| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1 镉污染现状 | 第10-11页 |
| 2 镉对植物的毒害及植物耐镉机制 | 第11-13页 |
| 2.1 镉对植物的毒害 | 第11-12页 |
| 2.2 植物耐镉机制 | 第12-13页 |
| 3 能源植物柳枝稷研究进展 | 第13-14页 |
| 4 测序技术的发展和转录组学研究应用 | 第14-18页 |
| 4.1 测序技术的发展 | 第14-16页 |
| 4.2 转录组测序技术及其应用 | 第16-18页 |
| 5 锌指蛋白研究进展 | 第18-21页 |
| 本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 镉胁迫下柳枝稷转录组分析 | 第22-36页 |
| 1 引言 | 第22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-25页 |
| 2.1 植物材料与处理 | 第22-23页 |
| 2.2 根系总RNA的提取 | 第23页 |
| 2.3 主要仪器 | 第23-24页 |
| 2.4 转录组测序 | 第24页 |
| 2.5 转录组生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-33页 |
| 3.1 总RNA样品的提取与检测 | 第25-26页 |
| 3.2 测序原始数据处理 | 第26-27页 |
| 3.3 利用参考基因组进行转录组初分析 | 第27页 |
| 3.4 转录组测序数据的差异表达基因筛选 | 第27-30页 |
| 3.5 Gene Ontology功能富集分析 | 第30-32页 |
| 3.6 差异基因代谢途径研究 | 第32-33页 |
| 4 讨论 | 第33-36页 |
| 4.1 转录组测序实验设计与数据分析流程 | 第33-34页 |
| 4.2 镉胁迫下柳枝稷根系转录组分析 | 第34-36页 |
| 第三章 CCCH基因家族的生物信息学分析 | 第36-52页 |
| 1 引言 | 第36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-38页 |
| 2.1 数据来源 | 第36页 |
| 2.2 实验方法 | 第36-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-49页 |
| 3.1 柳枝稷CCCH锌指蛋白的鉴定 | 第38-41页 |
| 3.2 CCCH锌指蛋白的系统发育树和结构分析 | 第41-43页 |
| 3.3 柳枝稷CCCH锌指蛋白基因的染色体定位及旁系同源基因的复制 | 第43-46页 |
| 3.4 柳枝稷CCCH锌指蛋白基因的表达模式分析 | 第46-48页 |
| 3.5 柳枝稷CCCH锌指蛋白启动子的分析与qRT-PCR分析 | 第48-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 全文结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-66页 |
| 附录 | 第66-78页 |
| 硕士期间发表的论文 | 第78页 |
| 硕士期间参与课题 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80页 |