.3.2 限制性片段长度多态性分析(RFLP)/扩增性限制性酶切片段分析(ARDRA)第19-20页
        1.3.3 末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)第20-21页
        1.3.4 单链构象多态性分析(SSCP)第21-22页
        1.3.5 变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)第22-25页
    1.4 本研究的背景及意义第25-26页
第2章 研究地区概况与研究方法第26-40页
    2.1 研究区域及人工固沙群落概况第26-28页
    2.2 研究内容及技术路线第28页
    2.3 样品采集及研究方法第28-40页
        2.3.1 土壤样品的采集第28-29页
        2.3.2 土壤养分的测定第29-30页
        2.3.3 土壤酶活性的测定第30-31页
        2.3.4 土壤微生物nifH、amoA、nosZ基因多样性第31-37页
        2.3.5 主要条带的克隆测序第37-40页
第3章 结果与分析第40-72页
    3.1 不同样品中土壤养分含量和酶活性第40-46页
        3.1.1 土壤养分的变化第40-41页
        3.1.2 土壤酶活性的变化第41-44页
        3.1.3 讨论第44-46页
    3.2 总DNA的提取和纯化第46-47页
    3.3 微生物nifH、amoA、nosZ基因的PCR扩增第47-48页
    3.4 固氮基因(nifH)PCR扩增产物的DGGE分离第48-54页
        3.4.1 DGGE图谱分析第49-50页
        3.4.2 多样性指数、均匀度指数和优势度指数第50-52页
        3.4.3 聚类分析第52-53页
        3.4.4 典型对应分析第53-54页
    3.5 氨氧化基因(amoA)PCR扩增产物的DGGE分离第54-60页
        3.5.1 DGGE图谱分析第55-56页
        3.5.2 多样性指数、均匀度指数和优势度指数第56-57页
        3.5.3 聚类分析第57-59页
        3.5.4 典型对应分析第59-60页
    3.6 反硝化化基因(nosZ)PCR扩增产物的DGGE分离第60-65页
        3.6.1 DGGE图谱分析第60-61页
        3.6.2 多样性指数、均匀度指数和优势度指数第61-62页
        3.6.3 聚类分析第62-63页
        3.6.4 典型对应分析第63-65页
    3.7 主要功能基因条带的克隆测序及系统进化分析第65-72页
        3.7.1 克隆测序及菌种鉴定第65-67页
        3.7.2 优势菌种系统进化树的建立第67-71页
        3.7.3 讨论第71-72页
第4章 结论第72-73页
参考文献第73-83页
致谢第83-85页
硕士期间发表的论文目录第85页

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