| 致谢 | 第7-11页 |
| 缩略词表 | 第11-14页 |
| 摘要 | 第14-16页 |
| Abstract | 第16-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-34页 |
| 1.1 植物miRNA的研究进展 | 第19-27页 |
| 1.1.1 miRNA的发现 | 第19页 |
| 1.1.2 植物miRNA的特点 | 第19-21页 |
| 1.1.3 植物miRNA的生物合成与作用机制 | 第21-23页 |
| 1.1.4 植物miRNA的研究方法 | 第23页 |
| 1.1.5 植物miRNA的生物学功能 | 第23-26页 |
| 1.1.6 miRNA与金属胁迫 | 第26-27页 |
| 1.2 酸铝胁迫对植物的毒害作用 | 第27-29页 |
| 1.2.1 酸铝的来源、毒性及其危害 | 第27页 |
| 1.2.2 铝毒对植物的影响 | 第27-29页 |
| 1.3 植物对铝胁迫的响应 | 第29-31页 |
| 1.4 大麦miRNA研究进展 | 第31-33页 |
| 1.4.1 西藏野生大麦研究意义 | 第31-32页 |
| 1.4.2 大麦miRNA研究进展 | 第32-33页 |
| 1.5 本研究的目的意义 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-41页 |
| 2.1 试验材料与仪器 | 第34页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第34页 |
| 2.1.2 试剂及耗材 | 第34页 |
| 2.1.3 仪器 | 第34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-37页 |
| 2.2.1 大麦的种植及酸铝胁迫处理 | 第34-35页 |
| 2.2.2 大麦根系总RNA提取 | 第35-37页 |
| 2.3 小RNA测序文库的构建和高通量测序 | 第37页 |
| 2.3.1 小分子RNA的文库构建实验流程 | 第37页 |
| 2.3.2 小分子RNA深度测序结果的分析 | 第37页 |
| 2.4 转录组测序文库的构建 | 第37-38页 |
| 2.4.1 转录组测序实验流程 | 第37页 |
| 2.4.2 转录组测序结果的分析 | 第37-38页 |
| 2.5 酸铝胁迫下大麦根系miRNA的差异表达分析 | 第38页 |
| 2.6 酸铝胁迫下大麦根系转录组的差异表达分析 | 第38页 |
| 2.7 miRNA的靶基因预测和功能分析 | 第38-39页 |
| 2.8 qRT-PCR验证 | 第39页 |
| 2.8.1 qRT-PCR验证miRNA | 第39页 |
| 2.8.2 qRT-PCR验证转录组差异表达基因 | 第39页 |
| 2.9 使用的数据库和软件 | 第39-41页 |
| 第三章 结果与分析 | 第41-78页 |
| 3.1 small RNA测序结果分析 | 第41-46页 |
| 3.1.1 小RNA测序数据处理及片段长度分布 | 第41-44页 |
| 3.1.2 小RNA分类注释 | 第44-46页 |
| 3.2 miRNA生物信息学分析 | 第46-50页 |
| 3.2.1 大麦保守miRNA的鉴定 | 第46-49页 |
| 3.2.2 大麦novel miRNA的鉴定 | 第49-50页 |
| 3.3 大麦酸铝胁迫响应相关miRNA鉴定 | 第50-64页 |
| 3.4 大麦miRNA的qRT-PCR验证 | 第64-65页 |
| 3.5 靶基因预测结果分析 | 第65-70页 |
| 3.6 利用转录组测序分析miRNA靶基因 | 第70-78页 |
| 3.6.1 RNA-seq差异表达基因 | 第73-75页 |
| 3.6.2 qRT-PCR验证RNA-Seq结果 | 第75-78页 |
| 第四章 讨论 | 第78-87页 |
| 4.1 miRNA同时参与植物的生长发育和胁迫应答的调控 | 第78-79页 |
| 4.2 miRNA调控靶基因的复杂性 | 第79-80页 |
| 4.3 miRNA调控靶基因的功能 | 第80-83页 |
| 4.4 转录组响应铝胁迫的基因型差异 | 第83页 |
| 4.5 大麦根系响应酸铝胁迫可能的机制 | 第83-85页 |
| 4.6 今后的研究方向 | 第85-87页 |
| 第五章 结论 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-98页 |
| 附录 | 第98-118页 |