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心叶烟RNA依赖的RNA聚合酶6(NgRDR6)基因的分离及功能分析

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-15页
1 前言第15-24页
   ·RNA 依赖的RNA 聚合酶的命名及其分类第15-16页
   ·RDRs 的分离鉴定第16-17页
   ·RDRs 的结构特点第17-18页
   ·RDRs 的诱导表达图谱第18-19页
     ·生物胁迫诱导因子第18页
     ·非生物胁迫诱导因子第18-19页
   ·RDRs 的生物学功能第19-23页
     ·RDRs 在植物RNA 沉默中的作用第19-21页
       ·RNA 沉默的定义及分类第19页
       ·参与RNA 沉默的细胞组分第19页
       ·RDRs 的作用机制第19-21页
     ·RDR6 与植物生长发育调节第21页
     ·RDRs 与DNA 甲基化第21页
     ·RDRs 在沉默信号长距离传输中的作用第21-22页
     ·RDRs 在植物抗病毒中的作用第22-23页
     ·RDRs 的其它生物学功能第23页
   ·本课题研究的目的及意义第23-24页
2 材料与方法第24-46页
   ·实验材料第24-27页
     ·植物材料第24页
     ·植物材料培养与处理第24页
     ·菌株与质粒第24页
     ·酶与各种生化试剂第24-25页
     ·PCR 引物第25-27页
   ·实验方法第27-46页
     ·植物总RNA 的提取及检测第27-29页
       ·利用RNeasy Plant Mini Kit 提取总RNA第27-28页
       ·利用TRIZOL 试剂盒提取RNA第28页
       ·甲醛变性凝胶进行RNA 电泳第28-29页
     ·cDNA 第一链的合成第29-30页
     ·cDNA 回收纯化第30页
     ·cDNA 的5′加尾反应第30-31页
     ·cDNA 全长序列的获得第31-34页
       ·NgRDR6 中间片段的获得第31页
       ·RACE 法获得5′端序列第31-32页
       ·RACE 法获得3′端序列第32-33页
       ·cDNA 全长序列的获得第33-34页
     ·电泳目的片段的回收第34页
     ·DNA 片段与克隆载体的连接第34-35页
     ·大肠杆菌感受态细胞制备第35页
     ·大肠杆菌感受态细胞的转化第35页
     ·质粒DNA 的提取第35-38页
       ·碱法小量提取质粒DNA第35-36页
       ·大量提取质粒DNA第36-37页
       ·试剂盒质粒微量提取方案第37-38页
     ·对重组质粒的酶切鉴定第38-39页
     ·NgRDR6 全长基因组序列的获得第39-40页
       ·CTAB 法提取烟草基因组总DNA第39页
       ·总DNA 提取产物的纯化第39-40页
     ·NgRDR6 基因启动子的克隆第40-42页
       ·NgRDR6 基因启动子的反向PCR 扩增第40-42页
       ·上游启动子序列的分析第42页
     ·半定量RT-PCR 分析第42页
       ·总RNA 的提取第42页
       ·琼脂糖甲醛变性胶电泳第42页
       ·反转录cDNA 第一条链的合成第42页
       ·半定量RT-PCR 检测第42页
     ·植物表达载体的构建与转化第42-46页
       ·植物正义表达载体的构建第42-43页
       ·农杆菌感受态细胞的制备第43-44页
       ·冻融法转化农杆菌第44页
       ·农杆菌介导转化烟草第44-46页
3 结果与分析第46-66页
   ·心叶烟RDR6 基因的分离第46-48页
     ·总RNA 的提取及反转录第46页
     ·心叶烟RDR6 基因中间片段的获得第46-47页
     ·NgRDR6 3′片段的分离第47页
     ·NgRDR6 5′片段的分离第47-48页
     ·NgRDR6 全长cDNA 序列的获得第48页
   ·NgRDR6 基因序列分析第48-56页
     ·NgRDR6 cDNA 全长序列分析第48-53页
     ·NgRDR6 蛋白质序列分析第53-56页
   ·NgRDR6 基因组序列的克隆及其结构分析第56页
   ·NgRDR6 mRNA 水平的表达图谱分析第56-58页
     ·NgRDR6 在非生物因素诱导下的表达情况第57页
     ·NgRDR6 在生物因素诱导下的表达情况第57-58页
   ·NgRDR6 转基因植株的获得及其功能分析第58-62页
     ·表达载体的构建第59页
     ·转基因植株的获得第59-60页
     ·T0 代转基因植株的鉴定第60页
     ·转基因植株的半定量RT-PCR 分析第60-61页
     ·T1 代转基因植株的鉴定及转基因植株的功能分析第61-62页
       ·T1 代转基因植株的PCR 鉴定第61页
       ·NgRDR6 在植物抗病毒中的作用第61-62页
   ·NgRDR6 启动子的克隆及其缺失分析第62-65页
     ·NgRDR6 启动子的克隆及其序列分析第62-64页
     ·NgRDR6 启动子的缺失表达载体的构建第64-65页
     ·NgRDR6 启动子的缺失表达转基因拟南芥的获得第65页
   ·下一步实验计划第65-66页
4 讨论第66-70页
   ·NgRDR6 基因的克隆及其序列分析第66页
   ·NgRDR6 的表达特异性分析第66-68页
   ·NgRDR6 基因启动子顺式作用元件预测及分析第68页
   ·NgRDR6 T1 代转基因烟草的抗性分析第68-70页
小结第70-71页
参考文献第71-81页
附录第81-83页
致谢第83-84页
攻读学位期间发表论文情况第84页

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