| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-24页 |
| 1.1 鱼类免疫学研究进展 | 第14-17页 |
| 1.1.1 鱼类免疫学发展概况 | 第14-15页 |
| 1.1.2 鱼类的免疫系统 | 第15-16页 |
| 1.1.3 鱼类的免疫机制 | 第16-17页 |
| 1.1.4 鮸鱼概况 | 第17页 |
| 1.2 Toll/IL-1 受体超家族 | 第17-20页 |
| 1.2.1 Toll/IL-1R家族来源 | 第18页 |
| 1.2.2 Toll/IL-1R家族成员 | 第18-19页 |
| 1.2.3 Toll/IL-1R信号通路 | 第19-20页 |
| 1.3 miRNA的研究进展 | 第20-24页 |
| 1.3.1 miRNA的内源合成 | 第20-21页 |
| 1.3.2 miRNA的作用机制 | 第21页 |
| 1.3.3 miRNA的功能 | 第21-22页 |
| 1.3.4 miRNA与免疫系统 | 第22-24页 |
| 第二章 材料与方法 | 第24-37页 |
| 2.1 实验材料 | 第24-26页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第24页 |
| 2.1.2 菌种 | 第24页 |
| 2.1.3 细胞及转染相关材料 | 第24页 |
| 2.1.4 载体构建所需材料及载体 | 第24-25页 |
| 2.1.5 引物 | 第25页 |
| 2.1.6 miRNA模拟体及抑制体 | 第25-26页 |
| 2.1.7 实验仪器 | 第26页 |
| 2.1.8 分子生物学软件 | 第26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-37页 |
| 2.2.1 鮸鱼巨噬细胞的分离 | 第26-27页 |
| 2.2.2 病原菌感染实验 | 第27页 |
| 2.2.3 RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.2.4 cDNA合成 | 第28-29页 |
| 2.2.5 cDNA文库构建及测序 | 第29-30页 |
| 2.2.6 Clean read数据的获得与组装 | 第30页 |
| 2.2.7 Unigene基因注释及功能分类 | 第30页 |
| 2.2.8 基因差异表达分析 | 第30-31页 |
| 2.2.9 miRNA的筛选及靶基因的预测 | 第31页 |
| 2.2.10 实时荧光定量PCR分析 | 第31-32页 |
| 2.2.11 质粒构建 | 第32-35页 |
| 2.2.12 转染 | 第35-36页 |
| 2.2.13 双荧光素酶报告基因分析 | 第36页 |
| 2.2.14 数据分析 | 第36-37页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第37-57页 |
| 3.1 鳗弧菌感染鮸鱼脾脏前后转录组分析 | 第37-44页 |
| 3.1.1 测序产量的统计 | 第37页 |
| 3.1.2 序列组装结果与生物信息学分析 | 第37-38页 |
| 3.1.3 基因定量的分析 | 第38-39页 |
| 3.1.4 差异表达基因筛选 | 第39-40页 |
| 3.1.5 差异表达基因GO富集和基因通路富集分析 | 第40-42页 |
| 3.1.6 与免疫相关的差异表达基因 | 第42-44页 |
| 3.2 鮸鱼IL-1RI的miRNA调控分析 | 第44-50页 |
| 3.2.1 预测和筛选靶向IL-1RI基因的miRNA | 第44页 |
| 3.2.2 鮸鱼miR-192 的特征分析 | 第44-46页 |
| 3.2.3 鮸鱼miR-192 与IL-1RI 3'UTR作用位点的确定 | 第46页 |
| 3.2.4 鮸鱼miR-192 与IL-1RI表达分析 | 第46-48页 |
| 3.2.5 讨论 | 第48-50页 |
| 3.3 鮸鱼TLR1的miRNA调控分析 | 第50-57页 |
| 3.3.1 预测和筛选靶向TLR1基因的miRNA | 第50-51页 |
| 3.3.2 鮸鱼TLR1的表达分析 | 第51-52页 |
| 3.3.3 miR-217 与TLR13'UTR作用位点的确定 | 第52-53页 |
| 3.3.4 miR-217 前体与TLR13'UTR双荧光素酶检测分析 | 第53-54页 |
| 3.3.5 鮸鱼miR-217 的表达分析 | 第54-55页 |
| 3.3.6 讨论 | 第55-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第64页 |
