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海洋新型α-淀粉酶AmyP中Domain B区域的功能探索

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第10-11页
第一章 绪论第11-20页
    1 淀粉酶第11页
        1.1 淀粉酶的来源及发展第11页
        1.2 淀粉酶的分类第11页
    2 α-淀粉酶第11-14页
        2.1 α-淀粉酶的简介第11-12页
        2.2 α-淀粉酶的催化机制第12-13页
        2.3 pH对α-淀粉酶的影响第13页
        2.4 α-淀粉酶的应用第13-14页
    3 常见α-淀粉酶的结构及功能第14-15页
    4 海洋新型α-淀粉酶AmyP第15-16页
    5 α-淀粉酶AmyP的Domain B区域的特征第16-18页
        5.1 Domain B区域的确定第16-17页
        5.2 Domain B区域的二级结构预测第17页
        5.3 Domain B区域从序列分析上不存在结合Ca~(2+)的位点第17-18页
    6 本研究的目的和主要内容第18-20页
        6.1 研究目的第18页
        6.2 研究的主要内容第18-20页
第二章 淀粉酶AmyP的Domain B区域缺失和单点突变体的克隆表达纯化第20-31页
    1 实验材料第20-22页
        1.1 试剂和仪器第20-21页
            1.1.1 菌株和载体第20页
            1.1.2 主要试剂和酶第20-21页
            1.1.3 实验仪器设备第21页
        1.2 培养基及试剂的配制第21-22页
            1.2.1 培养基的配制第21页
            1.2.2 试剂的配制第21-22页
    2 实验方法第22-27页
        2.1 化转感受态E.coli JM109和E.coli BL21(DE3)的制备方法第22页
        2.2 12%聚丙烯酰胺凝胶的配制第22-23页
        2.3 突变体的构建第23-25页
            2.3.1 AmyP-pUC18质粒的获得第23页
            2.3.2 Domain B区域突变体引物设计第23页
            2.3.3 突变体目的片段扩增第23页
            2.3.4 目的片段回收第23-24页
            2.3.5 目的片段的磷酸化及连接第24页
            2.3.6 目的片段的化学法转化第24页
            2.3.7 菌落PCR法验证阳性转化子第24-25页
            2.3.8 目标片段与表达载体的连接第25页
        2.4 突变体蛋白的表达和纯化第25-27页
            2.4.1 突变体蛋白的表达优化第25-26页
            2.4.2 突变体蛋白的纯化第26-27页
    3 结果第27-30页
        3.1 表达突变体的构建第27-29页
        3.2 突变体的表达纯化第29-30页
    4 小结第30-31页
第三章 突变体的酶学性质和酶学动力学的研究第31-42页
    1 实验材料第31-32页
        1.1 实验试剂和仪器第31-32页
            1.1.1 实验试剂第31页
            1.1.2 实验仪器第31-32页
        1.2 实验试剂的配制第32页
    2 实验方法第32-35页
        2.1 绘制葡萄糖标准曲线第32-33页
        2.2 绘制蛋白标准曲线(Bradford法)第33页
        2.3 突变体酶学性质的测定第33-35页
            2.3.1 突变体酶活力的测定方法第34页
            2.3.2 突变蛋白工作浓度的测定方法第34页
            2.3.3 突变蛋白对可溶性糖的影响第34页
            2.3.4 突变蛋白对生淀粉的影响第34-35页
        2.4 突变体酶学动力学的测定第35页
    3 结果第35-41页
        3.1 突变体的酶学性质第35-39页
            3.1.1 Domain B区域缺失对酶活的影响第35-36页
            3.1.2 Domain B区域单点突变体对酶活的影响第36-39页
        3.2 突变体的酶学动力学第39-41页
    4 小结第41-42页
第四章 影响酶反应速率下降因素的探索第42-53页
    1 实验材料第42页
        1.1 试剂和仪器第42页
            1.1.1 菌株和载体第42页
        1.2 培养基及试剂的配制第42页
            1.2.1 培养基的配制第42页
            1.2.2 实验试剂的配制第42页
    2 实验方法第42-44页
        2.1 荧光光谱检测Domain B区域的氨基酸对AmyP整体结构的影响第42-43页
            2.1.1 9个突变位点同时突变的突变体构建第43页
            2.1.2 荧光光谱见检测方法第43页
        2.2 检测Domain B区域的氨基酸对酶的催化微环境(解离)的影响第43-44页
            2.2.1 野生型AmyP和16个突变体的最适pH的检测方法第43-44页
            2.2.2 野生型AmyP和16个突变体的电离常数的检测方法第44页
    3 结果第44-52页
        3.1 Domain B区域的氨基酸改变对AmyP整体结构的影响第44-48页
            3.1.1 9位点同时突变表达载体的构建第44-45页
            3.1.2 多点突变体的表达纯化第45-46页
            3.1.3 多点突变蛋白对可溶性淀粉和大米生淀粉的影响第46-47页
            3.1.4 突变体对酶的整体结构的影响第47-48页
        3.2 Domain B区域的氨基酸改变对酶的催化微环境(解离)的影响第48-52页
            3.2.1 Domain B区域氨基酸的改变对酶的最适pH的影响第48-49页
            3.2.2 Domain B区域的氨基酸对酶的电离影响的确认第49-52页
    4 小结第52-53页
结论第53-54页
参考文献第54-60页
附录 1第60-62页
附录 2第62-63页
致谢第63-64页
攻读学位期间发表的学术论文第64页

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