| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-30页 |
| 0 前言 | 第14页 |
| 1. 三疣梭子蟹分子遗传标记应用进展 | 第14-22页 |
| 1.1 mtDNA（mitochondrial DNA） | 第14-15页 |
| 1.2 RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) | 第15页 |
| 1.3 AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms)技术 | 第15-16页 |
| 1.4 SSR (Simple Sequence Repeat)技术 | 第16-21页 |
| 1.4.1 微卫星序列的产生 | 第17页 |
| 1.4.2 微卫星标记的优缺点 | 第17-18页 |
| 1.4.3 三疣梭子蟹微卫星标记开发和多态性筛选 | 第18-19页 |
| 1.4.4 微卫星标记应用于三疣梭子蟹亲缘关系分析 | 第19-20页 |
| 1.4.5 微卫星标记应用于三疣梭子蟹遗传多样性分析和群体结构分析 | 第20页 |
| 1.4.6 小结 | 第20-21页 |
| 1.5 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)技术 | 第21-22页 |
| 2. 遗传连锁图谱构建 | 第22-26页 |
| 2.1 构建遗传连锁图谱的原理 | 第22页 |
| 2.2 构建遗传连锁图谱遗传标记的选择 | 第22-23页 |
| 2.3 构建遗传连锁图谱作图群体的选择 | 第23-24页 |
| 2.3.1 作图群体亲本的选择 | 第23页 |
| 2.3.2 分离群体类型的选择 | 第23-24页 |
| 2.3.3 确定作图群体的大小 | 第24页 |
| 2.4 数据统计和连锁分析 | 第24-25页 |
| 2.5 遗传连锁图谱的应用 | 第25-26页 |
| 2.5.1 数量性状基因定位（QTL mapping） | 第25页 |
| 2.5.2 定位克隆（Positional Cloning） | 第25页 |
| 2.5.3 比较基因组作图(Comparative Genome Mapping) | 第25-26页 |
| 2.5.4 标记辅助选择(Marker-Assisted Selection，MAS) | 第26页 |
| 3. 数量性状位点（Quantitative Trait Locus, QTL）定位 | 第26-30页 |
| 3.1 QTL 定位的原理 | 第26页 |
| 3.2 QTL 定位的方法 | 第26-28页 |
| 3.2.1 单标记作图法 | 第26页 |
| 3.2.2 区间作图法 | 第26-27页 |
| 3.2.3 复合区间作图法 | 第27页 |
| 3.2.4 多区间作图法 | 第27-28页 |
| 3.3 主要水产生物 QTL 研究进展 | 第28-30页 |
| 第二章 三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析 | 第30-47页 |
| 1. 材料与方法 | 第31-38页 |
| 1.1 实验材料 | 第31-33页 |
| 1.1.1 实验蟹的培育 | 第31页 |
| 1.1.2 实验仪器 | 第31页 |
| 1.1.3 实验试剂 | 第31-33页 |
| 1.2 方法 | 第33-38页 |
| 1.2.1 生长性状的测量和个体获得 | 第33页 |
| 1.2.2 基因组 DNA 的提取 | 第33-34页 |
| 1.2.3 PCR 反应条件 | 第34-35页 |
| 1.2.4 变性聚丙烯酰胺凝胶检测 | 第35页 |
| 1.2.5 银染 | 第35-38页 |
| 1.2.6 统计分析 | 第38页 |
| 2. 结果与分析 | 第38-44页 |
| 2.1 PCR 扩增结果和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果 | 第38-39页 |
| 2.2 遗传多样性分析 | 第39-41页 |
| 2.3 三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析 | 第41页 |
| 2.4 显著相关的标记位点各基因型间重要经济性状的多重比较 | 第41-44页 |
| 3. 讨论 | 第44-47页 |
| 3.1 微卫星标记应用于三疣梭子蟹近交家系生长相关性状的连锁分析 | 第44页 |
| 3.2 三疣梭子蟹家系遗传多样分析 | 第44-45页 |
| 3.3 生长相关性状和微卫星标记的相关性 | 第45-47页 |
| 第三章 三疣梭子蟹遗传连锁图谱的构建 | 第47-71页 |
| 1. 实验材料 | 第48-53页 |
| 1.1 实验个体取得 | 第48页 |
| 1.2 DNA 提取 | 第48页 |
| 1.3 AFLP 分析 | 第48-52页 |
| 1.3.1 主要试剂的配置 | 第48-49页 |
| 1.3.2 AFLP 技术程序 | 第49-52页 |
| 1.4 SSR 分析 | 第52页 |
| 1.5 数据统计和连锁分析 | 第52-53页 |
| 2. 实验结果 | 第53-68页 |
| 2.1 AFLP 扩增结果 | 第53-57页 |
| 2.1.2 酶切结果 | 第53-54页 |
| 2.1.3 预扩增结果 | 第54页 |
| 2.1.4 选扩增结果 | 第54-57页 |
| 2.2 遗传连锁图谱分析 | 第57页 |
| 2.3 基因组长度及图谱覆盖率 | 第57-68页 |
| 3. 讨论 | 第68-70页 |
| 4. 结论 | 第70-71页 |
| 第四章 三疣梭子蟹生长相关性状的 QTL 定位 | 第71-86页 |
| 1. 实验材料和方法 | 第72-74页 |
| 1.1 个体取得、性状测量和 DNA 提取 | 第72-73页 |
| 1.2 各性状数据处理 | 第73页 |
| 1.3 QTL 位点检测 | 第73-74页 |
| 2. 实验结果 | 第74-82页 |
| 2.1 性状分布及相关分析 | 第74-76页 |
| 2.2 QTL 定位 | 第76-82页 |
| 3. 讨论 | 第82-86页 |
| 3.1 QTL 定位在甲壳动物中的研究应用 | 第82-83页 |
| 3.2 三疣梭子蟹 QTL 定位研究 | 第83-84页 |
| 3.3 相关性状 QTL 和遗传效应分析 | 第84-85页 |
| 3.4 展望三疣梭子蟹分子标记辅助育种（MAS） | 第85-86页 |
| 附章 应用离群筛选法和 5000 个 SNP 标记筛选大西洋鲑生长和抗病性状相关位点 | 第86-109页 |
| 1. 材料和方法 | 第88-93页 |
| 1.1 样品取得和 SNP 基因分型 | 第88-89页 |
| 1.2 群体遗传结构分析 | 第89-91页 |
| 1.3 群体遗传距离分析 | 第91页 |
| 1.4 多样化选择下的位点检测 | 第91-92页 |
| 1.5 BLAST 比对和离群位点染色体定位 | 第92-93页 |
| 2. 结果 | 第93-105页 |
| 2.1 基因分型 | 第93页 |
| 2.2 群体遗传结构分析 | 第93-97页 |
| 2.3 离群位点检测和同源性分析 | 第97-105页 |
| 3. 讨论 | 第105-109页 |
| 总结 | 第109-111页 |
| 1. DNA 分子标记与性状相关分析的可行性 | 第109页 |
| 2. 性状分化明显的作图群体，大量共显性标记的使用和高密度要求是未来三疣梭子蟹遗传连锁图谱构建的方向 | 第109-110页 |
| 3. 如何利用获得的 QTL 进行后续研究 | 第110页 |
| 4. “离群筛选法”的应用 | 第110-111页 |
| 附件 | 第111-127页 |
| 参考文献 | 第127-147页 |
| 致谢 | 第147-149页 |
| 个人简历 | 第149-150页 |
| 学术论文 | 第150-151页 |
