| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-26页 |
| ·蛋白质相互作用研究背景 | 第10-12页 |
| ·蛋白质相互作用研究实验方法 | 第12-14页 |
| ·免疫共沉淀方法 | 第12页 |
| ·酵母双杂交系统 | 第12-13页 |
| ·噬菌体展示技术 | 第13页 |
| ·蛋白质亲和色谱 | 第13-14页 |
| ·蛋白质探针技术 | 第14页 |
| ·蛋白质相互作用研究的生物信息学方法 | 第14-17页 |
| ·系统发育谱 | 第14-15页 |
| ·基因邻接 | 第15页 |
| ·基因融合事件 | 第15-16页 |
| ·镜像树 | 第16页 |
| ·数据挖掘与机器学习方法及预测 | 第16-17页 |
| ·蛋白质相互作用相关资源与数据库 | 第17-26页 |
| ·GO 基因本体数据库 | 第18-19页 |
| ·SCOP 蛋白质结构分类数据库 | 第19-20页 |
| ·PDBsum 数据库 | 第20-21页 |
| ·蛋白质相互作用数据库 | 第21-26页 |
| 2 基于亚细胞定位与结构信息的蛋白质相互作用规律的研究 | 第26-36页 |
| ·数据获得与处理 | 第26-27页 |
| ·蛋白质相互作用相对倾向性因子PIRB 的定义 | 第27-28页 |
| ·蛋白质相互作用统计分析及PIRB 计算 | 第28-31页 |
| ·基于GO 亚细胞定位信息对酿酒酵母的细胞器PPI 规律的统计分析 | 第28-29页 |
| ·基于SCOP 数据库的蛋白质结构分类对PPI 规律的统计分析 | 第29-31页 |
| ·蛋白质相互作用规律及生物学意义 | 第31-34页 |
| ·本章小节 | 第34-36页 |
| 3 基于二级结构预测蛋白质复合体亚基相互作用 | 第36-43页 |
| ·数据来源及其数据集的构建 | 第36-37页 |
| ·支持向量机介绍 | 第37-38页 |
| ·蛋白质亚基间相互作用统计分析及预测模型构建 | 第38-40页 |
| ·蛋白质链作用区域二级结构及超二级结构类型的分布统计 | 第38页 |
| ·蛋白质亚基相互作用区配对类型的分布统计 | 第38-39页 |
| ·蛋白质序列打分与预测模型的构建 | 第39-40页 |
| ·预测结果评价标准 | 第40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-43页 |
| ·各类型分布比例及相对倾向值统计 | 第40-41页 |
| ·蛋白质亚基相互作用预测结果与评价 | 第41-43页 |
| 4 基于二级结构蛋白质相互作用预测 | 第43-49页 |
| ·数据集构建 | 第43-44页 |
| ·数据来源及正数据集构建 | 第43页 |
| ·负数据集构建 | 第43-44页 |
| ·蛋白质相互作用特征值提取及预测模型构建 | 第44-46页 |
| ·预测结果与评价 | 第46-47页 |
| ·模型预测结果 | 第46页 |
| ·负集构建策略对预测效果的影响讨论 | 第46-47页 |
| ·本章小节 | 第47-49页 |
| 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 在学研究成果 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55页 |
