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Ih型冰晶与黄粉虫抗冻蛋白相互作用的分子动力学模拟

摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
第一章 绪论第8-11页
    1.1 研究课题的背景第8-9页
    1.2 国内外研究现状第9-10页
    1.3 论文研究内容及安排第10-11页
第二章 分子动力学模拟理论基础第11-17页
    2.1 引言第11-12页
    2.2 分子动力学理论第12-14页
        2.2.1 运动方程数值求解方法第12-14页
        2.2.2 周期性边界条件(Periodicboundarycondition)第14页
    2.3 统计系综第14-15页
    2.4 系综温度耦合与压强耦合第15-17页
第三章 温度对Ih型冰晶的基面、棱面、二级棱面的作用第17-32页
    3.1 拟合体系相平衡线第17-23页
        3.1.1 水分子模型与参数第17-19页
        3.1.2 势能模型第19-20页
        3.1.3 模拟体系与模拟方法第20-21页
        3.1.4 体系(基面、棱面、二级棱面)的相平衡线第21-23页
    3.2 计算分析方法与步骤第23-25页
        3.2.1 径向分布函数(RadialDistributionFunction,RDF)第23-24页
        3.2.2 密度分布第24页
        3.2.3 均方位移(MeanSquareDisplacement,RDF)第24页
        3.2.4 扩散系数第24-25页
    3.3 结果与讨论第25-32页
        3.3.1 均方位移(MeanSquareDisplacement,MSD)第25-27页
        3.3.2 径向分布函数(Radialdistributionfunction,RDF)第27-29页
        3.3.3 密度分布第29-32页
第四章 退火时TmAFP的热滞活性第32-42页
    4.1 模型的建立与模拟方法第32-34页
    4.2 势能平衡线第34-35页
    4.3 结果与讨论第35-42页
        4.3.1 径向分布函数(Radialdistributionfunction,RDF)第35-37页
        4.3.2 均方位移(MeanSquareDisplacement,MSD)第37-40页
        4.3.3 标准偏差(RootMeanSquareFluctuation,RMDF)第40-42页
第五章 总结与展望第42-44页
    5.1 全文总结第42页
    5.2 工作展望第42-44页
参考文献第44-51页
致谢第51-52页
攻读硕士学位期间发表和完成的论文目录第52页

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