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miR396调控水稻产量的分子机理研究

摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 文献综述第13-42页
    1 植物中microRNA(miRNA)生物加工和功能研究进展第13-24页
        1.1 miRNA在时空表达调控中的作用第14-16页
        1.2 miRNAs在植物发育中的作用第16-24页
    2 植物中miRNA396/GRF研究进展第24-27页
    3 植物花器官形态建成的研究进展第27-38页
        3.1 CLAVATA-WUS反馈调节通路第27-29页
        3.2 KNOX基因促进分生组织的确立第29-30页
        3.3 禾本科植物的花序发育和分生组织转换第30页
        3.4 玉米中花序发育过程中的原基调控第30-31页
        3.5 水稻中涉及调控枝梗原基的决定,维持和分化的基因第31-32页
        3.6 花序的形态建成和产量第32-34页
        3.7 花序的分支原基向颖花原基的转换第34页
        3.8 颖花原基的确立第34-35页
        3.9 小花原基的确定第35-36页
        3.10 C-Class MADS-box基因的功能第36页
        3.11 其他影响小花分生组织决定的基因第36-38页
    4 植物激素对花序发育的调控第38-40页
        4.1 生长素介导的分生组织的起始和增生第38页
        4.2 生长素的生物合成基因第38页
        4.3 生长素的体内转运基因第38-39页
        4.4 细胞分裂素促进生殖分生组织的增大第39-40页
        4.5 植物激素通路之间的交叉互作调控花序发育第40页
    5. 本课题的目的和意义第40-42页
第二章 调控水稻幼穗发育的关键性miRNA的鉴定第42-50页
    1 材料和方法第42-46页
        1.1 实验材料第42-43页
        1.2 幼穗总RNA的提取和定量分析第43页
        1.3 Northern Blot第43-46页
    2 结果与分析第46-49页
        2.1 YA、9311、HL-6穗型相关的农艺性状统计第46页
        2.2 miRNA的microarray分析表达量第46-47页
        2.3 荧光定量PCR(qRT-PCR)分析miRNA表达量第47-48页
        2.4 Northern Blot分析miRNA表达量第48-49页
    3. 讨论第49-50页
第三章 miR396和GRF6对水稻幼穗发育的遗传调控第50-75页
    1. 前言第50页
    2. 材料和方法第50-59页
        2.1 实验材料第50页
        2.2 质粒的小量制备(碱裂解法)第50-51页
        2.3 转化感受态第51-52页
        2.4 转化载体的构建第52-54页
        2.5 水稻的遗传转化及转基因植株的检测第54-57页
        2.6 遗传转化植株的RNA抽提及基因表达量检测第57-58页
        2.7 遗传转化植株和野生型农艺性状统计、小区产量统计分析第58-59页
    3. 结果与分析第59-72页
        3.1 miRNA的过表达转基因第59-60页
        3.2 miR396b过表达转基因植株的鉴定第60-62页
        3.3 miR396干涉转基因植株表型和表达量分析第62页
        3.4 miR396过表达和干涉转基因植株产量相关的农艺性状统计第62-64页
        3.5 GRF转基因表型鉴定和产量统计第64-70页
        3.6 MIM396、OEGRF6和OErGRF6转基因植株小区产量测试第70-72页
    4. 讨论第72-75页
第四章 miR396b/GRF6时空表达与调控幼穗发育的细胞学观察第75-95页
    1. 前言第75页
    2. 材料和方法第75-87页
        2.1 研究材料第75-76页
        2.2 幼穗RNA的提取第76页
        2.3 RACE对GRF家族剪切位点的鉴定第76-78页
        2.4 瞬时表达转基因系统构建第78-79页
        2.5 miRNA396和GRF6的原位杂交第79-86页
        2.6 扫描电子显微镜观察第86-87页
    3.结果第87-93页
        3.1 miR396和GRF家族的瞬时表达模式第87-91页
        3.2 原位杂交分析miR396b和GRF6幼穗中表达量第91-92页
        3.3 扫描电镜分析转基因幼穗发育过程中的形态变化第92-93页
    4. 讨论第93-95页
第五章 GRF6调控水稻幼穗发育的代谢通路分析第95-120页
    1 前言第95页
    2 材料和方法第95-102页
        2.1 材料第95页
        2.2 相关基因的定量分析第95页
        2.3 mRNA转录组分析第95-96页
        2.4 Chip-Seq启动子结合位点分析第96-99页
        2.5 水稻蛋白原核表达和纯化第99-100页
        2.6 凝胶阻滞实验(EMSA)第100-102页
        2.7 生长素测定第102页
    3 结果第102-118页
        3.1 OEmiR396b,MIM396和WT幼穗的基因表达差异第102-110页
        3.2 Chip-seq鉴定GRF6结合的启动子第110-114页
        3.3 RNA-Seq和Chip-Seq筛选到幼穗发育相关基因的表达情况第114-115页
        3.4 EMSA验证筛选到的GRF6调控基因第115-116页
        3.5 OEmiR396b,MIM396,OEGRF6和WT中生长素含量测定第116-118页
    4. 讨论第118-120页
第六章 总讨论第120-123页
参考文献第123-130页
附表第130-134页
博士在读期间发表的论文第134-135页
致谢第135页

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