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利用秀丽隐杆线虫表达捻转血矛线虫H11蛋白的转基因研究

致谢第1-15页
摘要第15-19页
Abstract第19-23页
前言第23-25页
第一部分 文献综述第25-56页
 第一章 捻转血矛线虫与捻转血矛线虫病第26-42页
  1 捻转血矛线虫病概述第26-28页
   ·病原及其形态特征第26页
   ·生活史第26-27页
   ·流行病学第27页
   ·临床症状第27-28页
   ·病理变化第28页
  2 捻转血矛线虫生物化学与分子生物学研究进展第28-31页
   ·线虫从营自由生活转变为寄生生活的基因表达差异第28-29页
   ·发育过程中的发育调节蛋白第29-30页
   ·发育过程中的信号转导第30-31页
  3 捻转血矛线虫保护性抗原研究进展第31-34页
   ·隐蔽抗原(hidden antigen)第31-33页
     ·H11第31-32页
     ·血矛线虫半乳糖糖蛋白复合物(Haemonchus galactose-containingglycoprotein complex.H-gal-GP)第32页
     ·半胱氨酸蛋白酶(cysteine protease)第32-33页
   ·天然抗原第33-34页
     ·成虫15/24 kDa ES抗原第33页
     ·成虫66 kDa ES抗原第33-34页
     ·捻转血矛线虫感染性三期幼虫表面抗原(Hc-sL3)第34页
   ·捻转血矛线虫组织蛋白酶L(Hc-CPL-1)第34页
  4 捻转血矛线虫疫苗研制第34-39页
   ·重组抗原的免疫保护效果第34-35页
   ·疫苗开发中存在的主要困难第35-36页
     ·利用抗原的重组形式不能取得与天然提取物同等的免疫保护效果第36页
     ·免疫策略难以制定,免疫佐剂难以选择第36页
     ·不同品种或年龄阶段的羊针对线虫抗原产生的应答反应差异大第36页
   ·捻转血矛线虫疫苗研究的发展方向第36-38页
     ·秀丽隐杆线虫作为表达系统大量制备疫苗候选抗原第36-37页
     ·新的疫苗候选抗原的鉴定第37-38页
     ·利用寄生性线虫的细胞系表达抗原第38页
   ·结语第38-39页
  5 胃肠道蠕虫感染及免疫应答机制研究第39-42页
   ·胃肠道蠕虫感染及免疫应答机制第39-41页
   ·捻转血矛线虫感染诱导的免疫应答第41-42页
 第二章 秀丽隐杆线虫及其在寄生性线虫研究中的应用第42-56页
  1 秀丽隐杆线虫简介第42-46页
   ·秀丽隐杆线虫的生物学特性第42-43页
   ·秀丽隐杆线虫的基因组工程第43-46页
     ·秀丽隐杆线虫基因组简介第43-44页
     ·秀丽隐杆线虫的选择性剪接(alternative splicing)第44-45页
     ·秀丽隐杆线虫基因组数据库第45-46页
  2 秀丽隐杆线虫在寄生性线虫基因功能研究中的应用第46-56页
   ·秀丽隐杆线虫的分类学地位第46-49页
   ·利用RNAi技术进行基因功能分析第49-53页
     ·利用RNAi鉴定基因第49页
     ·秀丽隐杆线虫体内的RNAi第49-50页
     ·寄生性线虫体内的RNAi研究第50-53页
   ·秀丽隐杆线虫在寄生性线虫基因功能研究中的应用第53-56页
     ·药物抗性研究第53-54页
     ·酶活性研究第54-56页
第二部分 研究内容第56-168页
 第一章 捻转血矛线虫H11基因cDNA克隆及基因组结构分析第57-75页
  摘要第57-58页
  1 材料与方法第58-64页
   ·虫体第58页
   ·菌株与质粒第58页
   ·工具酶与试剂第58页
   ·主要仪器设备第58-59页
   ·溶液配制第59页
   ·H11 cDNA序列的RT-PCR扩增第59-60页
     ·捻转血矛线虫ZJ株总RNA的提取第59页
     ·用于扩增H11 cDNA序列的引物的设计第59页
     ·H11基因的RT-PCR扩增第59-60页
     ·捻转血矛线虫ZJ株H11基因的克隆第60页
   ·H11基因组序列的获得第60-64页
