| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-19页 |
| 1.植物多倍体与物种进化介绍 | 第10-12页 |
| 2.植物多倍体遗传与表观遗传的研究进展 | 第12-14页 |
| 3.多倍体基因表达模式是否遗传自亲本的研究 | 第14页 |
| 4.群体基因组学在多倍体研究中的应用 | 第14-15页 |
| 5.水稻基因组研究进展 | 第15-16页 |
| 6.植物对低氮胁迫的响应 | 第16页 |
| 7.基因分型技术研究进展 | 第16-19页 |
| 材料方法 | 第19-27页 |
| 1.实验材料 | 第19-20页 |
| 2.实验方法 | 第20-27页 |
| 2.1 表型测量 | 第20页 |
| 2.2 样品总RNA提取以及反转录 | 第20-21页 |
| 2.3 cDNA反转录 | 第21-22页 |
| 2.4 样品总基因组DNA提取 | 第22页 |
| 2.5 基因选择与SNP获得 | 第22-23页 |
| 2.6 MassArray测序与数据获得 | 第23页 |
| 2.7 部分同源等位基因的相对表达分析 | 第23-24页 |
| 2.8 部分同源等位基因在材料群体中变异程度的分析 | 第24页 |
| 2.9 利用F1代水稻杂交种分析亲本间的顺式调节(cis-regulation)和反式调节(trans-regulation)元件的分歧 | 第24-25页 |
| 2.10 材料间PCA分析、层级分类和基因表达模式分析 | 第25页 |
| 2.11 多倍体中基因表达亲本遗传模式与DNA拷贝数依赖分析 | 第25-26页 |
| 2.12 焦磷酸测序验证DNA片段删除 | 第26页 |
| 2.13 实时定量PCR | 第26-27页 |
| 结果与分析 | 第27-47页 |
| 第一部分 杂交化与多倍化对水稻表型和部分同源基因表达的影响 | 第27-41页 |
| 1.1 多倍化使水稻表型发生了群体多样性 | 第27-28页 |
| 1.2 Sequnom MassArray 测序平台的质量检测 | 第28-29页 |
| 1.3 杂交化对亚基因组等位基因相对表达模式的影响 | 第29-30页 |
| 1.4 水稻亚种间顺式与反式调控元件的进化 | 第30-31页 |
| 1.5 新合成水稻多倍体群体中部分同源基因(homeolog)表达的快速分化 | 第31-33页 |
| 1.6 杂交种和多倍体群体中的亲本偏倚表达 | 第33-34页 |
| 1.7 亲本中同源基因的表达在多倍体和杂交种中的继承关系 | 第34-36页 |
| 1.8 DNA拷贝数变化对水稻四倍体部分同源染色体基因表达的影响 | 第36-40页 |
| 1.9 水稻四倍体的基因总表达变化范围的降低 | 第40-41页 |
| 第二部分 新合成水稻四倍体在低氮环境下适应性的研究 | 第41-47页 |
| 2.1 水稻四倍体部分同源基因在胁迫环境下的相对表达 | 第41-44页 |
| 2.2 水稻多倍体在胁迫后总基因表达水平的改变 | 第44-45页 |
| 2.3 水稻多倍体低营养环境下的鲜重表现 | 第45-47页 |
| 讨论 | 第47-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第70页 |
