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油菜(Brassica napus)miRNA的鉴定及Bna-miR1140表达调控机制研究

摘要第1-7页
Abstract第7-10页
目录第10-13页
缩略词表第13-14页
绪论第14-16页
第一章 文献综述第16-27页
 1 miRNA的定义及发现第16-17页
 2 miRNA 的产生机理和作用机制第17-20页
   ·miRNA 的产生机理第17-18页
   ·miRNA 的作用机制第18-20页
 3 miRNA 的鉴别和分离第20-21页
   ·传统方法第20页
   ·高通量测序技术第20页
   ·小分子 RNA 高通量 Solexa 测序技术原理第20-21页
 4 miRNA 靶基因的检测第21-22页
   ·生物信息学预测第21页
   ·miRNA 芯片技术第21-22页
   ·降解组测序法第22页
 5 植物 miRNA 的生物学功能研究第22-25页
   ·miRNA 在植物生长发育过程中的功能第23页
   ·miRNA 参与植物激素的信号传导第23-24页
   ·miRNA 参与植物的逆境应答第24-25页
     ·参与非生物胁迫应答第24-25页
     ·参与生物胁迫应答第25页
   ·miRNA 参与自身的生物合成途径的调控第25页
 6 本研究的目的意义第25-27页
第二章 利用 Solexa 技术鉴定油菜新 miRNA第27-51页
 1 实验材料与方法第28-30页
   ·植物材料第28页
   ·方法第28-30页
     ·RNA 的提取及用于 Solexa 测序的 sRNA 文库和降解组 cDNA 文库构建第28页
     ·生物信息学分析第28-29页
     ·甘蓝型油菜 miRNAs 的终点 PCR 和实时荧光定量 PCR 分析第29-30页
 2 结果与分析第30-48页
   ·利用 Solexa 技术测序甘蓝型油菜 miRNAs第30-31页
   ·甘蓝型油菜保守 miRNAs 的鉴定第31页
   ·芸薹属新候选的 miRNAs第31-40页
   ·茎环 qRT-PCR 验证甘蓝型油菜 miRNAs第40-41页
   ·油菜保守 miRNAs 的靶基因第41-46页
   ·芸薹属新候选的 miRNA 靶基因第46-48页
 3 讨论第48-51页
第三章 油菜 Bna-miR1140 基因的分离与过表达分析第51-76页
 1 实验材料与方法第51-66页
   ·材料第51-52页
     ·植物材料第51页
     ·菌株和载体第51页
     ·酶、试剂盒和主要的化学试剂第51页
     ·主要仪器第51-52页
   ·方法第52-66页
     ·引物设计第52页
     ·总 RNA 的提取及纯化第52-53页
     ·油菜 RNA 的反转录第53-54页
     ·油菜 Bna-miR1140 基因前体片段的克隆第54-57页
     ·构建油菜 Bna-miR1140 基因植物过表达载体第57-59页
     ·农杆菌 LBA4404 电击感受态制备及 35S::Bna-miR1140 质粒转化农杆菌第59-61页
     ·油菜的转化及阳性植株鉴定第61-66页
 2 结果与分析第66-74页
   ·油菜叶、叶柄、茎、根和芽总 RNA 的提取第66页
   ·油菜 Bna-miR1140 基因前体片段的获得第66-68页
   ·油菜 Bna-miR1140 基因植物过表达载体的构建及农杆菌转化第68-69页
   ·过表达载体 35S::Bna-miR1140 转化油菜和转基因苗筛选第69-70页
   ·转化 35S::Bna-miR1140 油菜株的 PCR 鉴定第70-71页
   ·转化 35S::Bna-miR1140 油菜株 T0 代表型分析第71-73页
   ·转化 35S::Bna-miR1140 油菜株 T1 代田间表型分析第73-74页
 3 讨论第74-76页
第四章 油菜 Bna-miR1140 启动子 miR1140Pro 的克隆与表达模式研究第76-90页
 1 实验材料与方法第76-82页
   ·材料第76页
     ·植物材料第76页
     ·菌株和载体第76页
     ·酶、试剂盒和主要的化学试剂第76页
     ·主要仪器第76页
   ·方法第76-82页
     ·引物设计第76-77页
     ·油菜基因组 DNA 的提取第77页
     ·Bna-miR1140 启动子的克隆第77-79页
     ·构建油菜 miR1140 Pro::GUS 植物表达载体第79-81页
     ·miR1140 Pro::GUS 质粒转化农杆菌 LBA4404 及农杆菌阳性重组子的鉴定第81页
     ·miR1140 Pro::GUS 转化油菜和 T0 代阳性株 PCR 鉴定第81-82页
     ·转 miR1140 Pro::GUS 油菜 T1 代阳性株组织化学染色第82页
 2 结果与分析第82-88页
   ·油菜 Bna-miR1140 启动子片段的获得第82-84页
   ·油菜 Bna-miR1140 启动子植物表达载体的构建及农杆菌转化第84-86页
   ·miR1140 Pro::GUS 转化油菜及 T0 代阳性株的获得第86-88页
   ·转 miR1140 Pro::GUS 油菜 T1 代阳性株组织化学染色鉴定第88页
 3 讨论第88-90页
第五章 全文结论和创新点及研究展望第90-92页
 1 主要结论第90页
   ·油菜新 miRNAs 及其靶基因的鉴定第90页
   ·油菜 Bna-miR1140 基因的分离与过表达第90页
   ·油菜 Bna-miR1140 启动子的克隆与调控模式第90页
 2 本项目的特色与创新点第90-91页
 3 研究展望第91-92页
参考文献第92-105页
附录第105-119页
致谢第119-120页
作者简介第120页
在学期间发表的文章第120-121页
导师评阅表第121页

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