| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-24页 |
| 1.1 X. fastidiosa引起的病害和症状 | 第12-13页 |
| 1.2 X. fastidiosa的生物学特性 | 第13-14页 |
| 1.2.1 菌落和细胞形态 | 第13-14页 |
| 1.2.2 发生与传播 | 第14页 |
| 1.3 X. fastidiosa的分类现况 | 第14-16页 |
| 1.4 X. fastidiosa的基因组研究进展 | 第16-18页 |
| 1.4.1 X. fastidiosa基因组测序进展 | 第16页 |
| 1.4.2 X. fastidiosa比较基因组学研究进展 | 第16-18页 |
| 1.5 X. fastidiosa的分子检测方法 | 第18-23页 |
| 1.6 本研究的目的、意义及技术路线 | 第23-24页 |
| 1.6.1 本研究的目的及意义 | 第23页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 木质部难养菌桑树和梧桐树菌株的基因组测序 | 第24-31页 |
| 2.1 材料和方法 | 第24-27页 |
| 2.1.1 供试菌株 | 第24页 |
| 2.1.2 菌株的分离和保存 | 第24-26页 |
| 2.1.3 菌株的致病性验证 | 第26页 |
| 2.1.4 基因组DNA的提取 | 第26页 |
| 2.1.5 测定和组装基因组序列 | 第26页 |
| 2.1.6 测定基因组序列中的Gap | 第26-27页 |
| 2.1.7 提交基因组序列 | 第27页 |
| 2.2 结果 | 第27-30页 |
| 2.2.1 菌株的分离 | 第27页 |
| 2.2.2 菌株致病力验证 | 第27-29页 |
| 2.2.3 测定和组装基因组序列 | 第29-30页 |
| 2.2.4 基因组序列的提交 | 第30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-31页 |
| 第三章 木质部难养菌夹竹桃菌株的TaqMan荧光定量PCR检测 | 第31-39页 |
| 3.1 材料和方法 | 第31-34页 |
| 3.1.1 供试菌株及培养方法 | 第31页 |
| 3.1.2 夹竹桃植物样品和ELISA | 第31页 |
| 3.1.3 DNA提取和常规PCR条件 | 第31-32页 |
| 3.1.4 特异性DNA序列的筛选和特异性引物及探针的设计 | 第32页 |
| 3.1.5 Real-time PCR反应条件和标准曲线的建立 | 第32-34页 |
| 3.2 结果与分析 | 第34-38页 |
| 3.2.1 特异性序列的鉴定和特异性引物以及探针的设计 | 第34页 |
| 3.2.2 Real-time PCR反应条件和标准曲线的建立 | 第34-38页 |
| 3.3 讨论 | 第38-39页 |
| 第四章 美国境内木质部难养菌桑树菌株的PCR特异性检测 | 第39-51页 |
| 4.1 材料和方法 | 第39-40页 |
| 4.1.1 供试菌株 | 第39页 |
| 4.1.2 细菌基因组DNA提取 | 第39页 |
| 4.1.3 植物样品的DNA提取 | 第39-40页 |
| 4.1.4 筛选和鉴定特异性序列 | 第40页 |
| 4.1.5 PCR测试条件 | 第40页 |
| 4.2 结果与分析 | 第40-49页 |
| 4.2.1 筛选和鉴定特异性序列 | 第40-41页 |
| 4.2.2 PCR引物的特异性测定 | 第41-45页 |
| 4.2.3 PCR产物有效性的确认 | 第45页 |
| 4.2.4 PCR检测方法稳定性测试 | 第45-49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-51页 |
| 第五章 全文结论 | 第51-53页 |
| 5.1 测定了木质部难养菌两个菌株的基因组序列，并对其基因组进行了注释 | 第51页 |
| 5.2 建立木质部难养菌夹竹桃菌株的实时荧光定量PCR检测方法 | 第51页 |
| 5.3 建立了木质部难养菌桑树菌株的常规PCR特异性检测方法 | 第51-52页 |
| 5.4 后续工作展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-59页 |
| 附录 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 作者简介 | 第61页 |
