英语缩略词 | 第12-13页 |
摘要 | 第13-16页 |
ABSTRACT | 第16-18页 |
第一章 鼻咽癌放疗反应相关的医学分子生物学标志 | 第19-78页 |
导论(含文献综述) | 第19-30页 |
1. 鼻咽癌的诊断和治疗 | 第19-22页 |
2. 鼻咽癌内镜下的肿瘤微血管显露 | 第22-25页 |
3. EB病毒与鼻咽癌 | 第25-29页 |
基本研究策略 | 第29-30页 |
结果 | 第30-55页 |
1. 鼻咽镜下肿瘤表面微血管显露与鼻咽癌放疗反应之间的关系 | 第30-36页 |
1.1 鼻咽癌病例入组及其基本特征 | 第30-31页 |
1.2 鼻咽镜下肿瘤表面微血管显露情况与放疗反应联合分析 | 第31-33页 |
1.3 鼻咽癌肿瘤组织中VEGF、EGFR和Ki67的蛋白表达 | 第33-36页 |
2. 鼻咽癌肿瘤组织放疗反应相关差异表达microRNA的筛选分析 | 第36-44页 |
2.1 鼻咽癌病例入组及其基本特征 | 第36页 |
2.2 鼻咽癌放疗反应相关的microRNA表达谱 | 第36-40页 |
2.3 鼻咽癌放疗反应相关差异表达microRNA的靶基因预测 | 第40-44页 |
3. 不同放疗反应的鼻咽癌转录组测序分析 | 第44-51页 |
3.1 用于转录组测序的鼻咽癌病例入组及其基本特征 | 第44页 |
3.2 鼻咽癌患者肿瘤及其癌旁组织转录组测序 | 第44页 |
3.3 鼻咽癌患者肿瘤及其癌旁组织转录组测序数据质量控制 | 第44-47页 |
3.4 鼻咽癌组织转录组测序差异表达基因的筛选 | 第47-49页 |
3.5 鼻咽癌差异表达基因的功能富集分析 | 第49-51页 |
4. EB病毒基因在鼻咽癌患者肿瘤组织中的表达 | 第51-55页 |
讨论 | 第55-61页 |
1. 临床相关研究质量控制 | 第55页 |
2. 窄带成像内镜下鼻咽癌肿瘤表面微血管显露情况 | 第55-57页 |
3. 不同放疗反应鼻咽癌患者肿瘤组织中差异microRNA表达谱的筛选和功能富集 | 第57-58页 |
4. 鼻咽癌不同放疗反应及不同血管显露情况的转录组测序分析 | 第58-60页 |
5. EB病毒编码的基因产物在鼻咽癌肿瘤组织中的表达 | 第60-61页 |
本章小结 | 第61-62页 |
材料与方法 | 第62-78页 |
一、实验材料 | 第62-69页 |
1. 鼻咽癌患者及其生物学样品 | 第62-63页 |
1.1 新鲜冻存鼻咽癌组织 | 第62页 |
1.2 福尔马林固定石蜡包埋鼻咽癌组织 | 第62-63页 |
2. 细胞系 | 第63页 |
3. 临床样品收集和制备所需试剂 | 第63页 |
4. Realtime-PCR试剂 | 第63-64页 |
5. 抗体 | 第64页 |
6. 主要试剂盒 | 第64-65页 |
7. 细胞培养试剂 | 第65页 |
8. 免疫组织化学试剂 | 第65-66页 |
9. 常用试剂的配制 | 第66-68页 |
10. 主要仪器 | 第68-69页 |
11. RNA质量控制、生物信息分析 | 第69页 |
二、实验方法 | 第69-78页 |
1. 总RNA样品的提取、制备及质量鉴定 | 第69-71页 |
1.1 提取新鲜冻存鼻咽癌和膀胱癌肿瘤组织标本总RNA | 第69-70页 |
1.2 RNA样品的质量鉴定 | 第70页 |
1.3 RNA样品的纯化 | 第70-71页 |
2. 基因芯片检测microRNA表达谱 | 第71-74页 |
2.1 样品去磷酸化 | 第71页 |
2.2 变性 | 第71页 |
2.3 标记 | 第71-72页 |
2.4 准备杂交盒 | 第72-73页 |
2.5 芯片清洗 | 第73-74页 |
3. 细胞生物学方法 | 第74-76页 |
3.1 细胞复苏 | 第74页 |
3.2 细胞冻存 | 第74-75页 |
3.3 细胞传代 | 第75页 |
3.4 脂质体介导的细胞转染 | 第75页 |
3.5 CCK8检测细胞增殖曲线 | 第75页 |
3.6 细胞体外浸润分析 | 第75-76页 |
4. 免疫组织化学分析 | 第76页 |
4.1 免疫组织化学染色 | 第76页 |
4.2 免疫组织化学染色评分 | 第76页 |
5. RNA原位杂交 | 第76-77页 |
6. 统计学分析 | 第77-78页 |
