东极贻贝养殖区表层海水中AAPB群落结构和多样性随季节变化的研究
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第14-23页 |
| 1.1 好氧不产氧光合异氧细菌的研究进展 | 第14-18页 |
| 1.1.1 AAPB的发现和分类 | 第14-15页 |
| 1.1.2 AAPB生长环境和生态分布 | 第15-18页 |
| 1.2 AAPB群落结构和遗传多样性的研究 | 第18-21页 |
| 1.2.1 AAPB群落结构研究 | 第18-19页 |
| 1.2.2 高通量测序技术的出现 | 第19-21页 |
| 1.3 本论文的研究内容及意义 | 第21-23页 |
| 第二章 海水样品的采集和理化性质分析 | 第23-28页 |
| 2.1 材料和方法 | 第23-25页 |
| 2.1.1 实验仪器与材料 | 第23页 |
| 2.1.2 样品采集方法和原位数据的采集 | 第23页 |
| 2.1.3 海水样品的预处理 | 第23-24页 |
| 2.1.4 海水样品水质分析 | 第24-25页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第25-26页 |
| 2.2.1 样品采集结果 | 第25-26页 |
| 2.2.2 样品理化检测结果 | 第26页 |
| 2.3 本章小结 | 第26-28页 |
| 第三章 高通量测序分析AAPB群落结构和 多样性 | 第28-53页 |
| 3.1 材料和方法 | 第28-34页 |
| 3.1.1 实验设备与材料 | 第28-29页 |
| 3.1.2 样品基因组DNA的提取 | 第29-31页 |
| 3.1.3 样品基因组DNA的检验 | 第31-32页 |
| 3.1.4 细菌基因组pufM的PCR扩增 | 第32页 |
| 3.1.5 TA克隆验证 | 第32-34页 |
| 3.1.6 样品的高通量测序 | 第34页 |
| 3.1.7 生物信息学分析 | 第34页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第34-51页 |
| 3.2.1 原始测序数据的预处理 | 第34-35页 |
| 3.2.2 OTU划分和OTU注释统计 | 第35-37页 |
| 3.2.3 Alpha多样性分析 | 第37-40页 |
| 3.2.4 物种分类分析 | 第40-43页 |
| 3.2.5 Beta多样性分析 | 第43-50页 |
| 3.2.6 多样性统计分析 | 第50-51页 |
| 3.3 本章小结 | 第51-53页 |
| 第四章 结论与展望 | 第53-57页 |
| 4.1 结论 | 第53-55页 |
| 4.2 展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第65页 |
