| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 略缩词表 | 第8-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-22页 |
| 1.1 动物高海拔低氧适应的研究 | 第11-15页 |
| 1.1.1 呼吸量变化 | 第11-12页 |
| 1.1.2 血液理化指标改变 | 第12页 |
| 1.1.3 细胞呼吸代谢 | 第12-13页 |
| 1.1.4 低氧适应遗传分子调控机制 | 第13-15页 |
| 1.2 线粒体与低氧应激反应 | 第15-17页 |
| 1.2.1 线粒体基因组与低氧适应 | 第15-16页 |
| 1.2.2 线粒体拷贝数与低氧适应 | 第16-17页 |
| 1.2.3 线粒体氧化应激与低氧适应 | 第17页 |
| 1.3 线粒体基因组Long PCR技术 | 第17-18页 |
| 1.4 实时荧光定量PCR技术 | 第18-20页 |
| 1.4.1 实时荧光定量PCR技术发展 | 第18页 |
| 1.4.2 实时荧光定量PCR原理 | 第18-19页 |
| 1.4.3 实时荧光定量PCR检测线粒体拷贝数 | 第19-20页 |
| 1.5 转录组测序(RNA-seq) | 第20-22页 |
| 1.5.1 转录组测序原理及技术优势 | 第20-21页 |
| 1.5.2 转录组测序应用 | 第21-22页 |
| 2 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 2.1 研究目的 | 第22页 |
| 2.2 研究意义 | 第22-23页 |
| 3 材料和方法 | 第23-32页 |
| 3.1 试验材料 | 第23-25页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第23页 |
| 3.1.2 样品采集 | 第23页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第23-24页 |
| 3.1.4 主要仪器设备 | 第24-25页 |
| 3.2 试验地点 | 第25页 |
| 3.3 试验方法 | 第25-31页 |
| 3.3.1 基因组DNA抽提及DNA产物检测 | 第25-26页 |
| 3.3.2 Total RNA抽提及检测 | 第26-27页 |
| 3.3.3 Long PCR引物合成及反应体系 | 第27-28页 |
| 3.3.4 荧光定量引物设计合成 | 第28-29页 |
| 3.3.5 定量各样品中mtDNA拷贝数 | 第29-30页 |
| 3.3.6 RNA-seq测序 | 第30-31页 |
| 3.4 数据分析 | 第31-32页 |
| 4 结果与分析 | 第32-48页 |
| 4.1 线粒体DNA完整性检测 | 第32页 |
| 4.2 引物扩增效率检测 | 第32-33页 |
| 4.3 ATP6、COX1及ND1在不同组织的相对表达量差异检测 | 第33-34页 |
| 4.4 藏猪和荣昌猪的不同组织线粒体拷贝数差异分析 | 第34页 |
| 4.5 藏猪和荣昌猪的同一组织线粒体拷贝数差异分析 | 第34-35页 |
| 4.6 藏猪与荣昌猪眼肌组织转录组差异分析 | 第35-39页 |
| 4.6.1 藏猪和荣昌猪眼肌组织差异转录本鉴定 | 第35-36页 |
| 4.6.2 藏猪和荣昌猪眼肌组织差异转录本功能分析 | 第36-37页 |
| 4.6.3 藏猪高海拔低氧适应的相关基因 | 第37页 |
| 4.6.4 藏猪高海拔线粒体及能量代谢相关基因 | 第37-38页 |
| 4.6.5 调控线粒体拷贝数变化相关基因 | 第38-39页 |
| 4.7 线粒体拷贝数的多物种比较分析 | 第39-48页 |
| 4.7.1 多因素方差分析 | 第39-40页 |
| 4.7.2 高原与平原物种组织间线粒体拷贝数差异分析 | 第40-42页 |
| 4.7.3 高原物种与平原物种的组织内线粒体拷贝数差异分析 | 第42-46页 |
| 4.7.3.1 藏鸡与土鸡的线粒体拷贝数差异分析 | 第42-43页 |
| 4.7.3.2 牦牛与黄牛的线粒体拷贝数差异分析 | 第43-44页 |
| 4.7.3.3 藏绵羊与小尾寒羊的线粒体拷贝数差异分析 | 第44-45页 |
| 4.7.3.4 藏山羊与土山羊的线粒体拷贝数差异分析 | 第45-46页 |
| 4.7.4 多物种不同组织的线粒体拷贝数受海拔的影响 | 第46-48页 |
| 5 讨论 | 第48-53页 |
| 5.1 藏猪和荣昌猪眼肌组织转录组差异与功能的关系 | 第48-50页 |
| 5.1.1 低氧相关差异基因 | 第48-49页 |
| 5.1.2 线粒体及能量代谢相关差异基因 | 第49页 |
| 5.1.3 线粒体生成和自噬相关基因差异与功能 | 第49-50页 |
| 5.2 高原与平原物种线粒体拷贝数存在组织间差异 | 第50-51页 |
| 5.3 高原物种的线粒体拷贝数低于平原物种 | 第51-52页 |
| 5.4 物种间不同组织的线粒体拷贝数受海拔影响 | 第52-53页 |
| 6 结论 | 第53-54页 |
| 7 参考文献 | 第54-61页 |
| 附录 | 第61-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
