| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第1章 绪论 | 第7-14页 |
| ·研究背景 | 第7-10页 |
| ·生物信息学 | 第7-8页 |
| ·基因表达谱 | 第8-9页 |
| ·典型的生物信息数据库 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·研究目的及意义 | 第11页 |
| ·本文主要工作及创新点 | 第11-12页 |
| ·研究内容 | 第11页 |
| ·主要工作 | 第11-12页 |
| ·研究的创新点及难点 | 第12页 |
| ·论文结构安排 | 第12-14页 |
| 第2章 食管癌基因表达谱预处理 | 第14-23页 |
| ·数据获取 | 第14-18页 |
| ·基因芯片简介 | 第14-15页 |
| ·数据格式说明 | 第15页 |
| ·食管癌基因表达谱的获取 | 第15-18页 |
| ·数据预处理方法及流程 | 第18-20页 |
| ·数据过滤 | 第18页 |
| ·补缺失值 | 第18-19页 |
| ·数据对数化 | 第19-20页 |
| ·数据标准化 | 第20页 |
| ·数据预处理结果 | 第20-22页 |
| ·常用的分析软件 | 第20-21页 |
| ·预处理结果 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 差异表达基因筛选 | 第23-28页 |
| ·特征选择算法简介 | 第23-25页 |
| ·倍数法 | 第23页 |
| ·t检验法 | 第23-24页 |
| ·方差分析 | 第24页 |
| ·支持向量机 | 第24-25页 |
| ·基于t检验法的差异表达基因筛选 | 第25-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第4章 双聚类分析 | 第28-44页 |
| ·传统聚类分析 | 第28-34页 |
| ·聚类分析中的距离(相似性)尺度函数 | 第28-30页 |
| ·常用的聚类方法 | 第30-31页 |
| ·聚类结果的可视化表示 | 第31页 |
| ·聚类结果 | 第31-34页 |
| ·双聚类算法概述 | 第34-37页 |
| ·双聚类算法简介 | 第34-35页 |
| ·双聚类算法的数学描述 | 第35页 |
| ·双聚类算法的分类 | 第35-36页 |
| ·几个重要的双聚类算法 | 第36-37页 |
| ·应用经典双聚类CHENG-CHURCH算法进行双聚类分析 | 第37-43页 |
| ·CHENG-CHURCH算法的数学描述 | 第37-38页 |
| ·CHENG-CHURCH算法步骤 | 第38-39页 |
| ·对CHENG-CHURCH算法的分析 | 第39-40页 |
| ·应用CHENG-CHURCH算法的双聚类结果 | 第40-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第5章 双聚类结果的富集分析 | 第44-52页 |
| ·富集分析简介 | 第44-45页 |
| ·富集分析法的基本原理 | 第44-45页 |
| ·通路分析 | 第45页 |
| ·KEGG数据库 | 第45页 |
| ·传统聚类结果的富集分析 | 第45-48页 |
| ·层次聚类结果的富集分析 | 第45-47页 |
| ·k-均值聚类结果的富集分析 | 第47-48页 |
| ·模糊C-均值聚类结果的富集分析 | 第48页 |
| ·双聚类结果的富集分析 | 第48-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第6章 总结与展望 | 第52-54页 |
| ·论文工作总结 | 第52页 |
| ·论文研究的前景展望 | 第52-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-58页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及科研成果 | 第58页 |