| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-32页 |
| 1 瘤胃微生物对牧草细胞壁降解的研究进展 | 第11-19页 |
| 1.1 牧草组织及细胞壁结构 | 第11-14页 |
| 1.1.1 牧草组织结构 | 第11-13页 |
| 1.1.2 牧草细胞壁结构 | 第13-14页 |
| 1.2 瘤胃中降解植物细胞壁的微生物 | 第14-16页 |
| 1.2.1 细菌 | 第14-15页 |
| 1.2.2 真菌 | 第15页 |
| 1.2.3 原虫 | 第15-16页 |
| 1.3 瘤胃微生物对细胞壁的降解 | 第16-19页 |
| 1.3.1 细胞壁组织结构的变化 | 第16-17页 |
| 1.3.2 细胞壁纤维成分降解 | 第17-19页 |
| 2 分子生物学方法对瘤胃微生物多样性的研究进展 | 第19-26页 |
| 2.1 瘤胃微生物定量分析 | 第19-21页 |
| 2.1.1 斑点杂交 | 第19-20页 |
| 2.1.2 荧光原位杂交 | 第20页 |
| 2.1.3 竞争性定量PCR | 第20-21页 |
| 2.1.4 实时荧光定量PCR | 第21页 |
| 2.2 瘤胃微生物多样性指纹图谱技术 | 第21-23页 |
| 2.2.1 变性/温度梯度凝胶电泳 | 第21-22页 |
| 2.2.2 核糖体间隔基因分析 | 第22页 |
| 2.2.3 末端限制性片段长度多态性技术 | 第22-23页 |
| 2.3 宏基因组学研究 | 第23-26页 |
| 2.3.1 宏基因组学简介 | 第23页 |
| 2.3.2 宏基因组学研究策略 | 第23-24页 |
| 2.3.3 基于新一代测序技术的研究策略 | 第24页 |
| 2.3.4 高通量测序技术在宏基因组学研究中的应用 | 第24-26页 |
| 3 牧草来源对奶牛瘤胃发酵、微生物蛋白合成和瘤胃微生物的研究进展 | 第26-31页 |
| 3.1 不同牧草来源日粮对瘤胃发酵的影响 | 第26-27页 |
| 3.2 不同牧草来源日粮对微生物蛋白合成的影响 | 第27页 |
| 3.3 不同牧草来源日粮对瘤胃微生物区系的影响 | 第27-31页 |
| 3.3.1 瘤胃微生物区系组成 | 第27-28页 |
| 3.3.2 日粮对微生物区系的影响 | 第28-31页 |
| 4 本研究目的与意义 | 第31-32页 |
| 第二章 瘤胃微生物对不同牧草动态降解特性及组织结构变化的研究 | 第32-54页 |
| 1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 1.1 试验动物和饲养管理 | 第32页 |
| 1.2 试验材料 | 第32-33页 |
| 1.3 DM和NDF瘤胃降解率和降解参数 | 第33页 |
| 1.4 电镜样品的制备与观察 | 第33-34页 |
| 1.4.1 牧草茎秆的降解 | 第33-34页 |
| 1.4.2 扫描电镜样品的制备 | 第34页 |
| 1.4.3 透射电镜样品的制备 | 第34页 |
| 1.5 数据分析 | 第34页 |
| 2 结果与分析 | 第34-48页 |
| 2.1 不同牧草茎秆DM降解率和降解参数 | 第34-35页 |
| 2.2 不同牧草茎秆NDF降解率和降解参数 | 第35-36页 |
| 2.3 苜蓿茎秆组织结构的降解 | 第36-40页 |
| 2.3.1 扫描电镜下苜蓿茎秆组织结构的降解 | 第36-37页 |
| 2.3.2 透射电镜下苜蓿茎秆组织结构的降解 | 第37-40页 |
| 2.4 燕麦草茎秆组织结构的降解 | 第40-44页 |
| 2.4.1 扫描电镜下燕麦草茎秆组织结构的降解 | 第40页 |
| 2.4.2 透射电镜下燕麦草茎秆组织结构的降解 | 第40-44页 |
| 2.5 羊草茎秆组织结构的降解 | 第44-47页 |
