正则化自表示方法在蛋白质-ATP结合位点预测中的应用
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-11页 |
| 1.1.1 蛋白质的相关介绍 | 第8-9页 |
| 1.1.2 ATP | 第9-10页 |
| 1.1.3 研究意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第12-14页 |
| 第二章 数据集的构造 | 第14-21页 |
| 2.1 数据集 | 第14页 |
| 2.1.1 数据库相关介绍 | 第14页 |
| 2.1.2 数据集选取 | 第14页 |
| 2.2 特征来源介绍 | 第14-19页 |
| 2.2.1 PSSM位置特异性得分矩阵 | 第15-16页 |
| 2.2.2 蛋白质二级结构 | 第16-17页 |
| 2.2.3 二面角 | 第17-19页 |
| 2.2.4 残基保守得分 | 第19页 |
| 2.2.5 溶剂可及表面积 | 第19页 |
| 2.3 滑动窗口 | 第19-20页 |
| 2.4 不平衡样本处理 | 第20页 |
| 2.5 本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 特征选择方法介绍 | 第21-25页 |
| 3.1 特征选择 | 第21-22页 |
| 3.1.1 特征选择的定义 | 第21页 |
| 3.1.2 特征选择的目的 | 第21页 |
| 3.1.3 特征选择的研究现状 | 第21-22页 |
| 3.2 RSR | 第22-23页 |
| 3.3 优化算法 | 第23-24页 |
| 3.4 本章小结 | 第24-25页 |
| 第四章 实验设计与分析 | 第25-32页 |
| 4.1 支持向量机 | 第25-26页 |
| 4.1.1 SVM基本原理 | 第25页 |
| 4.1.2 LIBSVM | 第25-26页 |
| 4.2 评价标准 | 第26-27页 |
| 4.3 交叉验证 | 第27-28页 |
| 4.4 预测流程 | 第28-29页 |
| 4.5 实验设计 | 第29-31页 |
| 4.5.1 特征选择 | 第29页 |
| 4.5.2 特征选择前后对比实验 | 第29页 |
| 4.5.3 与其他预测方法对比 | 第29-31页 |
| 4.6 本章小结 | 第31-32页 |
| 第五章 总结与展望 | 第32-34页 |
| 5.1 工作总结 | 第32页 |
| 5.2 研究展望 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-36页 |
| 致谢 | 第36页 |
