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耐盐粘球菌的社会学行为及其对海洋环境的适应策略

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-13页
第一章:文献综述第13-38页
   ·粘细菌的生态学研究第13-15页
     ·粘细菌的主要栖息地第13-14页
     ·极端生境下的粘细菌第14-15页
       ·泥炭沼第14页
       ·寒冷生境第14页
       ·炽热生境第14-15页
       ·高海拔生境第15页
       ·盐环境第15页
       ·厌氧环境第15页
   ·海洋粘细菌的研究背景第15-18页
   ·粘细菌的双运动系统第18-34页
     ·粘细菌双运动系统的概述第18-20页
     ·粘细菌S运动和A运动的运动机制第20-28页
       ·S运动系统第20-26页
         ·Type Ⅳ pili第20-23页
         ·Fibrils第23-25页
         ·LPS O-antigen第25-26页
       ·A运动系统第26-28页
     ·双运动系统的功能第28-31页
       ·鞭毛细菌第28-29页
       ·滑行运动细菌第29-31页
     ·粘细菌双运动系统相关基因及其功能描述第31-34页
       ·S运动和A运动共同必需的基因第31-32页
       ·S运动相关基因第32-33页
         ·Tfp相关基因第32页
         ·Fibrils相关基因第32-33页
         ·LPS O-antigen相关基因第33页
       ·A运动相关基因第33页
       ·其他滑行运动相关基因第33-34页
   ·粘细菌的社会学行为第34-37页
     ·固体表面滑行运动第34-35页
     ·子实体形态发生第35-37页
   ·本文工作开展的思路第37-38页
第二章:耐盐粘球菌的分离纯化与分类鉴定第38-58页
   ·材料第38-41页
     ·试剂第38-39页
     ·培养基第39-40页
     ·样品第40页
     ·仪器第40-41页
     ·分析软件第41页
   ·方法第41-46页
     ·海洋粘细菌的分离纯化方法第41-43页
     ·海洋粘细菌的形态学观察第43页
     ·粘细菌染色体DNA的提取方法第43-44页
     ·16S rDNA序列扩增第44-45页
     ·16S rDNA测序与分析第45-46页
   ·结果与分析第46-57页
     ·海洋粘细菌的分离纯化第46页
     ·海洋粘细菌的特异性区域分布第46-48页
     ·海洋粘细菌的形态学观察第48-50页
     ·海洋粘细菌的耐盐能力分析第50-53页
     ·耐盐粘球菌的16S rDNA系统分类第53-55页
     ·耐盐粘球菌的子实体形态发生第55-57页
   ·本章小结第57-58页
第三章:耐盐粘球菌社会学行为的表型观察第58-74页
   ·材料第58-59页
     ·菌株第58-59页
     ·培养基第59页
     ·仪器与分析软件第59页
   ·方法第59-60页
     ·细胞在软硬琼脂上的滑行运动观察第59-60页
     ·单个细胞运动速率的观察第60页
   ·结果与分析第60-73页
     ·海水对非耐盐粘球菌滑行运动的影响第61-63页
     ·海水对不同耐盐粘球菌滑行运动的影响第63-68页
     ·不同海水浓度对耐盐粘球菌滑行运动的影响第68-69页
     ·贫瘠培养基和营养培养基上的滑行运动差异第69-70页
     ·软硬琼脂实验中的几条经验第70-71页
     ·耐盐粘球菌运动速率的检测第71-73页
   ·本章小结第73-74页
第四章:耐盐粘球菌社会学行为的机理研究第74-103页
   ·材料第74-77页
     ·菌株第74页
     ·培养基第74页
     ·试剂与试剂盒第74-76页
     ·实验器材与仪器第76-77页
     ·分析软件第77页
   ·方法第77-84页
     ·细胞表面结构的透射电镜观察第77-78页
     ·利用Microarray技术研究耐盐粘球菌运动相关基因的表达谱第78-84页
       ·序列分析第78页
       ·引物设计第78页
       ·粘细菌基因组DNA的提取第78页
       ·靶DNA的PCR扩增及产物纯化第78-79页
       ·Microarray的制备第79-80页
       ·芯片质量检测与比较基因组杂交第80页
       ·粘细菌总RNA的提取第80页
       ·DNase I消化RNA提取物第80-81页
       ·cDNA反转录条件的优化第81-82页
       ·cDNA反转录合成及纯化第82页
       ·基因组DNA/cDNA产物的荧光标记第82-83页
       ·芯片杂交与洗涤第83-84页
       ·芯片杂交结果的检测与分析第84页
   ·结果与分析第84-102页
     ·耐盐粘球菌细胞表面结构的透射电镜观察第84-89页
       ·不同耐盐粘球菌的Tfp观察结果第85-86页
       ·高耐盐粘球菌HW-1在不同条件下的细胞表面结构观察结果与分析第86-88页
       ·利用TEM观察粘球菌细胞表面结构的几条经验第88-89页
     ·利用Microarray技术分析高耐盐粘球菌HW-1运动相关基因的表达谱第89-102页
       ·粘球菌运动相关基因的序列分析第89页
       ·芯片制备所需的运动相关基因引物设计与合成第89-91页
       ·靶DNA的PCR扩增结果第91-92页
       ·总RNA提取结果第92-93页
       ·芯片质量检测与比较基因组杂交第93-96页
       ·反转录条件的优化与确定第96页
       ·Microarray数据的归一化处理(Normalization)第96-98页
       ·淡水与海水条件下耐盐粘球菌HW-1运动相关基因的差异表达第98-99页
       ·淡水与海水条件下耐盐粘球菌HW-1中显著差异表达基因的分析第99-102页
   ·本章小结第102-103页
结束语第103-104页
附录第104-112页
 附录一:S运动系统相关基因信息统计表第104-107页
 附录二:A运动系统相关基因信息统计表第107-109页
 附录三:用于表达芯片制备的60个运动相关基因片段的引物第109-112页
参考文献第112-122页
致谢第122-123页
攻读学位期间发表的学术论文第123-124页
学位论文评阅及答辩情况表第124页

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