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三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)遗传连锁图谱的构建和生长相关性状QTL定位的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第14-30页
    0 前言第14页
    1. 三疣梭子蟹分子遗传标记应用进展第14-22页
        1.1 mtDNA(mitochondrial DNA)第14-15页
        1.2 RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)第15页
        1.3 AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms)技术第15-16页
        1.4 SSR (Simple Sequence Repeat)技术第16-21页
            1.4.1 微卫星序列的产生第17页
            1.4.2 微卫星标记的优缺点第17-18页
            1.4.3 三疣梭子蟹微卫星标记开发和多态性筛选第18-19页
            1.4.4 微卫星标记应用于三疣梭子蟹亲缘关系分析第19-20页
            1.4.5 微卫星标记应用于三疣梭子蟹遗传多样性分析和群体结构分析第20页
            1.4.6 小结第20-21页
        1.5 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)技术第21-22页
    2. 遗传连锁图谱构建第22-26页
        2.1 构建遗传连锁图谱的原理第22页
        2.2 构建遗传连锁图谱遗传标记的选择第22-23页
        2.3 构建遗传连锁图谱作图群体的选择第23-24页
            2.3.1 作图群体亲本的选择第23页
            2.3.2 分离群体类型的选择第23-24页
            2.3.3 确定作图群体的大小第24页
        2.4 数据统计和连锁分析第24-25页
        2.5 遗传连锁图谱的应用第25-26页
            2.5.1 数量性状基因定位(QTL mapping)第25页
            2.5.2 定位克隆(Positional Cloning)第25页
            2.5.3 比较基因组作图(Comparative Genome Mapping)第25-26页
            2.5.4 标记辅助选择(Marker-Assisted Selection,MAS)第26页
    3. 数量性状位点(Quantitative Trait Locus, QTL)定位第26-30页
        3.1 QTL 定位的原理第26页
        3.2 QTL 定位的方法第26-28页
            3.2.1 单标记作图法第26页
            3.2.2 区间作图法第26-27页
            3.2.3 复合区间作图法第27页
            3.2.4 多区间作图法第27-28页
        3.3 主要水产生物 QTL 研究进展第28-30页
第二章 三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析第30-47页
    1. 材料与方法第31-38页
        1.1 实验材料第31-33页
            1.1.1 实验蟹的培育第31页
            1.1.2 实验仪器第31页
            1.1.3 实验试剂第31-33页
        1.2 方法第33-38页
            1.2.1 生长性状的测量和个体获得第33页
            1.2.2 基因组 DNA 的提取第33-34页
            1.2.3 PCR 反应条件第34-35页
            1.2.4 变性聚丙烯酰胺凝胶检测第35页
            1.2.5 银染第35-38页
            1.2.6 统计分析第38页
    2. 结果与分析第38-44页
        2.1 PCR 扩增结果和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果第38-39页
        2.2 遗传多样性分析第39-41页
        2.3 三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析第41页
        2.4 显著相关的标记位点各基因型间重要经济性状的多重比较第41-44页
    3. 讨论第44-47页
        3.1 微卫星标记应用于三疣梭子蟹近交家系生长相关性状的连锁分析第44页
        3.2 三疣梭子蟹家系遗传多样分析第44-45页
        3.3 生长相关性状和微卫星标记的相关性第45-47页
第三章 三疣梭子蟹遗传连锁图谱的构建第47-71页
    1. 实验材料第48-53页
        1.1 实验个体取得第48页
        1.2 DNA 提取第48页
        1.3 AFLP 分析第48-52页
            1.3.1 主要试剂的配置第48-49页
            1.3.2 AFLP 技术程序第49-52页
        1.4 SSR 分析第52页
        1.5 数据统计和连锁分析第52-53页
    2. 实验结果第53-68页
        2.1 AFLP 扩增结果第53-57页
            2.1.2 酶切结果第53-54页
            2.1.3 预扩增结果第54页
            2.1.4 选扩增结果第54-57页
        2.2 遗传连锁图谱分析第57页
        2.3 基因组长度及图谱覆盖率第57-68页
    3. 讨论第68-70页
    4. 结论第70-71页
第四章 三疣梭子蟹生长相关性状的 QTL 定位第71-86页
    1. 实验材料和方法第72-74页
        1.1 个体取得、性状测量和 DNA 提取第72-73页
        1.2 各性状数据处理第73页
        1.3 QTL 位点检测第73-74页
    2. 实验结果第74-82页
        2.1 性状分布及相关分析第74-76页
        2.2 QTL 定位第76-82页
    3. 讨论第82-86页
        3.1 QTL 定位在甲壳动物中的研究应用第82-83页
        3.2 三疣梭子蟹 QTL 定位研究第83-84页
        3.3 相关性状 QTL 和遗传效应分析第84-85页
        3.4 展望三疣梭子蟹分子标记辅助育种(MAS)第85-86页
附章 应用离群筛选法和 5000 个 SNP 标记筛选大西洋鲑生长和抗病性状相关位点第86-109页
    1. 材料和方法第88-93页
        1.1 样品取得和 SNP 基因分型第88-89页
        1.2 群体遗传结构分析第89-91页
        1.3 群体遗传距离分析第91页
        1.4 多样化选择下的位点检测第91-92页
        1.5 BLAST 比对和离群位点染色体定位第92-93页
    2. 结果第93-105页
        2.1 基因分型第93页
        2.2 群体遗传结构分析第93-97页
        2.3 离群位点检测和同源性分析第97-105页
    3. 讨论第105-109页
总结第109-111页
    1. DNA 分子标记与性状相关分析的可行性第109页
    2. 性状分化明显的作图群体,大量共显性标记的使用和高密度要求是未来三疣梭子蟹遗传连锁图谱构建的方向第109-110页
    3. 如何利用获得的 QTL 进行后续研究第110页
    4. “离群筛选法”的应用第110-111页
附件第111-127页
参考文献第127-147页
致谢第147-149页
个人简历第149-150页
学术论文第150-151页

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