摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-13页 |
第一章:文献综述 | 第13-38页 |
·粘细菌的生态学研究 | 第13-15页 |
·粘细菌的主要栖息地 | 第13-14页 |
·极端生境下的粘细菌 | 第14-15页 |
·泥炭沼 | 第14页 |
·寒冷生境 | 第14页 |
·炽热生境 | 第14-15页 |
·高海拔生境 | 第15页 |
·盐环境 | 第15页 |
·厌氧环境 | 第15页 |
·海洋粘细菌的研究背景 | 第15-18页 |
·粘细菌的双运动系统 | 第18-34页 |
·粘细菌双运动系统的概述 | 第18-20页 |
·粘细菌S运动和A运动的运动机制 | 第20-28页 |
·S运动系统 | 第20-26页 |
·Type Ⅳ pili | 第20-23页 |
·Fibrils | 第23-25页 |
·LPS O-antigen | 第25-26页 |
·A运动系统 | 第26-28页 |
·双运动系统的功能 | 第28-31页 |
·鞭毛细菌 | 第28-29页 |
·滑行运动细菌 | 第29-31页 |
·粘细菌双运动系统相关基因及其功能描述 | 第31-34页 |
·S运动和A运动共同必需的基因 | 第31-32页 |
·S运动相关基因 | 第32-33页 |
·Tfp相关基因 | 第32页 |
·Fibrils相关基因 | 第32-33页 |
·LPS O-antigen相关基因 | 第33页 |
·A运动相关基因 | 第33页 |
·其他滑行运动相关基因 | 第33-34页 |
·粘细菌的社会学行为 | 第34-37页 |
·固体表面滑行运动 | 第34-35页 |
·子实体形态发生 | 第35-37页 |
·本文工作开展的思路 | 第37-38页 |
第二章:耐盐粘球菌的分离纯化与分类鉴定 | 第38-58页 |
·材料 | 第38-41页 |
·试剂 | 第38-39页 |
·培养基 | 第39-40页 |
·样品 | 第40页 |
·仪器 | 第40-41页 |
·分析软件 | 第41页 |
·方法 | 第41-46页 |
·海洋粘细菌的分离纯化方法 | 第41-43页 |
·海洋粘细菌的形态学观察 | 第43页 |
·粘细菌染色体DNA的提取方法 | 第43-44页 |
·16S rDNA序列扩增 | 第44-45页 |
·16S rDNA测序与分析 | 第45-46页 |
·结果与分析 | 第46-57页 |
·海洋粘细菌的分离纯化 | 第46页 |
·海洋粘细菌的特异性区域分布 | 第46-48页 |
·海洋粘细菌的形态学观察 | 第48-50页 |
·海洋粘细菌的耐盐能力分析 | 第50-53页 |
·耐盐粘球菌的16S rDNA系统分类 | 第53-55页 |
·耐盐粘球菌的子实体形态发生 | 第55-57页 |
·本章小结 | 第57-58页 |
第三章:耐盐粘球菌社会学行为的表型观察 | 第58-74页 |
·材料 | 第58-59页 |
·菌株 | 第58-59页 |
·培养基 | 第59页 |
·仪器与分析软件 | 第59页 |
·方法 | 第59-60页 |
·细胞在软硬琼脂上的滑行运动观察 | 第59-60页 |
·单个细胞运动速率的观察 | 第60页 |
·结果与分析 | 第60-73页 |
·海水对非耐盐粘球菌滑行运动的影响 | 第61-63页 |
·海水对不同耐盐粘球菌滑行运动的影响 | 第63-68页 |
·不同海水浓度对耐盐粘球菌滑行运动的影响 | 第68-69页 |
·贫瘠培养基和营养培养基上的滑行运动差异 | 第69-70页 |
·软硬琼脂实验中的几条经验 | 第70-71页 |
·耐盐粘球菌运动速率的检测 | 第71-73页 |
·本章小结 | 第73-74页 |
第四章:耐盐粘球菌社会学行为的机理研究 | 第74-103页 |
·材料 | 第74-77页 |
·菌株 | 第74页 |
·培养基 | 第74页 |
·试剂与试剂盒 | 第74-76页 |
·实验器材与仪器 | 第76-77页 |
·分析软件 | 第77页 |
·方法 | 第77-84页 |
·细胞表面结构的透射电镜观察 | 第77-78页 |
·利用Microarray技术研究耐盐粘球菌运动相关基因的表达谱 | 第78-84页 |
·序列分析 | 第78页 |
·引物设计 | 第78页 |
·粘细菌基因组DNA的提取 | 第78页 |
·靶DNA的PCR扩增及产物纯化 | 第78-79页 |
·Microarray的制备 | 第79-80页 |
·芯片质量检测与比较基因组杂交 | 第80页 |
·粘细菌总RNA的提取 | 第80页 |
·DNase I消化RNA提取物 | 第80-81页 |
·cDNA反转录条件的优化 | 第81-82页 |
·cDNA反转录合成及纯化 | 第82页 |
·基因组DNA/cDNA产物的荧光标记 | 第82-83页 |
·芯片杂交与洗涤 | 第83-84页 |
·芯片杂交结果的检测与分析 | 第84页 |
·结果与分析 | 第84-102页 |
·耐盐粘球菌细胞表面结构的透射电镜观察 | 第84-89页 |
·不同耐盐粘球菌的Tfp观察结果 | 第85-86页 |
·高耐盐粘球菌HW-1在不同条件下的细胞表面结构观察结果与分析 | 第86-88页 |
·利用TEM观察粘球菌细胞表面结构的几条经验 | 第88-89页 |
·利用Microarray技术分析高耐盐粘球菌HW-1运动相关基因的表达谱 | 第89-102页 |
·粘球菌运动相关基因的序列分析 | 第89页 |
·芯片制备所需的运动相关基因引物设计与合成 | 第89-91页 |
·靶DNA的PCR扩增结果 | 第91-92页 |
·总RNA提取结果 | 第92-93页 |
·芯片质量检测与比较基因组杂交 | 第93-96页 |
·反转录条件的优化与确定 | 第96页 |
·Microarray数据的归一化处理(Normalization) | 第96-98页 |
·淡水与海水条件下耐盐粘球菌HW-1运动相关基因的差异表达 | 第98-99页 |
·淡水与海水条件下耐盐粘球菌HW-1中显著差异表达基因的分析 | 第99-102页 |
·本章小结 | 第102-103页 |
结束语 | 第103-104页 |
附录 | 第104-112页 |
附录一:S运动系统相关基因信息统计表 | 第104-107页 |
附录二:A运动系统相关基因信息统计表 | 第107-109页 |
附录三:用于表达芯片制备的60个运动相关基因片段的引物 | 第109-112页 |
参考文献 | 第112-122页 |
致谢 | 第122-123页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第123-124页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第124页 |