| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| ·根际土壤与非根际土壤 | 第10页 |
| ·根际概念的提出 | 第10页 |
| ·根际与非根际的区分 | 第10页 |
| ·根际土壤与非根际土壤的比较 | 第10页 |
| ·根际土壤微生物的多样性 | 第10-13页 |
| ·微生物多样性概念 | 第10-11页 |
| ·影响根际土壤微生物多样性的因素 | 第11-12页 |
| ·根际微生物的常见类群 | 第12-13页 |
| ·根际微生物的作用 | 第13-14页 |
| ·固氮作用 | 第13页 |
| ·释放难溶矿质中的营养元素 | 第13页 |
| ·促进腐殖酸的形成 | 第13页 |
| ·污染环境的微生物生物修复 | 第13-14页 |
| ·提高植物抗逆性 | 第14页 |
| ·土壤微生物多样性研究方法 | 第14-16页 |
| ·微生物平板培养方法 | 第14-15页 |
| ·BIOLOG 微平板方法 | 第15页 |
| ·脂肪酸分析方法 | 第15页 |
| ·分子生物学方法 | 第15-16页 |
| ·国内外研究进展 | 第16-19页 |
| ·本研究的目的意义 | 第19-22页 |
| ·研究内容 | 第19-20页 |
| ·目的与意义 | 第20-21页 |
| ·技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 材料与方法 | 第22-32页 |
| ·试验材料 | 第22页 |
| ·土壤样品 | 第22页 |
| ·PCR 引物 | 第22页 |
| ·菌株与质粒 | 第22页 |
| ·试剂 | 第22页 |
| ·主要仪器设备 | 第22-23页 |
| ·分析软件 | 第23页 |
| ·试验方法 | 第23-30页 |
| ·土壤样品处理 | 第23页 |
| ·水稻土土壤微生物总DNA 提取 | 第23-25页 |
| ·细菌 16S rDNA 片段的 PCR 扩增及纯化回收 | 第25页 |
| ·氨氧化细菌特异性 16S rDNA 片段 PCR 扩增及纯化回收 | 第25-26页 |
| ·PCR 产物的连接转化及克隆文库的构建 | 第26-27页 |
| ·菌落PCR | 第27-28页 |
| ·酶切及检测 | 第28页 |
| ·克隆文库的RFLP 分析 | 第28页 |
| ·群落多样性分析 | 第28-29页 |
| ·核酸序列分析 | 第29-30页 |
| ·常用溶液和培养基的配制 | 第30-32页 |
| ·常用溶液 | 第30-31页 |
| ·电泳胶 | 第31页 |
| ·培养基 | 第31-32页 |
| 第三章 结果与分析 | 第32-57页 |
| ·水稻土土壤微生物总DNA 提取 | 第32页 |
| ·细菌 16S rDNA 片段的扩增 | 第32页 |
| ·氨氧化细菌 16S rDNA 片段的扩增 | 第32-33页 |
| ·细菌和氨氧化细菌克隆文库的菌落PCR | 第33页 |
| ·细菌 16S rDNA 片段的 Hha I 和 Rsa I 酶切 | 第33-39页 |
| ·细菌RFLP 分析 | 第39-44页 |
| ·细菌RFLP 类型统计 | 第39-40页 |
| ·细菌RFLP 酶切类型聚类分析 | 第40-43页 |
| ·水稻根际土和非根际土优势细菌种群酶切类型聚类分析 | 第43-44页 |
| ·水稻根际土和非根际土细菌的多样性指数比较 | 第44页 |
| ·限制性内切酶 Hha I 和 Rsa I 酶切氨氧化细菌 16S rDNA 片段 | 第44-49页 |
| ·氨氧化细菌RFLP 分析 | 第49-55页 |
| ·氨氧化细菌RFLP 类型统计 | 第49-51页 |
| ·氨氧化细菌RFLP 酶切类型聚类分析 | 第51页 |
| ·水稻根际土和非根际土优势氨氧化细菌种群酶切类型聚类分析 | 第51页 |
| ·水稻根际土和非根际土氨氧化细菌的多样性指数比较 | 第51-55页 |
| ·氨氧化细菌优势克隆 16S rDNA 系统发育分析 | 第55-57页 |
| ·测序结果比对 | 第55页 |
| ·系统发育树的构建与遗传关系分析 | 第55-57页 |
| 第四章 讨论 | 第57-64页 |
| ·土壤总DNA 的提取与纯化 | 第57-58页 |
| ·细菌和氨氧化细菌 16S rDNA 片段扩增 | 第58页 |
| ·细菌和氨氧化细菌 16S rDNA 片段克隆文库的构建 | 第58-59页 |
| ·水稻根际土和非根际土细菌的多样性指数比较 | 第59-60页 |
| ·水稻根际土和非根际土的细菌类型分析 | 第60-61页 |
| ·水稻根际土和非根际土氨氧化细菌的群落结构比较 | 第61-62页 |
| ·根际水稻土氨氧化细菌优势种群 16S rDNA 的系统发育分析 | 第62-64页 |
| 第五章 结论与展望 | 第64-67页 |
| ·结论 | 第64-65页 |
| ·研究特色 | 第65页 |
| ·研究展望 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-74页 |
| 附录 | 第74-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简介 | 第78页 |
