| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1. 鱼类保护遗传学研究概况 | 第12-17页 |
| 1.1 保护遗传学研究内容 | 第12-13页 |
| 1.2 保护遗传学研究方法 | 第13-17页 |
| 1.2.1 中性标记 | 第13-16页 |
| 1.2.2 非中性标记 | 第16-17页 |
| 2. 我国洞穴鱼类研究进展 | 第17-19页 |
| 2.1 我国洞穴鱼类的分布特点 | 第18页 |
| 2.2 洞穴鱼类的适应性特点 | 第18-19页 |
| 2.3 洞穴鱼类生存面临的问题 | 第19页 |
| 3. 玫瑰高原鳅的研究概况 | 第19-20页 |
| 4. 本研究的目的及意义 | 第20-22页 |
| 第2章 基于线粒体cytb基因的玫瑰高原鳅系统位置研究 | 第22-38页 |
| 1. 引言 | 第22-23页 |
| 2. 材料与方法 | 第23-25页 |
| 2.1 实验样品 | 第23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-24页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取 | 第23页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.3 数据分析 | 第24-25页 |
| 2.3.1 cytb序列分析 | 第24-25页 |
| 2.3.2 遗传距离分析 | 第25页 |
| 2.3.3 系统发育分析 | 第25页 |
| 3. 结果 | 第25-27页 |
| 3.1 cytb序列变异 | 第25-26页 |
| 3.2 遗传距离分析 | 第26页 |
| 3.3 系统发育分析 | 第26-27页 |
| 4. 讨论 | 第27-28页 |
| 4.1 遗传距离 | 第27页 |
| 4.2 新属问题 | 第27-28页 |
| 4.3 系统发育关系 | 第28页 |
| 5. 小结 | 第28-38页 |
| 第3章 玫瑰高原鳅遗传多样性研究 | 第38-50页 |
| 1. 引言 | 第38页 |
| 2. 材料与方法 | 第38-41页 |
| 2.1 实验材料 | 第38-39页 |
| 2.2 实验方法 | 第39-40页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取 | 第39页 |
| 2.2.2 454测序 | 第39页 |
| 2.2.3 PCR扩增 | 第39-40页 |
| 2.2.4 微卫星多态性检测 | 第40页 |
| 2.2.5 跨种扩增检测 | 第40页 |
| 2.2.6 cytb扩增 | 第40页 |
| 2.3 数据分析 | 第40-41页 |
| 2.3.1 454测序结果分析及微卫星序列筛选 | 第40-41页 |
| 2.3.2 多态性微卫星位点分析 | 第41页 |
| 2.3.3 cytb序列分析 | 第41页 |
| 2.3.4 种群遗传变异分析 | 第41页 |
| 3. 结果 | 第41-43页 |
| 3.1 454测序结果统计 | 第41-42页 |
| 3.2 微卫星序列筛选结果 | 第42页 |
| 3.3 玫瑰高原鳅多态性微卫星分子标记的开发 | 第42-43页 |
| 3.3.1 微卫星位点在8个玫瑰高原鳅个体中初筛 | 第42页 |
| 3.3.2 多态性微卫星位点在群体中扩增结果 | 第42-43页 |
| 3.3.3 跨种扩增结果 | 第43页 |
| 3.4 cytb序列扩增及分析 | 第43页 |
| 4. 讨论 | 第43-45页 |
| 4.1 基于454测序技术的微卫星标记的筛选 | 第43-44页 |
| 4.2 哈迪-温伯格平衡 | 第44页 |
| 4.3 种群遗传多样性 | 第44-45页 |
| 4.4 跨种扩增分析 | 第45页 |
| 5. 小结 | 第45-50页 |
| 第4章 玫瑰高原鳅mc1r基因的适应性进化分析 | 第50-76页 |
| 1. 引言 | 第50-51页 |
| 2. 材料与方法 | 第51-54页 |
| 2.1 样品信息 | 第51页 |
| 2.2 基因组DNA的提取 | 第51页 |
| 2.3 mc1r基因的克隆 | 第51-52页 |
| 2.4 跨种扩增 | 第52-53页 |
| 2.5 序列的初步分析 | 第53页 |
| 2.6 系统发育分析 | 第53页 |
| 2.7 Mc1r编码蛋白的生物信息学分析 | 第53-54页 |
| 2.8 dN/dS比值分析 | 第54页 |
| 3. 结果 | 第54-57页 |
| 3.1 mc1r基因的克隆 | 第54页 |
| 3.2 同源性分析 | 第54页 |
| 3.3 系统进化树分析 | 第54-55页 |
| 3.4 Mc1r蛋白的特点 | 第55-56页 |
| 3.4.1 Mc1r编码蛋白的理化性质 | 第55页 |
| 3.4.2 Mc1r蛋白的亲水性与疏水性分析 | 第55页 |
| 3.4.3 Mc1r蛋白的跨膜结构和信号肽分析 | 第55页 |
| 3.4.4 Mc1r蛋白的模体分析 | 第55-56页 |
| 3.4.5 Mc1r蛋白的二级结构分析 | 第56页 |
| 3.4.6 Mc1r蛋白的结构域分析 | 第56页 |
| 3.5 mc1r基因种内种间分析 | 第56-57页 |
| 3.6 适应性进化分析 | 第57页 |
| 4. 讨论 | 第57-59页 |
| 4.1 mc1r基因序列 | 第57-58页 |
| 4.2 mc1r基因变异位点分析 | 第58页 |
| 4.3 适应性进化 | 第58-59页 |
| 5. 小结 | 第59-76页 |
| 参考文献 | 第76-86页 |
| 致谢 | 第86-88页 |
| 在校期间科研实践情况 | 第88页 |