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定植于桉树根产酸克雷伯氏菌突变体的筛选及其功能基因

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第10-14页
    1.1 生物固氮第10页
    1.2 固氮细菌的起源第10-11页
    1.3 联合固氮微生物的研究状况第11页
    1.4 克雷伯氏菌的研究现状第11页
    1.5 桉树造林的研究现状第11-12页
    1.6 研究目的及意义第12-13页
    1.7 实验流程第13-14页
第二章 材料与方法第14-42页
    2第14-26页
        2.1 实验材料第14-20页
            2.1.1 实验菌株与质粒第14-15页
            2.1.2 引物第15页
            2.1.3 抗生素第15-16页
            2.1.4 分离和富集无氮培养基第16页
            2.1.5 培养大肠杆菌的LB培养基和LA培养基第16-17页
            2.1.6 培养化转所需SOC培养基第17页
            2.1.7 植物培养基第17-18页
            2.1.8 抗生素敏感试验的MH培养基第18页
            2.1.9 常用琼脂糖凝胶电泳与实验溶液第18-20页
        2.2 实验仪器及试剂第20-21页
            2.2.1 本研究中用到的主要实验仪器和设备第20-21页
            2.2.2 本研究中所用到的主要实验耗材第21页
        2.3 常规微生物的培养与保存第21-22页
        2.4 常规分子操作第22-24页
            2.4.1 细菌基因组DNA提取第22-23页
            2.4.2 质粒的提取第23-24页
            2.4.3 DNA的纯化第24页
        2.5 大肠杆菌感受态的制备和细胞化学的转化第24-25页
            2.5.1 大肠杆菌感受态细胞的CaCl_2化学制备方法第24-25页
            2.5.2 细胞化学转化法第25页
        2.6 PCR反应第25-26页
            2.6.1 引物的设计第25页
            2.6.2 PCR模板的制备第25-26页
    3 固氮菌株的分离鉴定第26-28页
        3.1 样品采集及固氮菌分离第26-27页
            3.1.1 样品的采集第26-27页
            3.1.2 固氮菌的分离第27页
        3.2 固氮菌的鉴定第27-28页
            3.2.1 固氮菌的形态及生理生化特征测定第27页
            3.2.2 固氮菌对抗生素药敏试验第27页
            3.2.3 固氮菌的分子水平鉴定第27-28页
            3.2.4 Biolog微生物鉴定系统鉴定第28页
    4 突变体库的构建及验证第28-35页
        4.1 突变体库的构建及筛选第28-29页
            4.1.1 两亲结合实验第28-29页
            4.1.2 突变体库的验证第29页
        4.2 Southern杂交验证Tn5随机插入突变体第29-32页
            4.2.1 DNA探针制备及Southern杂交第29-32页
            4.2.2 杂交膜保存第32页
        4.3 定植于桉树根目标突变体的筛选第32-33页
            4.3.1 组培苗的培养第32页
            4.3.2 定植于桉树根突变体的筛选第32-33页
        4.4 转座子Tn5插入位点的定位第33-34页
            4.4.1 转座子Tn5插入突变体基因的酶切第33页
            4.4.2 酶切DNA的自连第33-34页
        4.5 KO108和突变体MA、MD的生理生化检测第34-35页
            4.5.1 生长曲线的测定第34页
            4.5.2 菌膜的检测第34页
            4.5.3 游动性的检测第34-35页
            4.5.4 Biolog ECO对微生物碳源利用检测第35页
    5 KO108基因组文库的构建及验证第35-39页
        5.1 KO108基因组文库的构建第35页
        5.2 KO108基因组文库的构建所用载体及菌株特性第35页
        5.3 基因组文库的构建方法及验证第35-39页
            5.3.1 Cosmid质粒基因组文库构建步骤第35-39页
            5.3.2 基因组文库质量检测第39页
    6 基因组文库中NADP(H)基因DNA片段的克隆第39-42页
        6.1 菌落原位杂交筛选基因组文库中NADP(H)基因第39-40页
            6.1.1 随机引物标记法第39页
            6.1.2 杂交膜制备第39-40页
        6.2 NADP(H)基因的亚克隆第40-42页
            6.2.1 碱性磷酸酶的去磷酸反应第40页
            6.2.2 亚克隆第40-42页
第三章 固氮菌株的筛选与鉴定结果分析第42-46页
    3.1 固氮菌株的筛选第42页
    3.2 固氮菌KO108的生理生化检测第42-44页
    3.3 固氮菌KO108的分子水平鉴定结果第44-45页
    3.4 Biolog微生物鉴定系统对固氮菌KO108的鉴定第45-46页
第四章 突变体库构建及定植于桉树根的突变体Tn5插入位点的定位第46-56页
    4.1 突变体的筛选第47-50页
        4.1.1 突变体转座子Tn5插入序列分析第48页
        4.1.2 Southern杂交结果与分析第48-50页
    4.2 定植于桉树根突变株的筛选结果第50-51页
    4.3 MA和MD Tn5插入位点的定位第51-52页
    4.4 生长曲线的测定第52-53页
    4.5 菌膜的检测结果第53页
    4.6 游动性的检测结果第53-54页
    4.7 Biolog ECO对微生物碳源利用检测第54-56页
第五章 KO108基因组文库的构建第56-59页
    5.1 细菌DNA的提取及优化第56页
    5.2 KO108基因文库的质量检测第56-59页
第六章 NADP(H)基因及KO108有关趋化性基因的克隆第59-63页
    6.1 菌落原位杂交克隆编码NADP(H)的基因第59-60页
    6.2 趋化性基因的克隆第60-63页
第七章 全文总结第63-65页
参考文献第65-71页
攻读硕士学位期间发表论文情况第71-72页
致谢第72-73页

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