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福建漳江口秋茄红树植物种群遗传结构及繁育系统研究

摘要第12-14页
ABSTRACT第14-15页
第一章 前言第17-29页
    1、植物种群的小尺度遗传结构及繁育系统第17-22页
        1.1 遗传多样性和遗传分化第17-18页
        1.2 繁育系统第18页
        1.3 基因流第18页
        1.4 小尺度的空间遗传结构第18-19页
        1.5 植物种群的小尺度遗传结构及繁育系统的相关研究进展第19-22页
            1.5.1 遗传多样性和遗传分化第19-20页
            1.5.2 繁育系统第20-21页
            1.5.3 基因流第21页
            1.5.4 小尺度空间遗传结构第21-22页
    2、SSR分子标记技术第22-24页
        2.1 DNA分子标记技术第22-23页
        2.2 本研究用到的分子标记第23-24页
    3、秋茄(Kandelia obovata)第24-27页
        3.1 秋茄的生物学特性第24-26页
        3.2 秋茄的遗传结构、繁育系统等相关研究进展第26-27页
    4、本研究的内容、目的及意义第27-29页
第二章 材料和方法第29-41页
    1、研究地点第29-31页
    2、实验仪器和试剂第31-32页
        2.1 仪器第31页
        2.2 试剂第31-32页
    3、试验方法第32-41页
        3.1 群落特征调查第32-33页
        3.2 SSR分子标记研究第33-38页
            3.2.1 基因组DNA的提取和鉴定第33-34页
            3.2.2 PCR反应体系的建立第34-37页
            3.2.3 荧光毛细管电泳检测PCR扩增产物第37-38页
        3.4 数据处理和分析第38-41页
            3.4.1 种群遗传多样性分析第38页
            3.4.2 等位基因丰富度分析第38页
            3.4.3 种群遗传分化分析第38页
            3.4.4 繁育系统分析第38-39页
            3.4.5 亲本分析第39页
            3.4.6 空间遗传结果分析第39-40页
            3.4.7 瓶颈效应分析第40页
            3.4.8 STRUCTURE分析第40页
            3.4.9 单倍型分析第40-41页
第三章 结果与分析第41-85页
    1、群落特征第41-42页
    2、SSR-PCR第42-45页
        2.1 基因组DNA的提取第42-43页
        2.2 SSR-PCR产物的鉴定第43-45页
    3、种群遗传结构及分化结果第45-85页
        3.1 Hardy-Weinberg平衡检验,无效等位基因频率第45-47页
        3.2 遗传多样性第47-53页
            3.2.1 整体遗传多样性第47-50页
            3.2.2 不同年龄阶段遗传多样性第50-51页
            3.2.3 等位基因丰富度第51-53页
        3.3 遗传分化第53-60页
            3.3.1 AMOVA分析第53页
            3.3.2 Nei's遗传距离分析第53-54页
            3.3.3 主成分分析(PCA)第54页
            3.3.4 Weir & Cockerham的遗传分化显著性第54-55页
            3.3.5 STRUCTURE分析第55-57页
            3.3.6 F统计量分析和基因流(Nm)的估计第57-60页
            3.3.7 瓶颈效应分析第60页
        3.4 繁育系统第60-61页
        3.5 亲本分析第61-73页
            3.5.1 亲本分析的遗传信息第61-63页
            3.5.2 花粉的传播距离第63-68页
            3.5.3 幼苗的亲本分析第68-72页
            3.5.4 幼树的扩散距离第72-73页
        3.6 空间遗传结构研究第73-80页
            3.6.1 小尺度空间遗传结构分析第73-77页
            3.6.2 基于空间遗传结构分析的基因流第77-80页
        3.7 单倍型分析第80-85页
第四章 讨论第85-93页
    1、Hardy-Weinberg equilibrium(HWE)第85页
    2、遗传多样性分析第85-87页
    3、繁育系统第87-88页
    4、花粉流及种子流第88-89页
        4.1 花粉流第88-89页
        4.2 种子流第89页
    5、小尺度空间遗传结构第89-91页
    6、结论第91-93页
参考文献第93-106页
致谢第106-108页
硕士期间拟发表论文第108-109页
附录第109页

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