| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-42页 |
| ·家蚕 | 第12-13页 |
| ·miRNA | 第13-35页 |
| ·miRNA的生物合成 | 第14-15页 |
| ·miRNA生物合成的常规途径 | 第14页 |
| ·Mirtron途径 | 第14-15页 |
| ·与靶基因的作用方式 | 第15-20页 |
| ·miRNA的靶位点区域 | 第15-17页 |
| ·miRNA的调控方式 | 第17-19页 |
| ·miRNA上调基因表达的例子 | 第19-20页 |
| ·miRNA的生物学功能 | 第20-24页 |
| ·miRNA参与多种生理过程的调控 | 第20-22页 |
| ·miRNA与疾病发生 | 第22-24页 |
| ·miRNA~*的功能 | 第24-25页 |
| ·影响miRNA生物合成和功能的因素 | 第25-30页 |
| ·miRNA在生物合成中受到严格的调控 | 第25-27页 |
| ·RNA编辑对miRNA的影响 | 第27-29页 |
| ·甲基化对miRNA的影响 | 第29页 |
| ·单核苷酸多态性对miRNA的影响 | 第29页 |
| ·昼夜节律对miRNA的影响 | 第29-30页 |
| ·其它因素对miRNA的影响 | 第30页 |
| ·研究miRNA的方法 | 第30-35页 |
| ·实验方法 | 第30-32页 |
| ·传统的miRNA鉴定方法 | 第30-31页 |
| ·第二代测序技术 | 第31-32页 |
| ·第三代测序技术 | 第32页 |
| ·生物信息学方法 | 第32-35页 |
| ·miRNA研究常用的数据库 | 第32-33页 |
| ·鉴定和预测miRNA的软件 | 第33-34页 |
| ·预测miRNA的靶基因 | 第34-35页 |
| ·piRNAs(piwi-interacting RNAs) | 第35-38页 |
| ·piRNA的定义 | 第35页 |
| ·piRNA的分类 | 第35-37页 |
| ·特殊的piRNAs | 第37-38页 |
| ·21-U RNAs | 第37页 |
| ·rasiRNAs | 第37-38页 |
| ·内源siRNAs | 第38-39页 |
| ·其它非编码小RNA | 第39页 |
| ·RNAi的发展现状 | 第39-42页 |
| 第二章 家蚕非编码小RNA的鉴定及其靶基因功能研究 | 第42-82页 |
| ·材料与方法 | 第42-56页 |
| ·家蚕实验材料 | 第42页 |
| ·小RNA SOLID测序文库的构建 | 第42-48页 |
| ·Trizol法提取总RNA | 第43页 |
| ·小RNA片段的分离 | 第43-44页 |
| ·接头连接 | 第44页 |
| ·反转录及RNaseH消化 | 第44-45页 |
| ·小RNA文库的扩增及纯化 | 第45-47页 |
| ·emulsion PCR | 第47-48页 |
| ·高通量测序数据分析 | 第48-49页 |
| ·数据库资源 | 第48-49页 |
| ·数据分析流程 | 第49页 |
| ·预测新的miRNA | 第49页 |
| ·stem-loop RT PCR验证家蚕新的miRNAs | 第49-53页 |
| ·反转录体系及反应条件 | 第52-53页 |
| ·PCR反应体系及反应条件 | 第53页 |
| ·家蚕miRNA的靶基因预测 | 第53页 |
| ·部分miRNA在家蚕不同发育时期的表达量分析 | 第53-54页 |
| ·预测家蚕中可能存在的piRNA和esiRNA | 第54-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-80页 |
| ·SOLiD数据分析 | 第56-58页 |
| ·注释结果 | 第56-57页 |
| ·家蚕中已知的miRNA分子及其表达量 | 第57-58页 |
| ·预测和验证家蚕中新的miRNA | 第58-64页 |
| ·家蚕miRNA的SNP分析 | 第64-65页 |
| ·家蚕miRNA簇的分析 | 第65-67页 |
| ·家蚕miRNA的靶基因预测和分析 | 第67-73页 |
| ·部分miRNA在家蚕不同发育时期的表达差异分析 | 第73-77页 |
| ·家蚕piRNA和内源siRNA的预测和分析 | 第77-80页 |
| ·结论 | 第80页 |
| ·下一步工作与展望 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-98页 |
| 附录 | 第98-108页 |
| 学术会议 | 第108-109页 |
| 发表文章 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
