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Bacillus subtilis 168β-1,4-内切木聚糖酶胰蛋白酶抗性的理性设计

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
英文缩略词表第8-12页
前言第12-25页
   ·蛋白质工程简介第12-15页
     ·蛋白质工程的起源与目标第12页
     ·蛋白质工程的研究进展和应用前景第12-14页
     ·蛋白质工程原理和基本操作第14-15页
   ·同源建模、虚拟突变与分子动力学模拟第15-20页
     ·蛋白质结构模拟第15页
     ·同源建模第15-17页
     ·虚拟突变第17页
     ·分子动力学模拟第17-20页
   ·基于生物催化与计算化学的蛋白分子蛋白酶抗性的理性设计第20页
   ·胰蛋白酶及其催化机制第20-21页
   ·木聚糖酶的简介和蛋白质工程第21-24页
     ·木聚糖及木聚糖酶的简介第21-23页
     ·木聚糖酶的蛋白质工程第23-24页
   ·研究背景、意义和实验流程第24-25页
第二章 实验设备、试剂及材料第25-29页
   ·主要仪器设备第25-26页
   ·实验材料第26-29页
     ·菌种及载体第26页
     ·培养基和常用试剂第26-28页
     ·酶类第28页
     ·试剂盒第28页
     ·其它第28-29页
第三章 实验方法第29-42页
   ·胰蛋白酶抗性的理性设计第29-30页
     ·B.subtilis 168 β-1,4-内切木聚糖酶 XynA 三维模型的构建第29页
     ·胰蛋白酶水解位点的查找第29页
     ·候选突变氨基酸残基的确定第29页
     ·更替氨基酸的选择和突变氨基酸组合类型的确定第29-30页
   ·野生型木聚糖酶 XynA 重组菌的构建及重组子的鉴定第30-32页
     ·Bacillus subtilis 168 基因组的提取[63]第30页
     ·XynA 全长基因的扩增第30-31页
     ·@@@a-XynA 重组质粒的构建及转化第31-32页
   ·BL21(DE3)-@@@a-XynA 诱导表达和酶学性质分析第32-35页
     ·XynA 诱导表达条件的探索第32页
     ·SDS-PAGE 检测表达产物第32-33页
     ·XynA 的诱导表达第33页
     ·XynA 的纯化、分析和鉴定第33-34页
     ·XynA 酶学性质分析第34-35页
   ·单点突变体 XynA**重组菌的构建和重组子的鉴定第35-36页
     ·单点突变(**)引物设计第35页
     ·重叠延伸 PCR (over-lap PCR) 法定点突变第35页
     ·XynA**全长基因的获得第35页
     ·PCR 产物纯化回收第35页
     ·@@@a-XynA**重组质粒的构建及转化第35-36页
   ·BL21(DE3)-@@@a-XynA**的诱导表达和酶学性质的分析第36-37页
     ·单点突变体重组质粒转化 BL21(DE3)诱导表达第36页
     ·XynA**的纯化、分析与鉴定第36-37页
     ·XynA**酶学性质分析第37页
   ·两点组合突变体 XynA**/**重组菌的构建和重组子的鉴定第37-39页
     ·两点组合突变(**/**)引物的设计第37页
     ·重叠延伸 PCR (over-lap PCR) 法定点突变第37页
     ·XynA**/**全长基因的获得第37-38页
     ·PCR 产物纯化回收第38页
     ·@@@a-XynA**/**重组质粒的构建及转化第38-39页
   ·BL21(DE3)-@@@a-XynA**/**的诱导表达和酶学性质的分析第39页
     ·两点突变体重组质粒转化 BL21(DE3)诱导表达第39页
     ·XynA**/**的纯化、分析与鉴定第39页
     ·XynA**/**酶学性质分析第39页
   ·突变体 XynA**重组菌的构建和重组子的鉴定第39-41页
     ·突变(**)引物的设计第39-40页
     ·重叠延伸 PCR (over-lap PCR) 法定点突变第40页
     ·XynA**全长基因的获得第40页
     ·PCR 产物纯化回收第40页
     ·@@@a-XynA**重组质粒的构建和转化第40-41页
   ·BL21(DE3)-@@@a-XynA**的诱导表达和酶学性质的分析第41-42页
     ·突变体 XynA**重组质粒转化 BL21(DE3)诱导表达第41页
     ·XynA**的纯化、分析与鉴定第41页
     ·突变体 XynA**酶学性质分析第41-42页
第四章 实验结果第42-50页
   ·胰蛋白酶抗性的理性设计第42-43页
     ·B.subtilis 168 β-1,4-内切木聚糖酶 XynA 三维模型的构建第42页
     ·木聚糖酶 XynA 候选突变位点的选择和突变类型的确定第42页
     ·模拟突变和选择突变体第42-43页
     ·分子动力学模拟评价突变体的稳定性第43页
     ·野生型与突变型的结构比对第43页
   ·野生型 XynA 重组菌的构建及蛋白诱导表达纯化第43-45页
     ·基因组 DNA 的提取第43页
     ·PCR 获得野生型全长基因第43-44页
     ·重组子 pMD18-T-XynA 鉴定及序列测定第44页
     ·重组子@@@a-XynA 的鉴定及测序第44-45页
     ·XynA 诱导表达条件的探索第45页
     ·XynA 的纯化第45页
   ·单点突变体 XynA**重组菌的构建和蛋白诱导表达纯化第45-46页
     ·重叠延伸 PCR 获得单点突变体突变基因第45页
     ·重组子@@@a-XynA**的鉴定及测序第45-46页
     ·改良酶 XynA**的纯化第46页
   ·组合突变体 XynA**/**重组菌的构建和蛋白诱导表达纯化第46-47页
     ·重叠延伸 PCR 获得两点组合突变体突变基因第46页
     ·重组子@@@a-XynA**/**的鉴定及测序第46页
     ·改良酶 XynA**/**的纯化第46-47页
   ·突变体 XynA**重组菌的构建和蛋白诱导表达纯化第47页
     ·重叠延伸 PCR 获得单点突变体突变基因第47页
     ·重组子@@@a-XynA**的鉴定及测序第47页
     ·改良酶 XynA**的纯化第47页
   ·野生型及突变体酶学性质分析第47-50页
     ·最适 pH第47-48页
     ·最适温度第48页
     ·pH 稳定性第48页
     ·温度稳定性第48页
     ·野生型及突变体在胰蛋白酶溶液中的稳定性第48-49页
     ·储藏稳定性第49-50页
第五章 讨论第50-54页
   ·理性设计中突变位点的选择和突变体组合类型的确定第50页
     ·突变位点的选择第50页
     ·突变体组合类型的确定第50页
   ·突变类型与突变体的性质第50-52页
     ·单点突变第50-51页
     ·两点联合突变第51页
     ·内部对照突变第51-52页
   ·重叠延伸 PCR 定点突变第52页
   ·酶的诱导表达与纯化第52-54页
总结与展望第54-55页
参考文献第55-61页
攻读硕士学位期间发表论文及获奖情况第61-62页
致谢第62-63页
特别致谢第63页

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