     ·捻转血矛线虫基因组DNA的提取第60-61页
     ·用于扩增H11部分基因组序列的引物的设计第61页
     ·利用长距离PCR技术扩增H11部分基因组序列第61-62页
     ·用于基因步移技术的特异性引物的设计第62页
     ·利用基因步移技术扩增获得H11基因组序列第62-64页
     ·H11基因组序列分析第64页
  2 结果第64-73页
   ·RT-PCR扩增结果第64页
   ·捻转血矛线虫ZJ株H11基因的克隆、PCR鉴定及酶切分析第64-66页
   ·序列测定第66-68页
   ·序列比对第68页
   ·长距离PCR扩增获得的部分基因组序列分析第68页
   ·利用基因步移技术获得基因组片段及其鉴定第68-71页
   ·H11基因组序列分析第71-73页
  3 讨论第73-75页
 第二章 秀丽隐杆线虫转基因体系的建立第75-100页
  摘要第75-76页
  1 材料与方法第76-85页
   ·材料第76-77页
     ·秀丽隐杆线虫第76页
     ·菌株与质粒第76页
     ·工具酶与试剂第76页
     ·主要仪器设备第76-77页
     ·溶液配制第77页
   ·秀丽隐杆线虫基因组DNA的提取第77页
   ·引物设计第77-78页
   ·重组表达载体的构建策略第78页
   ·基于Act-1基因核心启动子表达载体的构建第78-82页
     ·秀丽隐杆线虫Act-1基因启动子的克隆、测序第78页
     ·秀丽隐杆线虫T07F10.1a基因3’UTR序列的克隆、测序第78-80页
     ·SV40早期mRNA终止信号序列的PCR扩增、克隆及测序第80-81页
     ·EGFP基因的PCR扩增第81页
     ·以pBluescript SK+载体为骨架,秀丽隐杆线虫表达重组载体的构建第81-82页
     ·以pEGFP-4.1载体为骨架,秀丽隐杆线虫表达重组载体的构建第82页
   ·基于T07F10.1a核心启动子的表达载体的构建第82-83页
   ·携带有EGFP基因的重组表达载体在秀丽隐杆线虫体内的转基因表达第83-84页
     ·显微注射前所需器材的准备第83页
     ·秀丽隐杆线虫显微注射用虫体的传代培养第83页
     ·携带EGFP基因的重组表达质粒的制备第83页
     ·携带EGFP基因的重组表达质粒的显微注射第83-84页
     ·具有roller表型的转基因虫体的单虫PCR鉴定第84页
   ·携带有EGFP基因的重组表达载体在Vero细胞中的转染试验第84-85页
  2 结果第85-98页
   ·重组表达载体所需转录元件PCR产物的鉴定第85-87页
     ·秀丽隐杆线虫Act-1基因核心启动子克隆的PCR鉴定及酶切分析第85页
     ·秀丽隐杆线虫T07F10.1a基因3’UTR序列的PCR鉴定及酶切分析第85-86页
     ·SV40早期mRNA终止信号序列的PCR鉴定及酶切分析第86页
     ·EGFP基因的PCR扩增第86-87页
     ·秀丽隐杆线虫T07F10.1a启动子克隆的PCR鉴定及酶切分析第87页
   ·重组表达载体启动子序列测序及功能基序分析第87-90页
     ·Act-1基因核心启动子转录相关基序分析第87-88页
     ·T07F10.1a基因启动子转录相关基序分析第88页
     ·T07F10.1a基因3’UTR序列转录相关基序分析第88页
     ·SV40早期mRNA poly(A)信号序列分析第88-90页
   ·以Act-1基因核心启动子为转录元件重组表达载体的鉴定第90-93页
   ·秀丽隐杆线虫组织特异性表达重组载体的鉴定第93-94页
   ·核心启动子转录的EGFP基因在秀丽隐杆线虫体内中的表达第94-96页
     ·具有roller表型的后代的获得第94-95页
     ·转基因线虫后代的荧光观察第95-96页
   ·核心启动子转录的EGFP基因在Vero细胞中的表达第96-98页
  3 讨论第98-100页
 第三章 捻转血矛线虫H11基因5’上游序列转录活性分析第100-119页
  摘要第100页
  1 材料与方法第100-108页
   ·材料第101页
     ·虫体第101页
