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典型内分泌干扰物与关键核受体相互作用的分子动力学模拟研究

摘要第8-12页
Abstract第12-16页
主要缩略词中英文对照第17-19页
本论文特色与创新第19-20页
第一章 绪论第20-42页
    引言第20-21页
    1.1 内分泌干扰物第21-22页
    1.2 内分泌干扰物识别方法第22-28页
        1.2.1 实验室测定法第22-23页
        1.2.2 计算机模拟法第23-27页
        1.2.3 现有研究方法优缺点分析第27-28页
    1.3 斑马鱼胚胎/幼鱼内分泌介导通路机制第28-34页
        1.3.1 内分泌干扰效应机制第29-32页
        1.3.2 核受体内分泌干扰调控通路第32-34页
    1.4 论文主要研究内容第34-37页
    参考文献第37-42页
第二章 分子动力学模拟识别黄酮类化合物抗雄活性研究第42-73页
    2.1 前言第42-43页
    2.2 材料与方法第43-51页
        2.2.1 细胞实验材料第43-47页
        2.2.2 细胞实验方法第47-48页
        2.2.3 数据处理第48-49页
        2.2.4 模拟实验第49-51页
    2.3 结果和讨论第51-69页
        2.3.1 黄酮类化合物抗雄激素活性第51-57页
        2.3.2 传统QSAR方法建模及缺陷分析第57-58页
        2.3.3 基于配体脱离和“鼠夹”现象识别化合物抗雄活性第58-60页
        2.3.4 基于氢键形成情况识别抗雄活性第60-64页
        2.3.5 基于配体在受体结合腔中的稳定性识别抗雄活性第64-66页
        2.3.6 基于配体-受体复合物H12链波动性识别抗雄活性第66-68页
        2.3.7 不同识别方法的组合第68-69页
    2.4 本章小结第69-70页
    参考文献第70-73页
第三章 分子动力学模拟识别PBDEs抗雄活性研究第73-93页
    3.1 前言第73-74页
    3.2 材料与方法第74-77页
        3.2.1 化合物及活性数据第74页
        3.2.2 对接和建模准备第74-76页
        3.2.3 分子对接第76页
        3.2.4 CoMFA和CoMSIA模型第76页
        3.2.5 动力学模拟第76-77页
        3.2.6 基于MD的定性区分模型第77页
    3.3 结果和讨论第77-89页
        3.3.1 定性识别PBDEs抗雄活性第77-84页
        3.3.2 定量模拟分析PBDEs抗雄活性第84-86页
        3.3.3 定性和定量模拟相结合第86-89页
    3.4 本章小结第89-90页
    参考文献第90-93页
第四章 分子动力学模拟识别PBDE及其羟基和甲氧基衍生物抗糖皮质激素活性第93-103页
    4.1 前言第93-95页
    4.2 材料与方法第95-97页
        4.2.1 化合物及活性数据第95-96页
        4.2.2 对接和建模准备第96-97页
        4.2.3 分子对接第97页
        4.2.4 动力学模拟第97页
        4.2.5 基于MD的定性区分模型第97页
    4.3 结果与讨论第97-100页
        4.3.1 配体波动性与GR活性第97-98页
        4.3.2 配体-受体复合物H12链的波动性与GR活性第98-99页
        4.3.3 基于MD的定性区分模型第99-100页
    4.4 本章小结第100-102页
    参考文献第102-103页
第五章 MD模拟识别TCEP产生斑马鱼内分泌干扰负效应中关键介导核受体研究第103-136页
    5.1 前言第103-104页
    5.2 材料与方法第104-108页
        5.2.1 细胞实验材料第104-105页
        5.2.2 斑马鱼驯化及胚胎收集第105-106页
        5.2.3 水暴露实验第106-107页
        5.2.4 水暴露过程中水中TCEP浓度的测定第107页
        5.2.5 模拟实验第107-108页
        5.2.6 量化实时聚合酶链反应(q-RT-PCR)第108页
        5.2.7 数据分析第108页
    5.3 结果和讨论第108-132页
        5.3.1 TCEP在斑马鱼幼鱼体内生物积累第108-110页
        5.3.2 TCEP对斑马鱼卵/幼鱼发育影响第110-112页
        5.3.3 对接和动力学模拟第112-118页
        5.3.4 TCEP的转录效应和核受体介导通路分析第118-129页
        5.3.5 讨论第129-132页
    5.4 本章小结第132-133页
    参考文献第133-136页
第六章 研究结论与展望第136-139页
    6.1 研究结论第136-137页
    6.2 展望第137-139页
攻读博士学位期间主要成果第139-141页
致谢第141-143页

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