| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-15页 |
| 1 引言 | 第15-35页 |
| ·生物信息学的概况 | 第15-21页 |
| ·生物信息学的定义 | 第15-16页 |
| ·生物信息学所用的方法和技术 | 第16-17页 |
| ·数学统计方法 | 第16页 |
| ·动态规划方法 | 第16页 |
| ·模式识别技术 | 第16页 |
| ·数据库技术 | 第16-17页 |
| ·人工神经网络技术 | 第17页 |
| ·分子模型化技术 | 第17页 |
| ·Internet 技术 | 第17页 |
| ·进化树 | 第17-21页 |
| ·序列进化树 | 第18-19页 |
| ·进化树搜索 | 第19-20页 |
| ·确定树根 | 第20页 |
| ·评估进化树和数据 | 第20-21页 |
| ·结构进化树 | 第21页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸的研究进展 | 第21-30页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸的分类 | 第21-23页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸的生理功能 | 第23-24页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸的来源 | 第24-25页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸的生物合成途径 | 第25-27页 |
| ·长链多不饱和脂肪酸在转基因植物中的合成 | 第27-30页 |
| ·脂肪酸去饱和酶和链延长酶 | 第30-34页 |
| ·脂肪酸去饱和酶的分类及研究进展 | 第30-32页 |
| ·脂肪酸链延长酶的分类及研究进展 | 第32-34页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第34-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-57页 |
| ·材料 | 第35-40页 |
| ·软件和网络资源 | 第35-36页 |
| ·真菌材料 | 第36页 |
| ·质粒、菌株及培养条件 | 第36页 |
| ·实验引物 | 第36-37页 |
| ·工具酶和主要分子生物学试剂 | 第37-38页 |
| ·溶液的配制 | 第38-39页 |
| ·主要仪器 | 第39-40页 |
| ·实验方法 | 第40-57页 |
| ·Clustal 的使用 | 第40-41页 |
| ·Phylip 系统发育树 | 第41-42页 |
| ·Mega4.0 构建系统发生树的方法 | 第42-43页 |
| ·本地BLAST 方法 | 第43页 |
| ·Phytophthora infestans 脂肪酸成分测定 | 第43页 |
| ·总RNA 的提取及检测 | 第43-46页 |
| ·反转录cDNA 第一条链的合成 | 第46页 |
| ·目的基因全长cDNA 的获得 | 第46-52页 |
| ·各基因在酿酒酵母中的表达 | 第52-57页 |
| 3 结果与分析 | 第57-85页 |
| ·去饱和酶的生物信息学分析 | 第57-64页 |
| ·去饱和酶基因的搜索 | 第57-58页 |
| ·去饱和酶进化树的构建 | 第58-59页 |
| ·去饱和酶进化树的分析 | 第59-64页 |
| ·Pinfestans 亚家族在进化过程中的独特地位 | 第59-61页 |
| ·Front-end 去饱和酶亚家族进化历程 | 第61-62页 |
| ·Omega 去饱和酶亚家族进化历程 | 第62-63页 |
| ·First 去饱和酶亚家族进化历程 | 第63-64页 |
| ·其它去饱和酶亚家族进化历程 | 第64页 |
| ·链延长酶的生物信息学分析 | 第64-67页 |
| ·链延长酶基因的搜索 | 第64-65页 |
| ·链延长酶进化树的构建 | 第65-66页 |
| ·链延长酶进化树的分析 | 第66-67页 |
| ·PUFA 链延长酶亚家族进化历程 | 第66-67页 |
| ·S/MUFA 链延长酶亚家族进化历程 | 第67页 |
| ·Phytophthora infestan 中去饱和酶和链延长酶的进化历程比较 | 第67-68页 |
| ·Phytophthora infestans 中EPA 合成途径中的链延长与去饱和酶基因的克隆与鉴定 | 第68-85页 |
| ·Phytophthora infestans 脂肪酸成分的测定 | 第68-69页 |
| ·Phytophthora infestans 全长cDNA 的获得 | 第69-70页 |
| ·Phytophthora infestans 链延长与去饱和酶基因的RT-PCR 扩增 | 第70-73页 |
| ·各目的基因克隆载体的构建 | 第73-76页 |
| ·各目的基因的序列测定及分析 | 第76-78页 |
| ·各目的基因在酵母中的功能鉴定 | 第78-85页 |
| ·各目的基因表达载体的构建 | 第78-79页 |
| ·各目的基因的酵母转化 | 第79-80页 |
| ·各基因在酵母中的表达分析 | 第80-85页 |
| 4 讨论 | 第85-90页 |
| ·去饱和酶和链延长酶在进化历程中有两次主要分化 | 第85页 |
| ·Phytophthora infestans中去饱和酶和链延长酶的进化特点 | 第85-86页 |
| ·Phytophthora infestans中PinE3基因的表达调控机制 | 第86-87页 |
| ·Phytophthora infestans 中EPA 的合成水平受多种环境因素影响 | 第87-88页 |
| ·Phytophthora infestans中EPA合成代谢途径 | 第88-89页 |
| ·生物信息学分析结果评价 | 第89-90页 |
| 5 结论 | 第90-92页 |
| 参考文献 | 第92-104页 |
| 附录 | 第104-131页 |
| 致谢 | 第131页 |
