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重组大肠杆菌生产核黄素和β-胡萝卜素的途径构建与改造

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
第一章 文献综述第12-41页
   ·引言第12-13页
   ·核黄素的概述第13-26页
     ·核黄素的理化性质、功能、用途及市场需求第13-14页
     ·核黄素的合成第14-15页
     ·核黄素生物合成途径及其代谢调节机制第15-22页
     ·产核黄素菌株构建的国内外现状第22-26页
   ·β-胡萝卜素的概述第26-35页
     ·β-胡萝卜素的理化性质、功能和用途第27-29页
     ·β-胡萝卜素合成途径第29-31页
     ·E.coli β-胡萝卜素生物合成研究进展第31-35页
   ·大肠杆菌基因组无痕重组技术及策略第35-36页
     ·λ-Red重组系统第35-36页
     ·归巢核酸内切酶第36页
     ·成簇间隔短回文重复(CRISPR)编辑系统第36页
   ·选题背景及研究内容第36-41页
     ·大肠杆菌核黄素产核黄素菌株的构建第36-38页
     ·大肠杆菌产β-胡萝卜素的构建第38-41页
第二章 核黄素操纵子的构建和比较第41-70页
   ·实验材料第41-46页
     ·菌株与质粒第41-42页
     ·实验仪器第42-43页
     ·实验试剂第43-44页
     ·培养基第44-45页
     ·溶液第45-46页
   ·实验方法第46-60页
     ·大肠杆菌CaCl_2转化法感受态细胞的制备与转化第46-47页
     ·大肠杆菌电转化感受态的制备和电转化第47-48页
     ·基因组DNA的提取第48页
     ·大肠杆菌质粒DNA的提取第48-49页
     ·DNA片段的PCR扩增第49-52页
     ·琼脂糖凝胶电泳第52-53页
     ·DNA片段的回收和纯化第53-54页
     ·DNA片段的酶切和连接第54-55页
     ·菌落PCR验证第55-56页
     ·菌体培养与发酵第56-57页
     ·发酵液菌体浓度和葡萄糖的测定第57页
     ·发酵液中核黄素的测定第57页
     ·蛋白浓度测定第57-58页
     ·细胞粗酶液的制备第58-59页
     ·GTP环水解酶Ⅱ酶活力测定第59页
     ·核黄素合成酶酶活力测定第59-60页
   ·实验结果与讨论第60-69页
     ·大肠杆菌自身核黄素合成途径的重构第60-63页
     ·枯草芽孢杆菌核黄素操纵子的克隆第63-65页
     ·枯草芽孢杆菌核黄素操纵子的重构第65-67页
     ·系列工程菌株核黄素产量表征第67-68页
     ·GTP环水解酶Ⅱ酶和核黄素合成酶活力测定第68-69页
   ·本章小结第69-70页
第三章 产核黄素大肠杆菌中心碳代谢途径的代谢工程改造第70-93页
   ·实验材料第71-72页
     ·菌种和质粒第71-72页
     ·实验仪器第72页
     ·实验试剂第72页
     ·培养基第72页
     ·溶液第72页
   ·实验方法第72-81页
     ·Circular polymerase extension cloning第72-74页
     ·6-磷酸葡萄糖脱氢酶酶活力测定第74页
     ·6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶酶活力测定第74-75页
     ·Real-Time荧光定量PCR第75-78页
     ·发酵液中有机酸的检测第78-79页
     ·大肠杆菌基于λ-red和Ⅰ-SceⅠ的基因重组第79-81页
   ·实验结果与讨论第81-92页
     ·谷氨酸棒状杆菌突变型zwf~(243)和gnd~(361)基因的过表达质粒构建第81-82页
     ·氧化磷酸戊糖途径过表达质粒的构建第82-83页
     ·pgi基因敲除菌株的构建第83-85页
     ·ED途径敲除菌株的构建第85-87页
     ·acs基因过表达菌株的构建第87-89页
     ·氧化磷酸戊糖途径的改造对核黄素产量的影响第89-90页
     ·pgi基因和ED途径的敲除对核黄素产量的影响第90-91页
     ·acs基因的过表达对乙酸积累的影响第91-92页
   ·本章小结第92-93页
第四章 ribF基因的改造及发酵条件的优化第93-105页
   ·实验材料第93-94页
     ·菌种和质粒第93-94页
     ·实验仪器第94页
     ·实验试剂第94页
     ·培养基第94页
     ·溶液第94页
   ·实验方法第94-95页
     ·核黄素激酶酶活力测定第94-95页
   ·实验结果与讨论第95-104页
     ·ribF基因的改造第95-96页
     ·置换ribF基因野生RBS片段的构建第96-97页
     ·ribF基因野生RBS的置换第97-98页
     ·ribF基因的改造对核黄素产量的影响第98-99页
     ·发酵条件的优化第99-104页
   ·本章小结第104-105页
第五章 基于MEP途径的产β-胡萝卜素大肠杆菌构建第105-123页
   ·实验材料第105-107页
     ·菌种和质粒第105-107页
     ·实验仪器第107页
     ·实验试剂第107页
     ·培养基第107页
     ·溶液第107页
   ·实验方法第107-113页
     ·β-胡萝卜素的检测方法第107-108页
     ·β-胡萝卜素的发酵实验第108页
     ·基于CRISPR/Cas9系统λ-red重组第108-111页
     ·Golded Gate组装方法第111-112页
     ·gRNA质粒的构建第112-113页
   ·实验结果与讨论第113-122页
     ·整合β-胡萝卜素合成基因到大肠杆菌EcKan染色体上第113-115页
     ·MEP途径调控元件的片段构建第115-117页
     ·考察MEP途径单基因调控对β-胡萝卜素合成的影响第117-119页
     ·MEP途径的组合优化第119-122页
   ·本章小结第122-123页
第六章 中心碳代谢及MEP途径的组合优化对β-胡萝卜素产量的影响第123-143页
   ·实验材料第124-127页
     ·菌种和质粒第124-126页
     ·实验仪器第126-127页
     ·实验试剂第127页
     ·培养基第127页
     ·溶液第127页
   ·实验方法第127-128页
     ·高密度发酵重组大肠杆菌ZF237T第127-128页
   ·实验结果与讨论第128-142页
     ·中心碳代谢途径操作片段的构建第128-130页
     ·考察中心碳代谢单基因调控对β-胡萝卜素合成的影响第130-132页
     ·中心碳代谢组合操作对β-胡萝卜素合成的影响第132-134页
     ·β-胡萝卜素合成途径及MEP途径的组合操作第134-140页
     ·中心碳代谢及MEP途径的组合优化第140-141页
     ·高密度发酵产β-胡萝卜素重组大肠杆菌ZF237T第141-142页
   ·本章小结第142-143页
第七章 结论与展望第143-147页
   ·结论及创新点第143-145页
     ·主要结论第143-145页
     ·创新点第145页
   ·展望第145-147页
参考文献第147-166页
发表论文及参加科研情况说明第166-168页
附录第168-171页
致谢第171-172页

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