| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-12页 |
| 目录 | 第12-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第15-32页 |
| 引言 | 第15-16页 |
| 第一章 分子标记：线粒体基因组以及微卫星分子标记研究进展 | 第16-27页 |
| ·线粒体基因组研究进展 | 第16-20页 |
| ·线粒体研究历史 | 第16页 |
| ·鱼类线粒体基因组简介 | 第16-19页 |
| ·鱼类线粒体D-loop区的一般特征 | 第19-20页 |
| ·鱼类线粒体Cytb、COI、ND1的一般特征 | 第20页 |
| ·微卫星分子标记研究现状 | 第20-27页 |
| ·微卫星简介 | 第20-21页 |
| ·微卫星的研究进展 | 第21页 |
| ·微卫星分子标记的特点 | 第21-23页 |
| ·微卫星分子标记的获得及在水产生物研究中的应用 | 第23-27页 |
| 第二章 波纹唇鱼的研究现状 | 第27-32页 |
| ·波纹唇鱼生物学概况 | 第27-30页 |
| ·波纹唇鱼的形态特征 | 第27-28页 |
| ·波纹唇鱼的生态习性 | 第28页 |
| ·波纹唇鱼的繁殖习性 | 第28-29页 |
| ·波纹唇鱼的组织学研究 | 第29-30页 |
| ·细胞遗传学研究 | 第30页 |
| ·生化遗传学研究 | 第30页 |
| ·分子遗传学研究 | 第30页 |
| ·波纹唇鱼的其他研究 | 第30-31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二部分 研究论文 | 第32-70页 |
| 第三章 基于线粒体DNA序列分析不同地理群体的波纹唇鱼遗传多样性 | 第32-61页 |
| ·材料采集、试剂及试剂配制、仪器 | 第32-34页 |
| ·材料采集 | 第32页 |
| ·试剂及试剂配制 | 第32-34页 |
| ·仪器 | 第34页 |
| ·实验方法 | 第34-37页 |
| ·波纹唇鱼总DNA提取 | 第34-36页 |
| ·全序列导出以及相关引物设计合成 | 第36页 |
| ·PCR扩增及扩增产物检测 | 第36-37页 |
| ·PCR扩增产物纯化、克隆及测序 | 第37页 |
| ·测序结果的软件分析 | 第37-38页 |
| ·数据的软件分析结果 | 第38-61页 |
| ·遗传多样性参数及中性检测 | 第38-39页 |
| ·碱基含量 | 第39-44页 |
| ·基于Kimura 2-parameter的遗传距离与pairwise difference遗传分化 | 第44-46页 |
| ·遗传分化及基因流 | 第46-48页 |
| ·AMOVA分析 | 第48-50页 |
| ·单倍型数目、类型及分布 | 第50-61页 |
| 第四章 基于微卫星分子标记分析不同地理波纹唇鱼群体遗传多样性 | 第61-67页 |
| ·材料、试剂及其配制、仪器 | 第61页 |
| ·材料 | 第61页 |
| ·试剂及其配制 | 第61页 |
| ·仪器 | 第61页 |
| ·实验方法 | 第61-63页 |
| ·总DNA提取 | 第61页 |
| ·引物的选取与荧光合成 | 第61页 |
| ·PCR扩增及扩增产物的检测 | 第61-63页 |
| ·数据读取及软件分析 | 第63页 |
| ·数据的软件分析结果 | 第63-67页 |
| ·遗传多样性参数 | 第63-64页 |
| ·遗传分化及基因流 | 第64页 |
| ·Nei's遗传相似指数和遗传距离及UPGMA聚类分析 | 第64-65页 |
| ·AMOVA分析 | 第65-67页 |
| 第五章 小结 | 第67-70页 |
| ·基于mtDNA序列对不同地理群体的波纹唇鱼遗传多样性和遗传分化分析 | 第67-68页 |
| ·基于微卫星分子标记对不同地理群体波纹唇鱼遗传多样性和遗传分化分析 | 第68页 |
| ·本论文的不足及今后工作的展望 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-80页 |
| 作者在读期间科研成果简介 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 附录1：已上传至Genebank的25条波纹唇鱼D-loop序列 | 第82-89页 |
| 附录2：4个地理群体野生波纹唇鱼微卫星荧光引物标记分析相关数据表格 | 第89-92页 |
