| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 縮略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 棉花海陆种间导入系的构建 | 第14-36页 |
| ·前言 | 第14-21页 |
| ·导入系简介 | 第14-15页 |
| ·导入系在小麦育种中的应用价值 | 第15-16页 |
| ·导入系在油菜育种中的应用价值 | 第16-17页 |
| ·导入系在水稻育种中的应用价值 | 第17-20页 |
| ·将导入系用于棉花育种 | 第20-21页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第21页 |
| ·材料与方法 | 第21-24页 |
| ·试验材料 | 第21-22页 |
| ·试验方法 | 第22-24页 |
| ·结果与分析 | 第24-32页 |
| ·分子标记对2008年选中单株的基因型分析 | 第24-26页 |
| ·新选标记对2009年选中单株的基因型分析 | 第26-28页 |
| ·新选标记对2010年选中单株的基因型分析 | 第28-29页 |
| ·新选标记对2011年选中单株的基因型分析 | 第29-30页 |
| ·新选标记对2012年选中单株的基因型分析 | 第30-32页 |
| ·讨论 | 第32-36页 |
| ·构建棉花种间导入系时的亲本选择 | 第32-33页 |
| ·分子标记辅助选择构建棉花种间导入系的可行性 | 第33-34页 |
| ·分子标记辅助选择时所用标记密度的确定 | 第34页 |
| ·本研究所构建导入系群体的育种价值 | 第34-36页 |
| 第二章 棉花新型遗传标记的开发及遗传评价 | 第36-77页 |
| ·前言 | 第36-43页 |
| ·作物遗传标记的发展 | 第36页 |
| ·棉花DNA分子标记的发展 | 第36-40页 |
| ·分子标记技术中分型技术的发展 | 第40-42页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第42-43页 |
| ·材料与方法 | 第43-48页 |
| ·植物材料 | 第43-44页 |
| ·棉花纤维发育特异或优势表达基因标记的开发 | 第44页 |
| ·利用in-silico开发棉花SNP和IDP标记的方法 | 第44-46页 |
| ·亚基因组特异标记的开发 | 第46页 |
| ·PCR扩增及基因型分析 | 第46-47页 |
| ·多态性标记的定位 | 第47页 |
| ·RT-PCR和qRT-PCR分析 | 第47页 |
| ·棉花海陆种间差异表达的纤维发育相关基因的GO分析 | 第47-48页 |
| ·棉花碱基变异的规律统计及功能聚集分析 | 第48页 |
| ·棉花SNP和IDP标记的偏分离分析 | 第48页 |
| ·扩增产物的碱基序列分析 | 第48页 |
| ·结果与分析 | 第48-70页 |
| ·棉花纤维发育相关功能标记的开发与多态性分析 | 第48-49页 |
| ·棉花纤维发育相关功能标记的染色体分布情况 | 第49-54页 |
| ·棉花纤维发育相关基因在海陆棉种间的表达量差异分析 | 第54-56页 |
| ·棉花海陆种间差异表达的纤维发育相关基因的GO分析 | 第56-59页 |
| ·In-silico方法分析鉴定棉花SNPs/IDPs及引物设计 | 第59-62页 |
| ·棉花SNP和IDP标记的多态性情况 | 第62-63页 |
| ·新开发棉花SNP和IDP标记在连锁图的分布及偏分离情况 | 第63-65页 |
| ·棉花碱基变异的规律统计及功能聚集分析 | 第65-68页 |
| ·棉花SNP标记对作图亲本扩增产物的序列分析 | 第68-70页 |
| ·棉花亚基因组特异标记的开发及其实验结果 | 第70页 |
| ·讨论 | 第70-77页 |
| ·棉花纤维发育相关功能标记的低多态性 | 第70-71页 |
| ·棉花纤维发育相关功能标记在连锁图上的均匀分散分布 | 第71页 |
| ·棉花纤维发育相关基因在海陆棉种间的表达量差异分析 | 第71-72页 |
| ·棉花纤维发育生物进程的复杂性 | 第72-73页 |
| ·关于用in-silico方法预测棉花SNPs的几点讨论 | 第73-74页 |
| ·不同策略所开发棉花SNP和IDP标记的多态性比较 | 第74页 |
| ·棉花SNP和IDP标记对图谱加密及偏分离研究的重要意义 | 第74-75页 |
| ·关于棉花碱基变异规律及功能聚集情况的几点讨论 | 第75页 |
| ·In-silico方法是开发棉花SNP标记的一把双刃剑 | 第75-76页 |
| ·关于本研究开发的亚基因组特异引物 | 第76-77页 |
| 第三章 棉花海陆种间高密度遗传连锁图谱的构建 | 第77-127页 |
| ·前言 | 第77-87页 |
| ·作图标记的发展 | 第77-78页 |
| ·作图群体的发展 | 第78-80页 |
| ·遗传连锁图谱的构建方法及相关软件的发展 | 第80-81页 |
| ·棉花遗传连锁图谱的研究进展 | 第81-83页 |
| ·高密度遗传连锁图谱的应用 | 第83-85页 |
| ·棉花比较基因组学研究进展 | 第85-86页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第86-87页 |
| ·材料与方法 | 第87-88页 |
| ·植物材料 | 第87页 |
| ·引物来源 | 第87-88页 |
| ·PCR扩增及基因型分析 | 第88页 |
| ·序列分析 | 第88页 |
| ·遗传连锁图谱的构建 | 第88页 |
| ·基于遗传图谱的染色体共线性分析和比较基因组学研究 | 第88页 |
| ·结果与分析 | 第88-120页 |
| ·本研究所用各系列引物的多态性情况 | 第88-90页 |
| ·经SSCP标记技术反应出多态性的SSR引物的相关分析 | 第90-93页 |
| ·本研究中所构建的高密度遗传连锁图的特征分析 | 第93-103页 |
| ·异源四倍体棉花染色体间的共线性分析 | 第103-107页 |
| ·基于遗传图谱的棉花比较基因组学研究 | 第107-120页 |
| ·讨论 | 第120-127页 |
| ·图谱构建中作图群体的选择 | 第120-121页 |
| ·关于本研究中所用的几种标记类型 | 第121-123页 |
| ·SSCP技术可经济有效地使单态性SSRs产生多态性 | 第123-124页 |
| ·遗传连锁图谱加密前后的比较分析 | 第124-125页 |
| ·异源四倍体棉花染色体间的共线性关系 | 第125页 |
| ·基于遗传图谱的棉花比较基因组学 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-142页 |
| 附录 | 第142-143页 |
| 致谢 | 第143-144页 |
