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两种乳杆菌比较基因组学研究及细菌素生物合成基因功能解析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
英文缩略语及中文对照第8-13页
1 绪论第13-27页
    1.1 乳杆菌第13-15页
        1.1.1 乳杆菌简介第13页
        1.1.2 乳杆菌的活性功能第13-15页
        1.1.3 乳杆菌的应用第15页
    1.2 乳杆菌基因组学研究现状第15-21页
        1.2.1 微生物基因组学简介第15-17页
        1.2.2 微生物基因组学研究方法第17-19页
        1.2.3 乳杆菌基因组学研究概况第19-21页
    1.3 细菌素研究进展第21-25页
        1.3.1 细菌素简介与分类第21-22页
        1.3.2 细菌素的抑菌机理第22-23页
        1.3.3 细菌素的应用第23-24页
        1.3.4 乳酸菌细菌素研究概况第24-25页
    1.4 本研究的目的与意义第25-27页
        1.4.1 本研究的目的与意义第25-26页
        1.4.2 研究内容第26-27页
2 L. plantarum FMNP01和L. sp FMNP02的比较基因组学研究及细菌素相关基因的挖掘第27-54页
    2.1 研究对象及方法第27-31页
        2.1.1 研究对象第27页
        2.1.2 L. plantarum FMNP01的培养与基因组DNA的提取第27页
        2.1.3 基因组测序、组装及基因组注释第27页
        2.1.4 基因组同源性分析第27-28页
        2.1.5 基因组共线性分析第28页
        2.1.6 系统发生树构建第28-29页
        2.1.7 细菌素基因挖掘方法第29-30页
        2.1.8 所用到相关软件和数据库第30-31页
    2.2 结果与分析第31-51页
        2.2.1 L. plantarum FMNP01的全基因组测序及初步生物信息分析第31-39页
        2.2.2 L. plantarum FMNP01和L. sp FMNP02基因组基本特征比较及系统分类第39-41页
        2.2.3 L. plantarum FMNP01和L. sp FMNP02的基因组同源性比较第41-45页
        2.2.4 L. plantarum FMNP01和L. sp FMNP02蛋白水解相关基因的比较分析第45-48页
        2.2.5 L. plantarum FMNP01和L. sp FMNP02糖代谢相关基因的比较分析第48-49页
        2.2.6 L. sp FMNP02细菌素相关基因的挖掘以及Ⅱ类细菌素的预测第49-51页
    2.3 小结第51-54页
3 Pln J和Pln K原核表达菌株的构建及表达第54-67页
    3.1 材料与方法第54-61页
        3.1.1 菌株与质粒第54页
        3.1.2 培养基和试剂第54-55页
        3.1.3 主要仪器设备第55页
        3.1.4 Pln J和Pln K的克隆第55-59页
        3.1.5 诱导表达培养第59-60页
        3.1.6 重组蛋白的纯化及抑菌活性检测第60-61页
    3.2 结果与分析第61-65页
        3.2.1 Pln J-T和Pln K-T克隆载体的构建第61-63页
        3.2.2 Pln J-p ET32a和Pln K-p ET32a表达载体的构建第63-64页
        3.2.3 重组大肠杆菌Pln J-p ET32a和Pln K-p ET32a的诱导表达第64页
        3.2.4 重组蛋白Pln J-p ET32a和Pln K-p ET32a的纯化及抑菌活性检测第64-65页
    3.3 小结第65-67页
4 F1和F2原核表达菌株的构建及表达第67-76页
    4.1 材料与方法第67-71页
        4.1.1 菌株与质粒第67页
        4.1.2 培养基和试剂第67页
        4.1.3 主要仪器设备第67页
        4.1.4 F1和F2的克隆第67-70页
        4.1.5 诱导表达培养第70-71页
        4.1.6 重组蛋白的抑菌活性检测第71页
    4.2 结果与分析第71-75页
        4.2.1 F1-T和F2-T克隆载体的构建第71-73页
        4.2.2 F1-p ET28a和F2-p ET28a表达载体的构建第73页
        4.2.3 重组大肠杆菌F1-p ET28a和F2-p ET28a的诱导表达第73-74页
        4.2.4 重组蛋白F1-p ET28a和F2-p ET28a的抑菌活性检测第74-75页
    4.3 小结第75-76页
5 全文讨论第76-78页
    5.1 L. plantarum FMNP01与L. sp FMNP02的比较基因组学研究第76页
    5.2 细菌素Pln J和Pln K的异源表达与活性验证第76-77页
    5.3 Ⅱ类细菌素的预测与FI和F2的活性验证第77-78页
6 全文结论与展望第78-80页
    6.1 全文结论第78-79页
    6.2 展望第79-80页
致谢第80-82页
参考文献第82-93页
附录A L. plantarum FMNP01 PTS糖转运系统第93-97页
附录B L. sp FMNP02 PTS糖转运系统第97-101页
附录C 硕士在读期间发表的文章第101页

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