| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-12页 |
| 缩略词表（List ofAbbreviation） | 第12-14页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-32页 |
| ·彩色棉研究进展 | 第15-19页 |
| ·彩色棉的栽培历史 | 第15页 |
| ·彩色棉的种植和利用状况 | 第15-16页 |
| ·彩色棉的纤维结构与发育特点 | 第16-17页 |
| ·彩色棉纤维色素的沉积及性质研究 | 第17-19页 |
| ·天然彩色棉色素合成相关基因的研究 | 第19页 |
| ·蛋白质组学和研究技术 | 第19-25页 |
| ·蛋白质组学概念和研究内容 | 第20页 |
| ·蛋白质组学产生的背景 | 第20-21页 |
| ·蛋白质组学的研究技术 | 第21-25页 |
| ·棉花蛋白质组学研究进展 | 第25-28页 |
| ·样品制备 | 第26页 |
| ·棉花纤维发育机理研究 | 第26-27页 |
| ·棉花其它方面蛋白质组研究 | 第27页 |
| ·生物信息学分析 | 第27-28页 |
| ·前景和展望 | 第28-29页 |
| ·本研究的目的 | 第29-32页 |
| 第二章 棕色棉及其白色近等基因系纤维的比较蛋白质组学研究 | 第32-53页 |
| ·材料与方法 | 第32-35页 |
| ·植物材料 | 第32页 |
| ·仪器设备与分子生物学试剂 | 第32页 |
| ·棉纤维蛋白质的提取和定量 | 第32-33页 |
| ·双向电泳（2-DE） | 第33页 |
| ·2-DE 凝胶图像分析 | 第33-34页 |
| ·蛋白点胶内酶解 | 第34页 |
| ·质谱鉴定 | 第34页 |
| ·实时荧光定量 PCR 分析 | 第34页 |
| ·棉纤维的 DMACA 染色 | 第34-35页 |
| ·结果与分析 | 第35-50页 |
| ·新彩棉 5 号和 NIL5 的纤维品质性状比较 | 第35-36页 |
| ·2-DE 电泳分析 | 第36-39页 |
| ·差异蛋白点的鉴定 | 第39-45页 |
| ·qPCR 验证 | 第45-46页 |
| ·差异蛋白点的功能分类 | 第46-48页 |
| ·棉纤维中原花色素的检测 | 第48-50页 |
| ·讨论 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第三章 绿色棉与其白色近等基因系的蛋白质组差异分析 | 第53-62页 |
| ·材料与方法 | 第53页 |
| ·植物材料 | 第53页 |
| ·蛋白质的提取、定量及 2-DE 电泳 | 第53页 |
| ·2-DE 凝胶图像分析，蛋白质酶解与质谱鉴定 | 第53页 |
| ·结果与分析 | 第53-60页 |
| ·2-DE 电泳分析 | 第53-56页 |
| ·差异蛋白点的鉴定 | 第56页 |
| ·差异蛋白点的功能分类 | 第56-60页 |
| ·讨论 | 第60-61页 |
| ·本章小结 | 第61-62页 |
| 第四章 21DPA 绿色棉纤维中的蛋白质组成分析 | 第62-77页 |
| ·材料与方法 | 第62页 |
| ·植物材料 | 第62页 |
| ·蛋白质的提取、定量及电泳 | 第62页 |
| ·2-DE 凝胶图像分析 | 第62页 |
| ·蛋白质的酶解和质谱鉴定 | 第62页 |
| ·结果与分析 | 第62-72页 |
| ·21DPA 绿色棉纤维蛋白图谱与蛋白质点的鉴定 | 第62-72页 |
| ·功能分类 | 第72页 |
| ·讨论 | 第72-75页 |
| ·本章小结 | 第75-77页 |
| 第五章 GhANR 基因的克隆及原核表达 | 第77-88页 |
| ·材料与方法 | 第77-79页 |
| ·植物材料 | 第77页 |
| ·菌株、载体和常用分子生物学试剂 | 第77页 |
| ·棉纤维 RNA 的提取 | 第77-78页 |
| ·GhANR 基因的克隆 | 第78页 |
| ·基因序列比对和进化树分析 | 第78页 |
| ·GhANR 蛋白表达载体的构建 | 第78-79页 |
| ·GhANR 蛋白的诱导 | 第79页 |
| ·SDS-PAGE 验证目的蛋白 | 第79页 |
| ·GhANR 酶的活性测定 | 第79页 |
| ·结果与分析 | 第79-86页 |
| ·2D-PAGE 和蛋白测序 | 第79-80页 |
| ·GhANR 基因的克隆与序列分析 | 第80-81页 |
| ·多重序列比对及进化树分析 | 第81-83页 |
| ·GhANR 基因在棉花植株中的表达分析 | 第83-84页 |
| ·GhANR 基因蛋白表达载体的鉴定 | 第84-85页 |
| ·GhANR 蛋白在大肠杆菌中的表达分析 | 第85-86页 |
| ·ANR 活性测定和产物鉴定 | 第86页 |
| ·讨论 | 第86页 |
| ·本章小结 | 第86-88页 |
| 第六章 全文结论和创新点 | 第88-90页 |
| ·主要结论 | 第88页 |
| ·本项目的特色与创新点 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-97页 |
| 附录 | 第97-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 作者简介 | 第103-104页 |
| 导师评阅表 | 第104页 |
