| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-28页 |
| 1.1 植物分子系统学研究进展 | 第11-14页 |
| 1.1.1 分子系统学的发展 | 第11-12页 |
| 1.1.2 系统发生学 | 第12-13页 |
| 1.1.3 系统基因组学 | 第13-14页 |
| 1.2 植物谱系地理学研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 谱系地理学研究的现状 | 第14-15页 |
| 1.2.2 中国植物谱系地理学研究进展 | 第15-18页 |
| 1.2.3 谱系地理学发展趋势 | 第18页 |
| 1.3 物种形成研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.1 物种形成的内涵 | 第18页 |
| 1.3.2 兰科物种形成的挑战 | 第18-19页 |
| 1.4 保护遗传学研究进展 | 第19-21页 |
| 1.4.1 保护遗传学内涵 | 第19-20页 |
| 1.4.2 系统发育及谱系地理在植物保护中的应用 | 第20页 |
| 1.4.3 濒危物种的保护 | 第20-21页 |
| 1.5 石斛属的系统发生研究进展 | 第21-26页 |
| 1.5.1 石斛属的概况 | 第21页 |
| 1.5.2 石斛属系统发育研究进展 | 第21-22页 |
| 1.5.3 新旧版中国植物志中石斛物种的困惑 | 第22-26页 |
| 1.6 铁皮石斛研究进展 | 第26-27页 |
| 1.7 研究的目的与意义 | 第27-28页 |
| 第2章 石斛属植物组间关系及铁皮石斛的分类地位研究 | 第28-50页 |
| 2.1 引言 | 第28页 |
| 2.2 材料和方法 | 第28-32页 |
| 2.2.1 组表型特征描述 | 第28页 |
| 2.2.2 分类样本和序列选择 | 第28-29页 |
| 2.2.3 表型特征的系统发生分析 | 第29页 |
| 2.2.4 分子数据的系统发生分析 | 第29-32页 |
| 2.2.5 石斛属复合种的验证 | 第32页 |
| 2.3 结果与分析 | 第32-41页 |
| 2.3.1 表型系统发育分析 | 第32-34页 |
| 2.3.3 nrDNA ITS序列的核基因型分析 | 第34-38页 |
| 2.3.4 石斛组的系统发育分析 | 第38-40页 |
| 2.3.5 石斛属三个复合种的验证 | 第40-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-49页 |
| 2.4.1 表型与分子系统发育的不一致 | 第41页 |
| 2.4.2 石斛属的分类学 | 第41-47页 |
| 2.4.3 单源物种和近缘物种 | 第47-48页 |
| 2.4.4 复合种 | 第48-49页 |
| 2.5 结论 | 第49-50页 |
| 第3章 铁皮石斛及其近缘种的谱系地理学研究 | 第50-64页 |
| 3.1 引言 | 第50页 |
| 3.2 材料与方法 | 第50-54页 |
| 3.2.1 材料与基因型 | 第50-53页 |
| 3.2.2 叶绿体片段及核基因的筛选 | 第53页 |
| 3.2.3 序列分析及单倍型/核基因型的定义 | 第53页 |
| 3.2.4 单倍型的系统发育重建及分歧时间估计 | 第53-54页 |
| 3.2.5 居群遗传结构分析 | 第54页 |
| 3.2.6 居群历史动态分析 | 第54页 |
| 3.3 结果与分析 | 第54-60页 |
| 3.3.1 叶绿体单倍型变异与网状分析 | 第54页 |
| 3.3.2 叶绿体单倍型的居群分布 | 第54-57页 |
| 3.3.3 铁皮石斛居群的遗传结构 | 第57-58页 |
| 3.3.4 铁皮石斛及其近缘种nrDNA ITS核基因型分析 | 第58页 |
| 3.3.5 单倍型分歧年代及铁皮石斛居群历史动态分析 | 第58-60页 |
| 3.4 讨论 | 第60-64页 |
| 3.4.1 铁皮石斛近缘种的物种形成 | 第60-61页 |
| 3.4.2 铁皮石斛的居群扩张事件 | 第61-62页 |
| 3.4.3 铁皮石斛居群的进化显著性单元 | 第62-64页 |
| 第4章 铁皮石斛野生居群的遗传多样性及遗传结构分析 | 第64-75页 |
| 4.1 引言 | 第64页 |
| 4.2 材料与方法 | 第64-67页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第64-65页 |
| 4.2.2 微卫星数据的获取及质量控制 | 第65-66页 |
| 4.2.3 遗传多样性分析 | 第66-67页 |
| 4.2.4 居群遗传结构分析 | 第67页 |
| 4.2.5 距离隔离格局检验 | 第67页 |
| 4.2.6 瓶颈效应及遗传障碍检测 | 第67页 |
| 4.3 结果与分析 | 第67-71页 |
| 4.3.1 居群遗传多样性 | 第67-69页 |
| 4.3.2 居群的遗传结构 | 第69-71页 |
| 4.3.3 最近的统计事件 | 第71页 |
| 4.4 讨论 | 第71-75页 |
| 4.4.1 遗传多样性以及居群结构 | 第72-73页 |
| 4.4.2 最近的统计学事件 | 第73页 |
| 4.4.3 铁皮石斛保护和管理策略 | 第73-75页 |
| 第5章 人工种质圃中铁皮石斛种质的遗传结构与保护 | 第75-84页 |
| 5.1 引言 | 第75-76页 |
| 5.2 材料与方法 | 第76-78页 |
| 5.2.1 材料收集及DNA提取 | 第76页 |
| 5.2.2 nSSR引物 | 第76-77页 |
| 5.2.3 PCR扩增及检测 | 第77页 |
| 5.2.4 统计分析 | 第77-78页 |
| 5.3 结果与分析 | 第78-82页 |
| 5.3.1 nSSR标记的遗传多样性 | 第78-79页 |
| 5.3.2 种质资源及野生资源的遗传多样性分析 | 第79-80页 |
| 5.3.3 种质资源及野生资源的遗传结构分析 | 第80-82页 |
| 5.4 讨论 | 第82-84页 |
| 第6章 结论及展望 | 第84-86页 |
| 6.1 结论 | 第84-85页 |
| 6.2 展望 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-104页 |
| 附录 | 第104-117页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
