摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-10页 |
第一章 文献综述 | 第10-24页 |
1 生长素受体与生长素作用机制研究进展 | 第10-17页 |
·生长素结合蛋白 | 第10-11页 |
·TIR1受体功能的确定 | 第11-12页 |
·ABP1和TIR1亲和活性比较 | 第12-13页 |
·基因转录水平上的生长素调控机制 | 第13-14页 |
·Aux/IAAs | 第13-14页 |
·ARF | 第14页 |
·生长素参与的泛素-蛋白酶体降解途径 | 第14-16页 |
·问题与展望 | 第16-17页 |
2 生物信息学在新基因全长cDNA电子克隆中的应用 | 第17-22页 |
·新基因全长cDNA电子克隆的方法及生物信息学在其中的应用 | 第17-21页 |
·基于同源性比对的电子克隆 | 第17-18页 |
·基于EST数据库的电子克隆 | 第18-19页 |
·基于基因组数据库的电子克隆 | 第19-20页 |
·全长cDNA的判断 | 第20-21页 |
·生物信息学在新基因全长cDNA电子克隆序列分析中的应用 | 第21-22页 |
·讨论与展望 | 第22页 |
3 本研究拟解决的问题 | 第22-24页 |
第二章 超级杂交稻亲本TIR1 cDNA序列的克隆与生物信息学分析 | 第24-42页 |
1 材料 | 第24页 |
·植物材料 | 第24页 |
·菌株 | 第24页 |
2 主要试剂与仪器 | 第24-25页 |
·酶与试剂盒 | 第24页 |
·试剂 | 第24-25页 |
·主要仪器 | 第25页 |
3 方法 | 第25-31页 |
·2种获得编码水稻TIR1 cDNA的电子克隆方法 | 第25页 |
·基于同源性比对的电子克隆 | 第25页 |
·基于基因组数据库的电子克隆 | 第25页 |
·总RNA的提取及其质量检测 | 第25-27页 |
·总RNA的提取 | 第25-26页 |
·总RNA的质量检测 | 第26页 |
·RNA甲醛变性电泳液1×MOPS 300mL | 第26页 |
·配制1%琼脂糖变性胶 | 第26页 |
·RNA电泳点样 | 第26页 |
·测定所提取的RNA的OD_(260)及OD_(260)/OD_(280)值 | 第26-27页 |
·用RT-PCR的方法获得TIR1 cDNA片段 | 第27-31页 |
·特异引物的设计 | 第27页 |
·cDNA第一链的合成 | 第27-28页 |
·TIR1 cDNA片段的PCR扩增 | 第28页 |
·切胶回收目的片段 | 第28-29页 |
·将回收的目的片段克隆到pMD19-T载体上 | 第29页 |
·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化 | 第29页 |
·目的片段的鉴定及测定 | 第29-31页 |
·菌落PCR鉴定 | 第29-30页 |
·质粒酶切鉴定 | 第30-31页 |
4 结果与分析 | 第31-40页 |
·2种电子克隆方法结果 | 第31-32页 |
·提取的总RNA的完整性检测 | 第32-33页 |
·TIR1 cDNA片段的RT-PCR扩增 | 第33页 |
·TIR1 cDNA片段的克隆 | 第33-34页 |
·测序与分析 | 第34-36页 |
·TIR1的生物信息学分析 | 第36-40页 |
·蛋白质的同源性分析 | 第36-37页 |
·蛋白质二级结构的预测与比对 | 第37页 |
·蛋白质三级结构的预测与比对 | 第37-38页 |
·蛋白质跨膜结构预测与比对 | 第38页 |
·蛋白质信号肽预测与比对 | 第38-39页 |
·蛋白质的功能预测 | 第39-40页 |
5 讨论 | 第40-42页 |
结论 | 第42-43页 |
创新点 | 第43页 |
后续研究设想 | 第43-44页 |
参考文献 | 第44-49页 |
附录A | 第49-50页 |
附录B | 第50-53页 |
附录C | 第53-54页 |
附录D | 第54-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
作者简介 | 第56页 |