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超级杂交稻亲本株1S TIR1 cDNA的克隆与生物信息学分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
第一章 文献综述第10-24页
 1 生长素受体与生长素作用机制研究进展第10-17页
   ·生长素结合蛋白第10-11页
   ·TIR1受体功能的确定第11-12页
   ·ABP1和TIR1亲和活性比较第12-13页
   ·基因转录水平上的生长素调控机制第13-14页
     ·Aux/IAAs第13-14页
     ·ARF第14页
   ·生长素参与的泛素-蛋白酶体降解途径第14-16页
   ·问题与展望第16-17页
 2 生物信息学在新基因全长cDNA电子克隆中的应用第17-22页
   ·新基因全长cDNA电子克隆的方法及生物信息学在其中的应用第17-21页
     ·基于同源性比对的电子克隆第17-18页
     ·基于EST数据库的电子克隆第18-19页
     ·基于基因组数据库的电子克隆第19-20页
     ·全长cDNA的判断第20-21页
   ·生物信息学在新基因全长cDNA电子克隆序列分析中的应用第21-22页
   ·讨论与展望第22页
 3 本研究拟解决的问题第22-24页
第二章 超级杂交稻亲本TIR1 cDNA序列的克隆与生物信息学分析第24-42页
 1 材料第24页
   ·植物材料第24页
   ·菌株第24页
 2 主要试剂与仪器第24-25页
   ·酶与试剂盒第24页
   ·试剂第24-25页
   ·主要仪器第25页
 3 方法第25-31页
   ·2种获得编码水稻TIR1 cDNA的电子克隆方法第25页
     ·基于同源性比对的电子克隆第25页
     ·基于基因组数据库的电子克隆第25页
   ·总RNA的提取及其质量检测第25-27页
     ·总RNA的提取第25-26页
     ·总RNA的质量检测第26页
       ·RNA甲醛变性电泳液1×MOPS 300mL第26页
       ·配制1%琼脂糖变性胶第26页
       ·RNA电泳点样第26页
     ·测定所提取的RNA的OD_(260)及OD_(260)/OD_(280)值第26-27页
   ·用RT-PCR的方法获得TIR1 cDNA片段第27-31页
     ·特异引物的设计第27页
     ·cDNA第一链的合成第27-28页
     ·TIR1 cDNA片段的PCR扩增第28页
     ·切胶回收目的片段第28-29页
     ·将回收的目的片段克隆到pMD19-T载体上第29页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第29页
     ·目的片段的鉴定及测定第29-31页
       ·菌落PCR鉴定第29-30页
       ·质粒酶切鉴定第30-31页
 4 结果与分析第31-40页
   ·2种电子克隆方法结果第31-32页
   ·提取的总RNA的完整性检测第32-33页
   ·TIR1 cDNA片段的RT-PCR扩增第33页
   ·TIR1 cDNA片段的克隆第33-34页
   ·测序与分析第34-36页
   ·TIR1的生物信息学分析第36-40页
     ·蛋白质的同源性分析第36-37页
     ·蛋白质二级结构的预测与比对第37页
     ·蛋白质三级结构的预测与比对第37-38页
     ·蛋白质跨膜结构预测与比对第38页
     ·蛋白质信号肽预测与比对第38-39页
     ·蛋白质的功能预测第39-40页
 5 讨论第40-42页
结论第42-43页
创新点第43页
后续研究设想第43-44页
参考文献第44-49页
附录A第49-50页
附录B第50-53页
附录C第53-54页
附录D第54-55页
致谢第55-56页
作者简介第56页

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