第二章 OLC1基因在膀胱癌中异常表达及其医学生物学意义 | 第78-113页 |
导论(含文献综述) | 第78-86页 |
1. 膀胱癌概述 | 第78-80页 |
2. 膀胱癌分期与预后 | 第80-81页 |
3. 膀胱癌与吸烟 | 第81-82页 |
4. OLC1基因 | 第82-84页 |
5. 本课题的研究目的和研究策略 | 第84-85页 |
基本研究策略 | 第85-86页 |
结果 | 第86-97页 |
1. 膀胱癌病例入组及其基本特征 | 第86-88页 |
用于mRNA分析的膀胱癌病例信息 | 第86页 |
用于蛋白免疫组化分析的膀胱癌病例信息 | 第86-88页 |
2. OLC1基因mRNA在膀胱癌患者组织中的表达水平及其意义 | 第88-90页 |
2.1 膀胱癌肿瘤组织与正常黏膜组织中OLC1的mRNA表达水平 | 第88页 |
2.2 OLC1基因高表达与膀胱癌分期的关系 | 第88-89页 |
2.3 OLC1基因高表达与膀胱癌患者吸烟的关系 | 第89-90页 |
3. 膀胱癌组织中OLC1蛋白表达情况及其意义 | 第90-94页 |
3.1 OLC1蛋白在非肌层浸润性和肌层浸润性膀胱癌中的表达 | 第90-92页 |
3.2 膀胱癌肿瘤组织中OLC1蛋白表达与膀胱癌患者无瘤生存及总生存的关系 | 第92-94页 |
4. OLC1在膀胱癌中的功能探索 | 第94-97页 |
4.1 OLC1过表达膀胱癌细胞系的建立 | 第94-95页 |
4.2 OLC1过表达对膀胱癌细胞增殖的影响 | 第95页 |
4.3 OLC1过表达对膀胱癌细胞侵袭能力的影响 | 第95-97页 |
讨论 | 第97-100页 |
1. OLC1在膀胱癌中的表达 | 第97-98页 |
2. OLC1联合吸烟与膀胱癌分期和预后的关系 | 第98-99页 |
3. OLC1在膀胱癌细胞系中的表达及其功能 | 第99-100页 |
本章小结 | 第100-101页 |
材料与方法 | 第101-113页 |
一、实验材料 | 第101-104页 |
1. 膀胱癌患者及其生物学样品 | 第101-102页 |
1.1 新鲜冻存膀胱癌组织 | 第101页 |
1.2 福尔马林固定石蜡包埋膀胱癌组织 | 第101-102页 |
2. 细胞系 | 第102页 |
3. 菌株及质粒载体 | 第102页 |
4. PCR引物序列 | 第102-103页 |
5. 抗体 | 第103页 |
6. 蛋白提取和定量试剂 | 第103-104页 |
二、实验方法 | 第104-113页 |
1. 实时荧光定量PCR分析 | 第104-105页 |
1.1 RNA逆转录为cDNA | 第104页 |
1.2 实时荧光定量PCR的反应体系和反应条件 | 第104-105页 |
1.3 绘制标准曲线 | 第105页 |
1.4 样本检测 | 第105页 |
1.5 统计学分析 | 第105页 |
2. 质粒抽提 | 第105-106页 |
2.1 小量提取质粒DNA | 第105-106页 |
2.2 大量提取质粒DNA | 第106页 |
3. rTaq酶PCR反应 | 第106页 |
4. PCR产物胶回收 | 第106-107页 |
5. 细胞总蛋白提取及免疫印迹 | 第107-109页 |
5.1 裂解细胞收获总蛋白 | 第107页 |
5.2 蛋白质浓度的测定 | 第107页 |
5.3 聚丙烯凝胶电泳SDS-PAGE | 第107-108页 |
5.4 半干法蛋白转印 | 第108页 |
5.5 抗体孵育 | 第108页 |
5.6 化学发光显影 | 第108-109页 |
5.7 Western blot二次发光检测 | 第109页 |
6. 细胞生物学方法 | 第109-111页 |
6.1 细胞复苏 | 第109页 |
6.2 细胞冻存 | 第109-110页 |
6.3 细胞传代 | 第110页 |
6.4 脂质体介导的细胞转染 | 第110页 |
6.5 CCK8检测细胞增殖曲线 | 第110页 |
6.6 细胞体外浸润分析 | 第110-111页 |
7. 免疫组织化学分析 | 第111-112页 |
7.1 免疫组织化学染色 | 第111页 |
7.2 免疫组织化学染色评分 | 第111-112页 |
8. 统计学分析 | 第112-113页 |
参考文献 | 第113-121页 |
致谢 | 第121-123页 |