| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一部分 基于全外显子组测序技术鉴定单基因遗传病致病基因 | 第11-54页 |
| 绪论 | 第11-13页 |
| 1 材料与方法 | 第13-35页 |
| 1.1 临床病例收集及初步诊断 | 第13-15页 |
| 1.2 试剂和仪器 | 第15-17页 |
| 1.3 基因组DNA的抽提 | 第17-18页 |
| 1.4 基因组DNA的浓度测定 | 第18页 |
| 1.5 Agilent Sureselect方法制备测序文库 | 第18-29页 |
| 1.6 Illumina Hiseq2000测序 | 第29-30页 |
| 1.7 Illumina Miseq测序 | 第30-31页 |
| 1.8 测序数据分析（Next GENe Software） | 第31-32页 |
| 1.9 测序数据结果解释（Ingenuity Variant Analysis） | 第32-33页 |
| 1.10 Sanger测序验证 | 第33-35页 |
| 2 结果 | 第35-45页 |
| 2.1 24例WES样本杂交捕获文库的质量及浓度 | 第35-36页 |
| 2.2 24例WES样本高通量测序质量评价 | 第36-39页 |
| 2.3 24例WES样本的单核苷酸变异数（Single nucleotide variations,SNVs）及分类 | 第39-41页 |
| 2.4 不同测序深度对于已知SNVs的检出能力 | 第41-42页 |
| 2.5 24例遗传性疾病WES样本致病基因（突变）的鉴定 | 第42-44页 |
| 2.6 HME-F病例：下一代测序&Sanger测序结果比较 | 第44-45页 |
| 3 讨论 | 第45-54页 |
| 3.1 致病基因检测方法 | 第45-46页 |
| 3.2 高通量测序 | 第46-50页 |
| 3.3 数据分析 | 第50-52页 |
| 3.4 数据解释 | 第52页 |
| 3.5 WES与致病基因的鉴定 | 第52-54页 |
| 第二部分 多发性骨性连接综合征新致病基因GDF6的鉴定及其致病机制探索 | 第54-74页 |
| 绪论 | 第54-55页 |
| 1 材料与方法 | 第55-62页 |
| 1.1“多发性骨性连接综合征”（SYNS）家系 | 第55-56页 |
| 1.2 试剂和仪器 | 第56-57页 |
| 1.3 家系成员全外显子组测序及数据分析 | 第57页 |
| 1.4 构建GDF6野生型和突变型哺乳动物细胞表达质粒 | 第57-58页 |
| 1.5 体外瞬时转染细胞 | 第58-59页 |
| 1.6 蛋白质样品的制备及定量 | 第59-60页 |
| 1.7 蛋白质免疫印迹实验（Western blot） | 第60-62页 |
| 2 结果 | 第62-68页 |
| 2.1 多发性骨性连接综合征（SYNS）家系临床资料及诊断 | 第62-64页 |
| 2.2 多发性骨性连接综合征（SYNS）家系成员全外显子组测序及数据质量评估 | 第64页 |
| 2.3 SYNS家系全外显子组检测候选致病基因 | 第64-65页 |
| 2.4 SYNS家系新致病基因GDF6的鉴定 | 第65-67页 |
| 2.5 GDF6基因突变p.Y444N蛋白预测功能分析 | 第67页 |
| 2.6 p.Y444N突变影响GDF6蛋白的表达 | 第67-68页 |
| 3 讨论 | 第68-74页 |
| 3.1 SYNS临床表型及诊断 | 第68-70页 |
| 3.2 SYNS遗传学研究 | 第70-71页 |
| 3.3 GDF6基因 | 第71页 |
| 3.4 BMP/GDF通路 | 第71-72页 |
| 3.5 GDF6 基因突变p.Y444N致病机制初步探索 | 第72-74页 |
| 结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第86页 |
| 攻读博士学位期间获得课题及学术奖励 | 第86-87页 |
| 综述 | 第87-92页 |
| Reference | 第92页 |