| 2.5.1 扫描电镜下羊草茎秆组织结构的降解 | 第44页 |
| 2.5.2 透射电镜下羊草茎秆组织结构的降解 | 第44-47页 |
| 2.6 稻草茎秆组织结构的降解 | 第47-48页 |
| 2.6.1 扫描电镜下稻草茎秆组织结构的降解 | 第47-48页 |
| 2.6.2 透射电镜下稻草茎秆组织结构的降解 | 第48页 |
| 3 讨论 | 第48-53页 |
| 3.1 瘤胃微生物对苜蓿茎秆降解的影响 | 第48-50页 |
| 3.2 瘤胃微生物对燕麦草茎秆降解的影响 | 第50-51页 |
| 3.3 瘤胃微生物对羊草茎秆降解的影响 | 第51-52页 |
| 3.4 瘤胃微生物对稻草茎秆降解的影响 | 第52-53页 |
| 4 小结 | 第53-54页 |
| 第三章 吸附在牧草细胞壁中的细菌群落结构研究 | 第54-71页 |
| 1 材料与设备 | 第54-55页 |
| 1.1 主要试剂和药品 | 第54-55页 |
| 1.2 主要仪器和设备 | 第55页 |
| 2 材料与方法 | 第55-58页 |
| 2.1 试验动物和饲养管理 | 第55页 |
| 2.2 试验材料 | 第55页 |
| 2.3 试验步骤 | 第55-56页 |
| 2.4 牧草中微生物混合总DNA的提取 | 第56页 |
| 2.5 PCR扩增及胶回收纯化 | 第56-57页 |
| 2.6 构建文库并测序 | 第57-58页 |
| 3 数据处理与分析 | 第58-60页 |
| 3.1 序列处理 | 第58-59页 |
| 3.2 优质序列的生物信息学处理 | 第59页 |
| 3.3 数据统计和分析 | 第59-60页 |
| 4 结果与分析 | 第60-68页 |
| 4.1 细菌丰富度和多样性 | 第60-63页 |
| 4.2 细菌组成和群落结构 | 第63-65页 |
| 4.3 处理组间的相似性分析 | 第65-68页 |
| 5 讨论 | 第68-70页 |
| 6 小结 | 第70-71页 |
| 第四章 不同牧草来源日粮对奶牛瘤胃发酵、微生物蛋白合成和细菌群落结构的影响 | 第71-85页 |
| 1 材料与方法 | 第71-75页 |
| 1.1 试验动物、日粮及饲养管理 | 第71-73页 |
| 1.2 试验设计 | 第73页 |
| 1.3 样品采集与测定 | 第73-75页 |
| 1.3.1 饲料及剩料样品采集与分析 | 第73页 |
| 1.3.2 尿样采集和嘌呤衍生物的测定 | 第73页 |
| 1.3.3 微生物蛋白产量的计算 | 第73-74页 |
| 1.3.4 瘤胃液样品采集及分析 | 第74-75页 |
| 2 统计分析 | 第75页 |
| 3 结果与分析 | 第75-82页 |
| 3.1 不同牧草来源日粮对瘤胃发酵的影响 | 第75-76页 |
| 3.2 不同牧草来源日粮对微生物蛋白合成的影响 | 第76页 |
| 3.3 不同牧草来源日粮对瘤胃细菌群落结构的影响 | 第76-82页 |
| 3.3.1 细菌丰富度和多样性 | 第76-77页 |
| 3.3.2 细菌组成和群落结构 | 第77-79页 |
| 3.3.3 处理组间的相似性分析 | 第79-82页 |
| 4 讨论 | 第82-84页 |
| 4.1 不同牧草来源日粮对瘤胃发酵的影响 | 第82页 |
| 4.2 不同牧草来源日粮对微生物蛋白合成的影响 | 第82-83页 |
| 4.3 不同牧草来源日粮对瘤胃细菌群落结构的影响 | 第83-84页 |
| 5 小结 | 第84-85页 |
| 结论、创新点和后续研究展望 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-100页 |
| 致谢 | 第100-103页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第103-105页 |
