多杀性巴氏杆菌全基因组测序与比较基因组学分析
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-23页 |
| ·微生物基因组学 | 第12-15页 |
| ·微生物基因组学的研究历史 | 第12页 |
| ·微生物基因组测序进展 | 第12-13页 |
| ·微生物基因组测序技术的发展 | 第13-14页 |
| ·微生物基因组学研究的应用 | 第14-15页 |
| ·多杀性巴氏杆菌的研究进展 | 第15-23页 |
| ·多杀性巴氏杆菌的生物学特性与分型 | 第15-16页 |
| ·多杀性巴氏杆菌的流行与危害 | 第16-17页 |
| ·多杀性巴氏杆菌毒力因子的研究进展 | 第17-22页 |
| ·多杀性巴氏杆菌基因组学的研究进展 | 第22-23页 |
| 2 研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 3 材料和方法 | 第24-31页 |
| ·材料 | 第24-25页 |
| ·菌株 | 第24页 |
| ·主要工具酶及试剂 | 第24页 |
| ·主要培养基的配制 | 第24-25页 |
| ·主要仪器与设备 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-31页 |
| ·测序菌株的筛选 | 第25-26页 |
| ·细菌全基因组的提取 | 第26页 |
| ·多杀性巴氏杆菌基因组序列的测定 | 第26-27页 |
| ·多杀性巴氏杆菌完整基因组注释与分析 | 第27-29页 |
| ·多杀巴氏杆菌比较基因组学分析 | 第29-30页 |
| ·多杀性巴氏杆菌基因组进化分析 | 第30-31页 |
| 4 结果与分析 | 第31-51页 |
| ·所测多杀性巴氏杆菌的基本特征 | 第31页 |
| ·所测多杀性巴氏杆菌基因组一般特征 | 第31-40页 |
| ·7株多杀性巴氏杆菌基因组拼接结果初步统计 | 第31页 |
| ·4株多杀性巴氏杆菌全基因组基本特征 | 第31-34页 |
| ·假基因的分析 | 第34页 |
| ·噬菌体相关编码基因 | 第34-39页 |
| ·双组份调控系统 | 第39-40页 |
| ·4 株多杀性巴氏杆菌比较基因组学分析 | 第40-46页 |
| ·核苷酸水平的比较分析 | 第40-44页 |
| ·氨基酸水平的比较分析 | 第44-46页 |
| ·4 株多杀性巴氏杆菌基因组局部区域比较分析 | 第46-50页 |
| ·4 株多杀性巴氏杆菌基因组进化分析 | 第50-51页 |
| 5 讨论 | 第51-54页 |
| ·测序菌株的筛选与基因组测序 | 第51页 |
| ·基因组学与比较基因组学分析 | 第51-52页 |
| ·局部区域比较分析 | 第52-53页 |
| ·下一步工作展望 | 第53-54页 |
| 6 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 附录 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 附表 | 第67-75页 |
