| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-22页 |
| ·论文研究背景 | 第15-18页 |
| ·蛋白质结构和其功能的关系 | 第15页 |
| ·蛋白质分子结构可视化 | 第15-18页 |
| ·蛋白质分子结构可视化意义 | 第15-16页 |
| ·蛋白质分子结构数据库介绍 | 第16-18页 |
| ·研究进展 | 第18-19页 |
| ·研究方案及关键问题 | 第19-21页 |
| ·研究方案 | 第19-20页 |
| ·关键解决问题 | 第20-21页 |
| ·论文工作与结构 | 第21-22页 |
| ·论文工作 | 第21页 |
| ·论文结构 | 第21-22页 |
| 第二章 蛋白质分子三维模型建立 | 第22-29页 |
| ·蛋白质模型介绍 | 第22页 |
| ·VDW 模型（Van der Waals Model） | 第22-24页 |
| ·基本原理和构建方法 | 第22-23页 |
| ·绘制方法 | 第23-24页 |
| ·球棍模型（Ball and Stick Model） | 第24-26页 |
| ·模型表示方法 | 第24页 |
| ·模型几何构建算法 | 第24-25页 |
| ·模型绘制 | 第25-26页 |
| ·飘带模型（Ribbon Model） | 第26-28页 |
| ·模型表示方法 | 第26页 |
| ·模型几何构建算法 | 第26-27页 |
| ·模型绘制 | 第27-28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 蛋白质分子表面模型建立 | 第29-40页 |
| ·蛋白质分子表面模型介绍 | 第29页 |
| ·蛋白质分子表面定义 | 第29-30页 |
| ·蛋白质分子表面模型构建 | 第30-39页 |
| ·溶剂外部表面的拓扑结构 | 第31-32页 |
| ·凹球面构建 | 第32-33页 |
| ·马鞍面构建 | 第33-38页 |
| ·ei 有两个相邻的面 | 第33-35页 |
| ·ei 没有相邻的面 | 第35-37页 |
| ·ei 有两个以上相邻的面 | 第37-38页 |
| ·马鞍面的自相交处理 | 第38页 |
| ·凸球面构建 | 第38-39页 |
| ·蛋白质分子表面模型绘制 | 第39页 |
| ·本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 蛋白质分子表面结构参数计算与分析 | 第40-52页 |
| ·蛋白质分子表面结构参数 | 第40页 |
| ·表面曲率计算 | 第40-46页 |
| ·表面三角网格的构建 | 第41-42页 |
| ·三角网格模型顶点法矢向量计算 | 第42-43页 |
| ·二次曲面拟合 | 第43-44页 |
| ·表面曲率计算 | 第44-45页 |
| ·表面面片法矢方向调整 | 第45-46页 |
| ·形状指数 SI 计算与可视化 | 第46-47页 |
| ·SI 定义和计算 | 第46-47页 |
| ·SI 可视化 | 第47页 |
| ·凹凸指数 CCI 计算与可视化 | 第47-48页 |
| ·CCI 定义和计算 | 第47-48页 |
| ·CCI 可视化 | 第48页 |
| ·蛋白质分子表面参数分析 | 第48-51页 |
| ·蛋白质分子表面匹配度或相似度的曲率分析 | 第48-49页 |
| ·异源二聚体和同源二聚体相互作用位点 SI 值分析 | 第49-50页 |
| ·统计方法 | 第49页 |
| ·结果分析 | 第49-50页 |
| ·蛋白质间相互作用的 CCI 值分析 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 蛋白质分子表面物理性质对其功能稳定性的影响 | 第52-56页 |
| ·氨基酸物理性质分类 | 第52-53页 |
| ·蛋白质分子表面酸碱性分析 | 第53页 |
| ·蛋白质分子表面极性非极性分析 | 第53-54页 |
| ·蛋白质分子表面亲疏水性分析 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第六章 蛋白质分子三维结构可视化系统的设计和实现 | 第56-76页 |
| ·分子可视化软件介绍 | 第56-57页 |
| ·OpenGL 与其他 3D 技术比较 | 第57-58页 |
| ·ProtCC 可视化系统功能设计和实现 | 第58-75页 |
| ·蛋白质分子文件预处理 | 第58-59页 |
| ·ProtCC 系统实现 | 第59-64页 |
| ·开发环境和运行环境 | 第59页 |
| ·系统功能 | 第59-60页 |
| ·系统结构 | 第60-62页 |
| ·系统主要程序设计 | 第62-64页 |
| ·系统优化 | 第64页 |
| ·系统实现效果测试 | 第64-71页 |
| ·系统性能分析 | 第71-75页 |
| ·系统内存消耗分析 | 第72-74页 |
| ·系统图像渲染速度分析 | 第74-75页 |
| ·本章小结 | 第75-76页 |
| 第七章 工作总结与展望 | 第76-78页 |
| ·论文主要工作总结 | 第76-77页 |
| ·进一步工作和展望 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第83-84页 |
| 附录 | 第84-86页 |
