| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-11页 |
| 缩略词 | 第11-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-21页 |
| ·研究背景 | 第13页 |
| ·研究现状 | 第13-19页 |
| ·本文的主要内容和贡献 | 第19-20页 |
| ·论文组织结构 | 第20-21页 |
| 第二章 并行计算与生物信息学基础 | 第21-39页 |
| ·并行计算简介 | 第21页 |
| ·异构系统架构 | 第21-23页 |
| ·异构编程模型 | 第23-28页 |
| ·OpenCL简介 | 第23-24页 |
| ·OpenCL架构 | 第24-28页 |
| ·生物信息学概述 | 第28-29页 |
| ·蛋白质 | 第29-32页 |
| ·蛋白质概念及相关数据库简介 | 第29-30页 |
| ·蛋白质一级结构 | 第30-32页 |
| ·RNA | 第32-38页 |
| ·RNA概念及相关数据库简介 | 第32页 |
| ·RNA二级结构组成 | 第32-33页 |
| ·RNA二级结构图形化表示 | 第33-35页 |
| ·RNA二级结构相关定义 | 第35页 |
| ·RNA二级结构自由能计算 | 第35-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第三章 基于OpenCL的蛋白质转换算法实现 | 第39-43页 |
| ·蛋白质转换算法设计 | 第39页 |
| ·蛋白质转换算法并行实现步骤 | 第39-41页 |
| ·测试结果 | 第41-42页 |
| ·实验分析 | 第42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 基于OpenCL的大规模种群并行遗传算法实现 | 第43-53页 |
| ·并行遗传算法设计 | 第43-44页 |
| ·大规模种群并行遗传算法实现步骤 | 第44-47页 |
| ·测试结果 | 第47-50页 |
| ·实验分析 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第五章 基于OpenCL的大规模种群并行遗传模拟退火算法实现 | 第53-65页 |
| ·并行遗传模拟退火算法设计 | 第53-54页 |
| ·并行遗传模拟退火算法步骤 | 第54-58页 |
| ·测试结果 | 第58-63页 |
| ·实验分析 | 第63-64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章 总结和展望 | 第65-67页 |
| ·总结 | 第65页 |
| ·展望 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第72页 |