| 致谢 | 第10-17页 |
| 缩略术语词表 | 第17-19页 |
| 摘要 | 第19-21页 |
| Abstract | 第21-22页 |
| 第一章 文献综述 | 第23-49页 |
| 引言 | 第23-24页 |
| 1.1 脂肪酸以及脂肪酸的合成 | 第24-28页 |
| 1.2 脂肪酸的降解 | 第28-32页 |
| 1.3 温度对脂肪酸积累的调控 | 第32-35页 |
| 1.3.1 温度对脂肪酸代谢的分子调控机制 | 第33-34页 |
| 1.3.2 昼夜温差对油菜脂肪酸积累的影响 | 第34-35页 |
| 1.4 "新一代"测序技术在分子遗传学中的应用 | 第35-37页 |
| 1.5 SNP分子标记以及在甘蓝型油菜中的开发 | 第37-46页 |
| 1.5.1 SNP分子遗传标记 | 第38-39页 |
| 1.5.2 SNP的早期应用 | 第39-40页 |
| 1.5.3 高通量测序在SNP技术研究中的应用 | 第40-41页 |
| 1.5.4 甘蓝型油菜SNP标记的应用开发 | 第41-46页 |
| 1.6 本研究的目的及意义 | 第46-49页 |
| 第二章 油菜荚果成熟后期种子脂肪酸消减及其机制 | 第49-72页 |
| 2.1 前言 | 第49-50页 |
| 2.2 材料与方法 | 第50-59页 |
| 2.2.1 材料种植 | 第50页 |
| 2.2.2 种子脂肪酸含量的测定 | 第50-51页 |
| 2.2.3 样品上机测序流程 | 第51-53页 |
| 2.2.4 生物信息分析流程 | 第53-59页 |
| 2.3 结果与分析 | 第59-70页 |
| 2.3.1 不同基因型材料脂肪酸积累趋势 | 第59-60页 |
| 2.3.2 取样点reads质量检测 | 第60-61页 |
| 2.3.3 取样点clean reads在参考基因组中的区域分布 | 第61-63页 |
| 2.3.4 生物学重复分析 | 第63-65页 |
| 2.3.5 基因表达检测 | 第65-66页 |
| 2.3.6 样品间差异性表达基因 | 第66-67页 |
| 2.3.7 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第67-69页 |
| 2.3.8 β-氧化途径基因表达差异性分析(16-DAP vs 40-DAP) | 第69-70页 |
| 2.4 讨论 | 第70-72页 |
| 第三章 昼夜温差对油菜种子脂肪酸积累的影响 | 第72-100页 |
| 3.1 前言 | 第72-73页 |
| 3.2 材料与方法 | 第73-78页 |
| 3.2.1 材料种植 | 第73页 |
| 3.2.2 温度处理 | 第73-75页 |
| 3.2.3 种子脂肪酸含量的测定 | 第75页 |
| 3.2.4 种子取样以及总RNA的提取 | 第75页 |
| 3.2.5 RNA-seq基础数据分析 | 第75-76页 |
| 3.2.6 K-means聚类分析 | 第76页 |
| 3.2.7 KEGG富集分析 | 第76页 |
| 3.2.8 RT-qPCR鉴定 | 第76-77页 |
| 3.2.9 赤霉素田间喷施实验 | 第77-78页 |
| 3.3 结果与分析 | 第78-98页 |
| 3.3.1 昼夜温差对油菜脂肪酸积累的影响 | 第78-79页 |
| 3.3.2 各取样点Reads质量检测 | 第79-80页 |
| 3.3.3 样本之间差异表达基因 | 第80-82页 |
| 3.3.4 基因表达模式的聚类分析(K-means聚类分析) | 第82-84页 |
| 3.3.5 RT-qPCR验证油滴合成基因的表达模式 | 第84-85页 |
| 3.3.6 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第85-90页 |
| 3.3.7 昼夜温差对乙醛酸代谢途径的调控 | 第90-94页 |
| 3.3.8 昼夜温差对赤霉素信号传导途径的调控 | 第94-95页 |
| 3.3.9 赤霉素信号对脂肪酸积累的调控 | 第95-98页 |
| 3.4 讨论 | 第98-100页 |
| 第四章 BnaC.TT2.a等位多态变化与含油量的相关性 | 第100-118页 |
| 4.1 前言 | 第100-102页 |
| 4.2 材料与方法 | 第102-104页 |
| 4.2.1 种质材料的选择 | 第102页 |
| 4.2.2 种皮颜色以及种子脂肪酸的测定 | 第102页 |
| 4.2.3 群体结构的矫正 | 第102-103页 |
| 4.2.4 材料基因型的鉴定(以BnaC.TT2.a为基础) | 第103页 |
| 4.2.5 关联分析的实施 | 第103-104页 |
| 4.3 结果与分析 | 第104-115页 |
| 4.3.1 群体材料种皮颜色以及种子脂肪酸含量的分布 | 第104-106页 |
| 4.3.2 群体结构(Q)以及群体亚组表型统计 | 第106-109页 |
| 4.3.3 BnaC. TT2.a单碱基多态性以及种质材料单体型的鉴定 | 第109-111页 |
| 4.3.4 种质资源库中不同单体型的表型差异 | 第111-112页 |
| 4.3.5 候选基因BnaC.TT2.a中单碱基多态性(SNP/indel)之间的连锁不平衡分析 | 第112-114页 |
| 4.3.6 候选基因BnaC.TT2.a与表型之间的关联分析 | 第114-115页 |
| 4.4 讨论 | 第115-118页 |
| 第五章 结论和展望 | 第118-121页 |
| 5.1 结论 | 第118-119页 |
| 5.2 展望 | 第119-121页 |
| 参考文献 | 第121-134页 |
| 作者简历 | 第134页 |
