| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略词表（Abbreviation） | 第13-14页 |
| 1 前言 | 第14-27页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第14-15页 |
| 1.2 文献综述 | 第15-26页 |
| 1.2.1 PRRS的流行特点与危害 | 第15页 |
| 1.2.2 PRRS的临床症状及诊断 | 第15-16页 |
| 1.2.3 PRRSV的分子结构与理化性质 | 第16-17页 |
| 1.2.4 PRRSV的增殖、致病机理与免疫抑制 | 第17-18页 |
| 1.2.5 miRNA的发现及命名规则 | 第18页 |
| 1.2.6 miRNA的合成与作用机制 | 第18-20页 |
| 1.2.7 miRNAs的挖掘方法 | 第20-22页 |
| 1.2.8 miRNAs的表达检测和功能鉴定 | 第22-24页 |
| 1.2.9 基于宿主miRNAs的抗病毒研究 | 第24-25页 |
| 1.2.10 与PRRSV相关的mi RNA研究 | 第25-26页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-36页 |
| 2.1 试验材料 | 第27-29页 |
| 2.1.1 病毒、试验动物与样品 | 第27页 |
| 2.1.2 试剂和试剂盒 | 第27-28页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第28页 |
| 2.1.4 生物学数据库和网站 | 第28页 |
| 2.1.5 生物信息分析软件 | 第28-29页 |
| 2.2 方法 | 第29-36页 |
| 2.2.1 活体试验 | 第29页 |
| 2.2.2 猪肺泡巨噬细胞PAMs获取 | 第29-30页 |
| 2.2.3 肺脏组织石蜡切片准备 | 第30页 |
| 2.2.4 石蜡切片HE染色 | 第30-31页 |
| 2.2.5 免疫组化 | 第31-32页 |
| 2.2.6 总RNA提取 | 第32页 |
| 2.2.7 总RNA的质量检测 | 第32-33页 |
| 2.2.8 小RNA文库构建与测序 | 第33页 |
| 2.2.9 测序数据处理与分析 | 第33-34页 |
| 2.2.10 miRNAs的生物信息学分析 | 第34-36页 |
| 3 结果 | 第36-57页 |
| 3.1 试验猪的肺部大体病变 | 第36页 |
| 3.2 试验猪的肺组织病变 | 第36-38页 |
| 3.3 PRRSV在通城猪和大白猪肺脏中的分布情况 | 第38-41页 |
| 3.4 总RNA质量检测 | 第41-43页 |
| 3.5 文库质检结果 | 第43-44页 |
| 3.6 测序数据的质量 | 第44-45页 |
| 3.7 已知miRNA比对及差异表达miRNAs筛选 | 第45-46页 |
| 3.8 mi RNA靶基因预测及富集分析 | 第46-53页 |
| 3.8.1 宿主microRNA靶向宿主基因的靶点预测 | 第46页 |
| 3.8.2 靶基因Gene Ontology（GO）富集分析 | 第46-48页 |
| 3.8.3 靶基因KEGG富集分析 | 第48-52页 |
| 3.8.4 宿主 micro RNA 靶向 PRRSV 病毒基因组的靶点预测 | 第52-53页 |
| 3.9 差异表达mi RNAs与转录组数据的联合分析 | 第53-57页 |
| 4 讨论 | 第57-61页 |
| 4.1 关于本研究技术方法的讨论 | 第57-59页 |
| 4.1.1 免疫组化 | 第57-58页 |
| 4.1.2 small RNA测序的数据处理与分析 | 第58-59页 |
| 4.2 关于本研究结果的讨论 | 第59-61页 |
| 4.2.1 病理切片与免疫组化的结果 | 第59页 |
| 4.2.2 宿主与PRRSV互作相关的mi RNA靶基预测 | 第59-61页 |
| 5 小结 | 第61-63页 |
| 5.1 本研究的主要结论 | 第61页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第61-62页 |
| 5.3 本研究的不足与进一步工作的建议 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