     ·菌株与质粒第101页
     ·工具酶与试剂第101页
     ·主要仪器设备第101页
     ·溶液配制第101页
   ·捻转血矛线虫基因组DNA的提取第101页
   ·H11基因5’上游区域分析第101-104页
     ·用于扩增H11基因5’上游部分基因组序列的引物设计第102页
     ·利用基因步移技术扩增H11基因5’上游部分基因组序列第102-104页
     ·H11基因5’上游部分基因组序列分析第104页
   ·H11基因5’侧翼区启动子基序分析第104页
   ·重组表达载体的构建策略第104-105页
   ·H11基因5’侧翼区重组表达载体的构建第105-106页
     ·H11基因5’侧翼区的PCR扩增第105-106页
     ·H11基因5’侧翼区表达载体的构建第106页
   ·携带有GFP基因的重组表达载体在秀丽隐杆线虫体内的转基因表达第106-108页
     ·显微注射前所需器材的准备第106页
     ·秀丽隐杆线虫显微注射用虫体的传代培养第106页
     ·携带GFP基因的重组表达质粒的制备第106页
     ·携带GFP基因的重组表达质粒的显微注射第106-107页
     ·具有roller表型的转基因虫体的单虫PCR鉴定第107页
     ·具有roller表型的转基因虫体的基因组整合试验第107页
     ·具有roller表型转基因虫体的RT-PCR鉴定第107-108页
  2 结果第108-116页
   ·利用基因步移技术获得基因组片段及其鉴定第108-109页
   ·序列分析第109-111页
   ·启动子元件分析第111页
   ·重组表达载体HcHPS-pPD95.77和HcHPL-pPD95.77的鉴定第111-113页
   ·转基因线虫后代的荧光观察第113-114页
   ·HcHPL-pPD95.77注射的转基因虫体的PCR和RT-PCR鉴定第114-116页
  3 讨论第116-119页
 第四章 利用秀丽隐杆线虫表达H11蛋白的启动子筛选第119-134页
  摘要第119-120页
  1 材料与方法第120-122页
   ·材料第120-121页
     ·秀丽隐杆线虫第120页
     ·菌株与质粒第120页
     ·工具酶与试剂第120页
     ·主要仪器设备第120页
     ·溶液配制第120-121页
   ·秀丽隐杆线虫基因组DNA的提取第121页
   ·引物设计第121页
   ·5’UTR的克隆第121-122页
   ·构建策略第122页
   ·5 ’-flanking region::GFP表达载体的构建第122页
   ·携带有GFP基因的重组表达载体在秀丽隐杆线虫体内的转基因表达第122页
  2 结果第122-132页
   ·基因5’侧翼区序列PCR产物的鉴定第122页
   ·基因5’侧翼区序列主要启动子基序分析第122-127页
   ·重组表达载体的鉴定第127页
   ·转基因线虫后代的荧光观察第127-132页
  3 讨论第132-134页
 第五章 H11蛋白的转基因表达研究第134-155页
  摘要第134页
  1 材料与方法第134-144页
   ·材料第135-136页
     ·秀丽隐杆线虫第135页
     ·菌株与质粒第135页
     ·工具酶与试剂第135页
     ·主要仪器设备第135页
     ·溶液配制第135-136页
   ·捻转血矛线虫H11蛋白多克隆抗体的制备第136-138页
     ·捻转血矛线虫H11基因完整cDNA序列及部分基因片段HPS(H11 PartialSequence)的PCR扩增第136页
     ·原核表达载体的构建第136-137页
     ·IPTG诱导的重组蛋白表达与检测第137页
     ·重组蛋白的纯化第137-138页
     ·多克隆抗体的制备第138页
   ·利用秀丽隐杆线虫转基因表达H11的策略第138页
   ·cpr-1 5’-flanking region::GFP重组表达载体的改造第138-141页
     ·去掉cpr-1 5’-flanking region::GFP重组载体GFP基因的引物设计第138-139页
