| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 常用缩写词 | 第6-12页 |
| 1 前言 | 第12-20页 |
| 1.1 黄颡鱼 | 第12-13页 |
| 1.1.1 黄颡鱼的概述 | 第12页 |
| 1.1.2 黄颡鱼遗传育种的研究现状 | 第12-13页 |
| 1.2 鱼类生长激素 | 第13-14页 |
| 1.2.1 生长激素的结构特征 | 第13页 |
| 1.2.2 生长激素的功能作用 | 第13-14页 |
| 1.2.2.1 促进生长的作用 | 第13-14页 |
| 1.2.2.2 促进代谢的作用 | 第14页 |
| 1.2.2.3 其他生理作用 | 第14页 |
| 1.3 鱼类GH基因克隆 | 第14-15页 |
| 1.4 DNA分子标记 | 第15-19页 |
| 1.4.1 限制性片段长度多态性 | 第15页 |
| 1.4.2 随机扩增多态性 | 第15-16页 |
| 1.4.3 扩增片段长度多态性 | 第16页 |
| 1.4.4 线粒体DNA | 第16页 |
| 1.4.5 单核苷酸多态性 | 第16-18页 |
| 1.4.5.1 SNPs的检测方法 | 第17页 |
| 1.4.5.2 SNPs的特点 | 第17页 |
| 1.4.5.3 SNPs在鱼类分子标记的应用 | 第17-18页 |
| 1.4.6 简单重复序列 | 第18-19页 |
| 1.4.6.1 SSR分类 | 第18页 |
| 1.4.6.2 SSR的特点 | 第18页 |
| 1.4.6.3 SSR在鱼类分子标记的应用 | 第18-19页 |
| 1.5 研究目的意义 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-35页 |
| 2.1 试验材料 | 第20-22页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第20页 |
| 2.1.2 质粒和菌株 | 第20页 |
| 2.1.3 试验仪器设备 | 第20-21页 |
| 2.1.4 试验主要试剂来源 | 第21页 |
| 2.1.5 试验主要试剂配制 | 第21-22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-34页 |
| 2.2.1 黄颡鱼总RNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.2.1.1 组织总RNA的提取 | 第22页 |
| 2.2.1.2 总RNA的质量检测 | 第22-23页 |
| 2.2.1.3 反转录PCR | 第23页 |
| 2.2.2 黄颡鱼基因组DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.3 GH基因内含子克隆 | 第24-27页 |
| 2.2.3.1 引物设计 | 第24页 |
| 2.2.3.2 PCR扩增 | 第24-25页 |
| 2.2.3.3 PCR产物回收纯化 | 第25-26页 |
| 2.2.3.4 PCR产物与载体连接 | 第26页 |
| 2.2.3.5 重组质粒DNA转化大肠杆菌 | 第26页 |
| 2.2.3.6 阳性克隆的PCR菌落鉴定 | 第26-27页 |
| 2.2.4 GH基因 5′UTR克隆 | 第27-28页 |
| 2.2.4.1 5′UTR 克隆的引物设计 | 第27页 |
| 2.2.4.2 PCR 扩增 | 第27-28页 |
| 2.2.5 黄颡鱼GH基因在各组织中的差异表达 | 第28-30页 |
| 2.2.5.1 引物设计 | 第28-29页 |
| 2.2.5.2 半实时荧光定量检测 | 第29页 |
| 2.2.5.3 实时荧光定量检测 | 第29-30页 |
| 2.2.5.4 荧光定量数据分析 | 第30页 |
| 2.2.6 GH基因单核苷酸多态性与主要生长性状的关联分析 | 第30-32页 |
| 2.2.6.1 设计引物及合成 | 第30-31页 |
| 2.2.6.2 SNPs位点的筛选 | 第31页 |
| 2.2.6.3 SNPs位点的PCR反应体系 | 第31-32页 |
| 2.2.6.4 SNPs的分型 | 第32页 |
| 2.2.7 GH基因微卫星多态性与主要生长性状的关联分析 | 第32-34页 |
| 2.2.7.1 微卫星位点的筛选及引物设计 | 第32页 |
| 2.2.7.2 荧光基团标记的选择 | 第32-33页 |
| 2.2.7.3 SSR分子标记的PCR反应体系 | 第33页 |
| 2.2.7.4 SSR的基因型判定 | 第33-34页 |
| 2.3 SNPs、SSRs数据分析 | 第34-35页 |
| 2.3.1 基因频率和基因型频率 | 第34页 |
| 2.3.2 遗传多态性分析 | 第34-35页 |
| 2.3.3 基因型与黄颡鱼生长性状的关联分析 | 第35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-51页 |
| 3.1 黄颡鱼各组织总RNA的获得 | 第35页 |
| 3.2 黄颡鱼基因组DNA的获得 | 第35-36页 |
| 3.3 黄颡鱼GH基因全长克隆 | 第36-38页 |
| 3.3.1 黄颡鱼GH基因内含子的扩增 | 第36-37页 |
| 3.3.2 黄颡鱼GH基因 5′端的扩增 | 第37页 |
| 3.3.3 GH基因结构分析 | 第37-38页 |
| 3.4 黄颡鱼GH基因在组织间的差异表达 | 第38-39页 |
| 3.4.1 半实时荧光定量 | 第38页 |
| 3.4.2 实时荧光定量 | 第38-39页 |
| 3.5 单核苷酸多态性与生长性状的关联分析 | 第39-44页 |
| 3.5.1 SNPs位点信息 | 第39页 |
| 3.5.2 SNPs的基因型及分布 | 第39-41页 |
| 3.5.3 哈迪－温伯格平衡检验 | 第41页 |
| 3.5.4 SNPs的遗传特性分析 | 第41页 |
| 3.5.5 SNPs多态性与生长性状的关联分析 | 第41-44页 |
| 3.6 微卫星多态性与生长性状的关联分析 | 第44-51页 |
| 3.6.1 4对荧光引物PCR产物的电泳结果图 | 第44-45页 |
| 3.6.2 SSRs分型检测结果 | 第45-46页 |
| 3.6.3 SSRs等位基因及分布 | 第46-47页 |
| 3.6.4 SSRs遗传特性分析 | 第47页 |
| 3.6.5 SSRs多态性与生长性状的关联分析 | 第47-51页 |
| 4 讨论 | 第51-59页 |
| 4.1 黄颡鱼GH基因的结构特征 | 第51-52页 |
| 4.2 黄颡鱼GH基因表达特点 | 第52-53页 |
| 4.3 黄颡鱼GH遗传多样性分析 | 第53-54页 |
| 4.4 SNP与生长性状的关联分析 | 第54-56页 |
| 4.5 SSR与生长性状的关联分析 | 第56-59页 |
| 5 结论 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |