| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-12页 |
| 注释表 | 第12-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-21页 |
| ·引言 | 第13-15页 |
| ·研究背景 | 第13-14页 |
| ·研究意义 | 第14-15页 |
| ·国内外研究进展 | 第15-16页 |
| ·本文的研究创新点 | 第16页 |
| ·本文的研究方案及关键问题 | 第16-19页 |
| ·研究方案 | 第16-19页 |
| ·拟解决的关键问题 | 第19页 |
| ·本文的内容安排 | 第19-21页 |
| 第二章 人类蛋白质泛素化修饰位点数据及特征选择 | 第21-32页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点数据集 | 第21-24页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点数据集的获取 | 第21-22页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点数据集的预处理 | 第22-24页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点数据集的特征介绍 | 第24-30页 |
| ·氨基酸含量 | 第25-26页 |
| ·熵密度 | 第26页 |
| ·n 阶耦联组成 | 第26-27页 |
| ·氨基酸的理化特性 | 第27-28页 |
| ·氨基酸的进化信息 | 第28-29页 |
| ·蛋白质的结构特征 | 第29页 |
| ·其他的翻译后修饰 | 第29-30页 |
| ·特征选择方法介绍 | 第30-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 基于随机森林的人类蛋白质泛素化修饰位点预测模型 | 第32-41页 |
| ·随机森林 | 第32-33页 |
| ·随机森林算法简介 | 第32-33页 |
| ·随机森林算法的软件实现 MexStandalone-v0.02 | 第33页 |
| ·分类器性能评估指标 | 第33-34页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测算法 | 第34-37页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测模型构建 | 第34-36页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测结果 | 第36-37页 |
| ·本文的模型与现有模型的比较 | 第37-40页 |
| ·本文模型和 UbiPred 预测模型的比较 | 第38-39页 |
| ·本文模型和 UbPred 预测工具比较 | 第39-40页 |
| ·本文模型和 CKSAAP_UbSite 预测工具比较 | 第40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 人类蛋白质泛素化修饰位点预测结果讨论 | 第41-57页 |
| ·引言 | 第41页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测的窗口选择 | 第41-42页 |
| ·支持向量机和随机森林的预测结果比较 | 第42-45页 |
| ·支持向量机算法简介 | 第42-44页 |
| ·预测结果比较 | 第44-45页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测结果分析 | 第45-51页 |
| ·蛋白质的氨基酸含量与泛素化修饰位点分析 | 第45-47页 |
| ·蛋白质的无序区域与泛素化修饰位点分析 | 第47-48页 |
| ·蛋白质的磷酸化修饰与泛素化修饰位点分析 | 第48-50页 |
| ·蛋白质的乙酰化修饰与泛素化修饰位点分析 | 第50-51页 |
| ·基于蛋白质亚细胞定位的泛素化修饰位点预测 | 第51-56页 |
| ·基于核蛋白的泛素化修饰位点预测 | 第52-53页 |
| ·基于胞浆蛋白质的泛素化修饰位点预测 | 第53页 |
| ·三种预测模型的讨论 | 第53-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 第五章 人类泛素化修饰位点相关网站开发 | 第57-72页 |
| ·引言 | 第57页 |
| ·哺乳动物蛋白质泛素化修饰位点数据库 mUbiSiDa | 第57-66页 |
| ·mUbiSiDa 简介 | 第57-59页 |
| ·mUbiSiDa 的功能 | 第59-66页 |
| ·人类蛋白质泛素化修饰位点预测工具 PredHUbi | 第66-70页 |
| ·PredHUbi 开发 | 第66-67页 |
| ·PredHUbi 预测泛素化修饰位点 | 第67-70页 |
| ·本章小结 | 第70-72页 |
| 第六章 总结与展望 | 第72-75页 |
| ·本文工作总结 | 第72-73页 |
| ·后续工作展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 在学期间的研究成果及学术论文情况 | 第82-83页 |
| 附录 | 第83页 |
