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蛋白质相互作用预测及Hub蛋白分类与作用规律研究

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
1 引言第9-18页
   ·背景第9-10页
   ·研究现状第10-16页
     ·蛋白质相互作用的研究方法第10-15页
     ·蛋白质相互作用网络的研究第15-16页
   ·研究的目的及意义第16页
   ·主要研究内容及构成第16-18页
2 本工作中使用到的数据库第18-23页
   ·蛋白质相互作用数据库——DIP第18-19页
   ·人类蛋白质相互作用数据库——HPRD第19-20页
   ·蛋白质二级结构数据库——DSSP第20-21页
   ·基因产物注释信息数据库——GO第21-23页
3 使用贝叶斯网络预测蛋白质相互作用第23-32页
   ·数据挖掘概述第23-24页
     ·数据挖掘的基本概念第23页
     ·数据挖掘的一般流程第23-24页
   ·数据的获得与处理第24-27页
     ·数据的获得第24页
     ·特征抽提第24-25页
     ·数据集的构建第25-27页
   ·贝叶斯网络分类器第27-29页
     ·贝叶斯网络基本原理第27-28页
     ·贝叶斯网络工具——BNT第28-29页
   ·评价标准第29-30页
   ·结果与分析第30-32页
4 Hub 蛋白分类与作用规律研究第32-44页
   ·数据的获得与处理第32页
   ·使用X-mean 算法对Hub 蛋白聚类第32-33页
   ·构建Hub 子网络图第33页
   ·相互作用倾向性因子的定义与计算第33-34页
   ·各类Hub 蛋白在细胞中的分布和参与的生物学过程第34-35页
   ·结果与分析第35-43页
     ·Hub 蛋白聚类结果第35-36页
     ·Hub 蛋白子网络图第36-38页
     ·倾向性因子计算结果第38-40页
     ·Hub 蛋白分布统计结果第40-43页
 5 结论第43-44页
参考文献第44-49页
附录A 构建TAN 贝叶斯网络的Matlab 代码第49-52页
在学研究成果第52-53页
致谢第53页

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