     ·cpr-pPD95.77(G-)载体的获得第139-141页
     ·EGFP基因验证第141页
   ·利用秀丽隐杆线虫表达H11基因第141-142页
     ·H11基因的扩增与重组表达载体cpr-H11-ppd(G-)的构建第141-142页
     ·显微注射第142页
     ·单虫PCR鉴定第142页
     ·具有roller表型的转基因虫体的基因组整合试验第142页
     ·RT-PCR鉴定第142页
   ·利用秀丽隐杆线虫表达H11基因的部分片段(Transgenic H11 PartialSequence,Trans-HPS)第142-143页
     ·H11基因部分片段Trans-HPS的PCR扩增与表达载体cpr-Trans-HPS-ppd(G-)的构建第142-143页
     ·显微注射第143页
     ·单虫PCR鉴定第143页
     ·具有roller表型的转基因虫体的基因组整合试验第143页
     ·RT-PCR鉴定第143页
   ·转基因蛋白的western-blot分析第143页
   ·利用镍琼脂糖凝胶柱纯化转基因蛋白的尝试第143页
   ·转基因秀丽隐杆线虫的保存第143-144页
  2 结果第144-153页
   ·原核表达载体H11-pET32和HPS-pET28的鉴定第144页
   ·原核表达蛋白的检测与分析结果第144-145页
   ·多克隆抗体制备的结果分析第145页
   ·重组表达载体的改造与鉴定第145-148页
   ·重组载体cpr-EGFP-pPD95.77在秀丽隐杆线虫体内的转基因表达第148页
   ·重组载体cpr-H11-pPD95.77和cpr-Trans-HPS-pPD95.77的鉴定第148-150页
   ·携带有cpr-H11-pPD95.77重组质粒的转基因线虫的鉴定第150页
   ·携带有cpr-Trans-HPS-pPD95.77重组质粒的转基因线虫的鉴定第150-151页
   ·转基因蛋白的Western-Blot分析第151-152页
   ·利用镍琼脂糖凝胶柱纯化转基因蛋白的尝试第152-153页
  3 讨论第153-155页
 第六章 转基因秀丽隐杆线虫全虫抗原的粗提及免疫保护性试验第155-168页
  摘要第155页
  1 材料与方法第155-160页
   ·材料第155-156页
     ·实验场地及试验动物第156页
     ·捻转血矛线虫L3感染性幼虫的准备第156页
     ·秀丽隐杆线虫第156页
     ·工具酶与试剂第156页
     ·主要仪器设备第156页
     ·溶液配制第156页
   ·Trans-HPS转基因线虫成虫全虫蛋白的准备第156-157页
     ·Trans-HPS转基因线虫成虫的液体培养第157页
     ·Trans-HPS转基因线虫成虫全虫蛋白的粗制备第157页
   ·原核表达蛋白HPS的制备与纯化第157页
   ·实验分组及免疫第157-158页
     ·组别设计第157-158页
     ·免疫及攻虫第158页
   ·各免疫指标测定第158-160页
     ·ELISA检测抗体水平第158-159页
     ·外周血淋巴细胞转化试验(MTT法)第159页
     ·虫卵计数第159页
     ·幼虫孵化率第159-160页
     ·减虫率计数第160页
  2 结果第160-166页
   ·ELISA检测外周血血清抗体结果第160-161页
   ·外周血淋巴细胞增殖活性第161-163页
   ·虫卵计数及减卵率测定结果第163页
   ·幼虫孵化率测定结果第163-164页
   ·减虫率测定结果第164-166页
  3 讨论第166-168页
总结与展望第168-171页
 1 论文主要结论及创新点第168-169页
 2 研究展望第169-171页
附录1 溶液配制第171-175页
附录2 英文缩写注释第175-176页
附录3 实验过程中涉及的主要引物序列第176-178页
附录4 H11的基因组序列第178-183页
攻读博士学位期间的主要成果第183-184页
参考文献第184-203页

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