| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 研究背景与研究意义 | 第10页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第10-12页 |
| 1.3 本文研究内容及各章节安排 | 第12-14页 |
| 第二章 蛋白质相互作用相关知识简介 | 第14-22页 |
| 2.1 预测蛋白质相互作用的计算方法 | 第14-17页 |
| 2.1.1 基于氨基酸序列的预测方法 | 第14-15页 |
| 2.1.2 基于蛋白质进化信息的预测方法 | 第15页 |
| 2.1.3 基于蛋白质结构的预测方法 | 第15-16页 |
| 2.1.4 其它预测方法 | 第16-17页 |
| 2.2 蛋白质相互作用数据库 | 第17-22页 |
| 2.2.1 DIP数据库 | 第18页 |
| 2.2.2 SWISS-PROT数据库 | 第18-19页 |
| 2.2.3 STRING数据库 | 第19-20页 |
| 2.2.4 HPRD数据库 | 第20-21页 |
| 2.2.5 其他常用蛋白质相互作用数据库 | 第21-22页 |
| 第三章 基于加权特征融合的蛋白质相互作用预测方法 | 第22-30页 |
| 3.1 实验流程框图 | 第22-23页 |
| 3.2 蛋白质特征提取 | 第23-27页 |
| 3.2.1 基于蛋白质的氨基酸特征选择和提取 | 第23-26页 |
| 3.2.2 基于蛋白质的进化信息特征选择和提取 | 第26-27页 |
| 3.3 加权特征融合 | 第27页 |
| 3.4 基于最大间隔准则MMC的特征选择方法 | 第27-29页 |
| 3.5 基于SVM的蛋白质相互作用预测 | 第29页 |
| 3.6 本章小结 | 第29-30页 |
| 第四章 算法结果与分析 | 第30-44页 |
| 4.1 数据集的选取及预处理 | 第30页 |
| 4.2 评价参数 | 第30-31页 |
| 4.3 方法实现与性能分析 | 第31-43页 |
| 4.3.1 使用不同融合权值对分类精确度的影响 | 第32页 |
| 4.3.2 使用融合特征对蛋白质相互作用预测性能的影响 | 第32-33页 |
| 4.3.3 特征选择方法对蛋白质相互作用预测性能的影响 | 第33-34页 |
| 4.3.4 不同分类器对蛋白质相互作用预测性能的影响 | 第34-41页 |
| 4.3.5 实验结果与分析 | 第41-42页 |
| 4.3.6 本文算法在独立测试集中的预测结果及其与其他方法的比较 | 第42-43页 |
| 4.4 本章小结 | 第43-44页 |
| 第五章 总结与展望 | 第44-46页 |
| 5.1 总结 | 第44页 |
| 5.2 研究展望 | 第44-46页 |
| 参考文献 | 第46-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 在学期间公开发表论文情况 | 第50页 |
