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引起葡萄卷叶及环斑症状的病毒种类鉴定及其分子特性研究

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第12-13页
第一章 文献综述第13-31页
    1.1 葡萄病毒病害的发生与危害第13-17页
        1.1.1 葡萄卷叶病的发生与危害第13-14页
        1.1.2 葡萄扇叶退化病的发生和危害第14-15页
        1.1.3 葡萄皱木复合病的发生和危害第15页
        1.1.4 其它葡萄病毒病的发生与危害第15-17页
    1.2 主要葡萄病毒种类及其分类地位第17-21页
        1.2.1 葡萄卷叶相关病毒第18页
        1.2.2 葡萄扇叶退化病相关病毒第18-19页
        1.2.3 葡萄皱木复合病相关病毒第19-20页
        1.2.4 近几年新报道的葡萄病毒第20-21页
    1.3 葡萄病毒的鉴定方法第21-25页
        1.3.1 指示植物鉴定法第21-22页
        1.3.2 ELISA检测方法第22页
        1.3.3 RT-PCR检测方法第22-23页
        1.3.4 分子杂交检测方法第23-24页
        1.3.5 逆转录环介导恒温扩增检测技术第24-25页
        1.3.6 高通量测序方法第25页
    1.4 植物病毒的遗传多样性第25-28页
        1.4.1 RNA病毒的进化第26页
        1.4.2 病毒的基因重组第26-27页
        1.4.3 葡萄卷叶相关病毒遗传多样性研究第27-28页
    1.5 我国葡萄病毒的发生及研究概况第28-29页
    1.6 本研究的目的和意义第29-31页
第二章 我国葡萄卷叶相关病毒的检测及其遗传多样性分析第31-58页
    2.1 材料和方法第31-38页
        2.1.1 植物材料第31-32页
        2.1.2 所用试剂第32页
        2.1.3 RNA提取第32-33页
        2.1.4 RT-PCR和RT-n PCR检测第33-35页
        2.1.5 基因克隆与测序第35-37页
        2.1.6 序列分析第37-38页
    2.2 结果与分析第38-55页
        2.2.1 GLRa V-1、4、7 的RT-PCR和RT-n PCR检测结果第38页
        2.2.2 不同葡萄栽培品种的病毒检测结果第38-39页
        2.2.3 GLRa V-1 的基因变异及遗传多样性分析第39-46页
        2.2.4 GLRa V-4 的基因变异及遗传多样性分析第46-50页
        2.2.5 GLRa V-7 的基因变异及遗传多样性分析第50-55页
    2.3 讨论第55-58页
第三章 引起葡萄环斑症状的病原病毒种类鉴定第58-86页
    3.1 材料和方法第59-69页
        3.1.1 植物材料第59页
        3.1.2 所用试剂第59-60页
        3.1.3 小RNA测序及数据分析第60页
        3.1.4 双生病毒基因组的PCR扩增第60-62页
        3.1.5 RCA扩增及其产物的酶切鉴定第62页
        3.1.6 酶切产物的克隆及测序第62-64页
        3.1.7 GINV基因组的PCR扩增第64-66页
        3.1.8 GINV基因组 5’和 3’末端序列扩增第66-68页
        3.1.9 葡萄样品中GLGV的检测第68页
        3.1.10 基因克隆及测序第68页
        3.1.11 序列分析第68-69页
    3.2 结果与分析第69-83页
        3.2.1 葡萄样品的小RNA测序结果第69-72页
        3.2.2 安尼斯基葡萄样品中双生病毒基因组PCR扩增及测序第72-73页
        3.2.3 双生病毒的RCA扩增、酶切鉴定及测序第73-74页
        3.2.4 双生病毒的基因组及序列分析第74-75页
        3.2.5 GLGV与其他双生病毒成员的系统遗传进化树分析第75-77页
        3.2.6 安尼斯基和贝达葡萄样品中GINV的全长基因组及序列分析第77-80页
        3.2.7 GINV分离物与发状病毒属其他成员的系统进化树分析第80-81页
        3.2.8 来源GLGV和GINV的小RNA分析第81-82页
        3.2.9 葡萄样品中GLGV的检测结果第82-83页
    3.3 讨论第83-86页
第四章 GINV中国分离物的检测及遗传多样性研究第86-95页
    4.1 材料和方法第86-88页
        4.1.1 植物材料第86页
        4.1.2 所用试剂第86-87页
        4.1.3 GINV中国分离物的RT-PCR检测第87页
        4.1.4 GINV分离物基因克隆测序及序列分析第87-88页
    4.2 结果与分析第88-93页
        4.2.1 葡萄样品中GINV的检测结果第88页
        4.2.2 GINV的基因序列分析第88-91页
        4.2.3 GINV分离物的基因系统进化分析第91-93页
    4.3 讨论第93-95页
第五章 全文结论及展望第95-97页
参考文献第97-112页
附录1 GLRa V-1、4、7 的检测结果第112-130页
附录2 田间无核白葡萄表现的环斑症状第130-131页
附录3 葡萄潜隐双生病毒GLGV的全基因组及一个缺陷分子的基因序列第131-132页
附录4 双生病毒属病毒的CP和Rep基因氨基酸序列的遗传进化树分析第132-133页
附录5 中国GINV分离物LN_BETA_RS和LN_ANSJ_RS与日本分离物(D88448)的RP、MP和CP基因的氨基酸同源性比对图第133-139页
附录6 195 个葡萄样品中GINV的检测结果第139-148页
附录7 主要溶液配方第148-149页
附录8 研究生期间已发表论文第149-150页
致谢第150-152页

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