| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第9-17页 |
| 1.1 谱系地理学简介 | 第9页 |
| 1.2 谱系地理学理论 | 第9-10页 |
| 1.2.1 溯祖理论 | 第9-10页 |
| 1.2.2 哈迪-温伯格定律 | 第10页 |
| 1.2.3 中性理论 | 第10页 |
| 1.3 中国亚热带谱系地理学研究进展 | 第10-13页 |
| 1.3.1 中国亚热带植物谱系地理格局 | 第11-12页 |
| 1.3.2 中国亚热带植物谱系地理学发展趋势 | 第12页 |
| 1.3.3 中国亚热带植物谱系地理学研究存在的问题 | 第12-13页 |
| 1.4 白豆杉简介 | 第13-15页 |
| 1.4.1 白豆杉分类地位及分布格局 | 第13-14页 |
| 1.4.2 白豆杉群落特征 | 第14-15页 |
| 1.4.3 白豆杉群体遗传学研究进展 | 第15页 |
| 1.5 本研究的目的、意义和技术路线 | 第15-17页 |
| 1.5.1 研究的目的、意义 | 第15-16页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第16-17页 |
| 第二章 基于叶绿体基因片段的白豆杉谱系地理学研究 | 第17-26页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-19页 |
| 2.2.1 基因组总DNA提取 | 第18页 |
| 2.2.2 叶绿体基因片段筛选、扩增和测序 | 第18-19页 |
| 2.3 数据分析 | 第19-20页 |
| 2.3.1 遗传多样性 | 第19页 |
| 2.3.2 中性检测 | 第19-20页 |
| 2.3.3 谱系地理结构 | 第20页 |
| 2.3.4 单倍型网络图分析 | 第20页 |
| 2.4 结果 | 第20-24页 |
| 2.4.1 核苷酸变异和单倍型分布特点 | 第20-23页 |
| 2.4.2 遗传多样性 | 第23页 |
| 2.4.3 失配分析 | 第23-24页 |
| 2.5 讨论 | 第24-26页 |
| 2.5.1 遗传多样性 | 第24-25页 |
| 2.5.2 群体遗传结构 | 第25-26页 |
| 第三章 基于核基因片段的白豆杉谱系地理学研究 | 第26-42页 |
| 3.1 实验材料 | 第26页 |
| 3.2 实验方法 | 第26-30页 |
| 3.2.1 总DNA提取 | 第26页 |
| 3.2.2 测定转录组 | 第26-27页 |
| 3.2.3 核基因引物设计和位点筛选 | 第27页 |
| 3.2.4 群体扩增和测序 | 第27-30页 |
| 3.3 数据分析 | 第30-32页 |
| 3.3.1 遗传多样性及中性检验分析 | 第30页 |
| 3.3.2 群体遗传结构分析 | 第30页 |
| 3.3.3 群体分化和种群动态历史推测 | 第30-32页 |
| 3.4 结果 | 第32-39页 |
| 3.4.1 遗传多样性及中性检验 | 第32-34页 |
| 3.4.2 群体遗传结构 | 第34-37页 |
| 3.4.3 群体动态历史 | 第37-39页 |
| 3.5 讨论 | 第39-42页 |
| 3.5.1 群体遗传结构和遗传多样性 | 第39-40页 |
| 3.5.2 白豆杉群体进化历史 | 第40-42页 |
| 第四章 结论 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附件 | 第51-60页 |